转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 64 / 149 下载 TSV

上一页 64 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G001080 Chr05 NC_080391.1:8981244-8981254promoter 内 330-340 bp + 3661 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 8975976-8977583(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTAT
SmilChr02G002670 Chr02 NC_080388.1:46277381-46277391promoter 内 326-336 bp + 3665 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 46281056-46282147(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CATAGCTGTCA
SmilChr02G002294 Chr02 NC_080388.1:40460939-40460949promoter 内 307-317 bp - 3684 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 40464633-40465469(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTAT
SmilChr05G001169 Chr05 NC_080391.1:9794808-9794818promoter 内 244-254 bp + 3747 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 9798565-9802629(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CATAGCTGTCA
SmilChr03G003852 Chr03 NC_080389.1:57643370-57643380promoter 内 242-252 bp + 3749 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 57637603-57639621(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCTT
SmilChr02G000778 Chr02 NC_080388.1:12737861-12737871promoter 内 236-246 bp + 3755 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 12732393-12734106(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTAT
SmilChr03G001198 Chr03 NC_080389.1:13810620-13810630promoter 内 177-187 bp - 3814 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 13814444-13815013(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTCGA
SmilChr03G004523 Chr03 NC_080389.1:63283155-63283165promoter 内 150-160 bp - 3841 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 63287006-63289063(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATG
SmilChr06G000701 Chr06 NC_080392.1:6255836-6255846promoter 内 147-157 bp + 3844 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 6259690-6267015(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACAAGCTGTCC
SmilChr04G002662 Chr04 NC_080390.1:42028012-42028022promoter 内 67-77 bp + 3924 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 42023639-42024088(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATG
SmilChr04G000562 Chr04 NC_080390.1:6265458-6265468promoter 内 49-59 bp + 3942 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 6269410-6273765(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACAAGCTGTCC
SmilChr03G002581 Chr03 NC_080389.1:41078512-41078522promoter 内 34-44 bp + 3957 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 41073099-41074555(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTCGA
SmilChr07G002699 Chr07 NC_080393.1:26333177-26333187promoter 内 27-37 bp - 3964 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 26327640-26329213(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CATAGCTGTCA
SmilChr01G001635 Chr01 NC_080387.1:30394497-30394507promoter 内 11-21 bp - 3980 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 30398487-30404790(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTAT
SmilChr03G004478 Chr03 NC_080389.1:62890385-62890395promoter 内 3049-3059 bp - 942 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 62888347-62889443(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCTAGCTGTCG
SmilChr02G004914 Chr02 NC_080388.1:71123988-71123998promoter 内 1682-1692 bp - 2309 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 71126307-71126386(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTAGC
SmilChr03G004479 Chr03 NC_080389.1:62890385-62890395promoter 内 1368-1378 bp - 2623 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 62893018-62895721(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTAGC
SmilChr02G000189 Chr02 NC_080388.1:2358081-2358091promoter 内 1113-1123 bp + 2878 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 2360969-2364496(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCT
SmilChr01G000785 Chr01 NC_080387.1:17063365-17063375promoter 内 736-746 bp + 3255 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 17066630-17072528(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCTAGCTGTCG
SmilChr02G004915 Chr02 NC_080388.1:71123988-71123998promoter 内 702-712 bp - 3289 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 71127287-71131478(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTAGC
SmilChr06G002278 Chr06 NC_080392.1:32671445-32671455promoter 内 3792-3802 bp - 199 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 32671654-32673118(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTCGT
SmilChr06G002307 Chr06 NC_080392.1:33301754-33301764promoter 内 3756-3766 bp - 235 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 33301999-33302712(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTAGC
SmilChr05G001507 Chr05 NC_080391.1:13825511-13825521promoter 内 3361-3371 bp - 630 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 13826151-13826253(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTCGT
SmilChr01G005077 Chr01 NC_080387.1:68649943-68649953promoter 内 3344-3354 bp + 647 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 68650600-68652457(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCT
SmilChr04G000093 Chr04 NC_080390.1:828686-828696promoter 内 3219-3229 bp - 772 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 827786-827914(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCT
