Red Sage Omics 丹参基因组信息平台
首页 基因查询 ID 对照表 功能注释 结构域预测 Pfam 基因组工具 蛋白互作 亚细胞定位 表达量 共表达 同源/共线性 GO/KEGG 注释 TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变 JBrowse BLAST 下载 关于 帮助
数据资源
ID 对照表 功能注释 功能检索 次生代谢专题 文献证据 结构域预测 Pfam 同源/共线性
分析工具
基因组工具 引物设计 同源重组引物设计 核酸翻译 BLAST 蛋白互作 亚细胞定位 共表达 GO/KEGG 注释 功能检索
调控/突变
TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变
帮助
关于 帮助 资源与版本
中文 EN

转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。

预计算阈值必须与当前索引一致。非法、未支持或需四舍五入的输入会报错；页面与下载均不会自动切换阈值。

257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因，每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G005433; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00021978-RA_Salv SmilChr02G005433 WRKY XP_057792682.1 MP00209 CGTTGACTTTTTTTAACAT

可能结合的靶基因

9910 个结合位点 8083 个候选靶基因 第 68 / 162 下载 TSV

上一页 68 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr07G003303 Chr07 NC_080393.1:34968677-34968695promoter 内 3912-3930 bp + 71 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 34967905-34968606(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GACATTTCCAAAGTCAAAG
SmilChr01G005737 Chr01 NC_080387.1:73496331-73496349promoter 内 3896-3914 bp + 87 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 73496436-73501008(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 AGTTGACTTAGACTTGACT
SmilChr06G000967 Chr06 NC_080392.1:9397278-9397296promoter 内 3894-3912 bp - 89 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 9397385-9401885(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 ACATTGGAAAAAGTCAACC
SmilChr08G002776 Chr08 NC_080394.1:27477261-27477279promoter 内 3877-3895 bp + 106 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 27477385-27477960(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CGTTGACTTCCAACGGTAT
SmilChr05G003836 Chr05 NC_080391.1:51811738-51811756promoter 内 3828-3846 bp - 155 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 51811911-51812653(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 AATTTCTCTCGAGTCAACG
SmilChr04G002928 Chr04 NC_080390.1:45545349-45545367promoter 内 3817-3835 bp + 166 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 45545533-45546438(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CGTTGACTATCAATATAAA
SmilChr08G000039 Chr08 NC_080394.1:265707-265725promoter 内 3809-3827 