SmilChr04G000658 Chr04 NC_080390.1:7437012-7437022promoter 内 3176-3186 bp - 815 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 7437837-7443944(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTGG
SmilChr03G004468 Chr03 NC_080389.1:62759907-62759917promoter 内 3069-3079 bp - 922 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 62756420-62758985(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCTAGCTGTCG
SmilChr01G001174 Chr01 NC_080387.1:23797830-23797840promoter 内 2926-2936 bp + 1065 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 23798905-23802993(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCT
SmilChr02G005382 Chr02 NC_080388.1:74490580-74490590promoter 内 2639-2649 bp + 1352 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 74486327-74489228(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTGG
SmilChr02G000209 Chr02 NC_080388.1:2747204-2747214promoter 内 2499-2509 bp - 1492 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 2743985-2745712(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACGAGCTGTCC
SmilChr06G001218 Chr06 NC_080392.1:12566213-12566223promoter 内 2308-2318 bp + 1683 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 12562911-12564530(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTAGC
SmilChr02G002405 Chr02 NC_080388.1:41965917-41965927promoter 内 1874-1884 bp + 2117 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 41968044-41971926(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACGAGCTGTCC
SmilChr03G003740 Chr03 NC_080389.1:56456710-56456720promoter 内 1866-1876 bp - 2125 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 56458845-56460661(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTGG
SmilChr05G003097 Chr05 NC_080391.1:39386256-39386266promoter 内 1854-1864 bp - 2137 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 39388403-39389928(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTGG
SmilChr03G004045 Chr03 NC_080389.1:59438886-59438896promoter 内 1336-1346 bp - 2655 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 59432094-59436231(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCT
SmilChr05G000427 Chr05 NC_080391.1:3220440-3220450promoter 内 1221-1231 bp + 2770 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 3212662-3217670(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTCGT
SmilChr04G004162 Chr04 NC_080390.1:56292574-56292584promoter 内 1127-1137 bp - 2864 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 56295448-56299479(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTGG
SmilChr01G001170 Chr01 NC_080387.1:23797830-23797840promoter 内 1111-1121 bp + 2880 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 23750700-23794950(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTGG
SmilChr01G001832 Chr01 NC_080387.1:33272756-33272766promoter 内 1046-1056 bp + 2945 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 33275711-33280501(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCTAGCTGTCG
SmilChr03G001230 Chr03 NC_080389.1:14197646-14197656promoter 内 967-977 bp - 3024 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 14200680-14200786(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTGG
SmilChr05G002536 Chr05 NC_080391.1:28313544-28313554promoter 内 727-737 bp + 3264 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 28304812-28310280(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTGG
SmilChr01G001949 Chr01 NC_080387.1:34716703-34716713promoter 内 189-199 bp + 3802 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 34720515-34720586(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCT
SmilChr05G003139 Chr05 NC_080391.1:40008958-40008968promoter 内 1767-1777 bp - 2224 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 6 40004677-40006734(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCGAGCTGTCT
SmilChr05G003140 Chr05 NC_080391.1:40009265-40009275promoter 内 1493-1503 bp - 2498 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 6 40011773-40022714(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTCGG
SmilChr02G000128 Chr02 NC_080388.1:1751439-1751449promoter 内 2211-2221 bp + 1780 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 1745405-1749659(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCAGA
SmilChr02G000159 Chr02 NC_080388.1:2064063-2064073promoter 内 1944-1954 bp - 2047 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 2061494-2062016(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCTAGCTGTCG
SmilChr03G004069 Chr03 NC_080389.1:59673023-59673033promoter 内 1465-1475 bp + 2526 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 59662715-59670497(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCAT
SmilChr02G001254 Chr02 NC_080388.1:23027936-23027946promoter 内 1324-1334 bp - 2667 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 23030613-23031678(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTCGG
SmilChr02G000129 Chr02 NC_080388.1:1751439-1751449promoter 内 1031-1041 bp + 2960 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 1754409-1755279(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCTGGCTGTCA
SmilChr03G000337 Chr03 NC_080389.1:3817398-3817408promoter 内 599-609 bp - 3392 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 3820800-3827343(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCAT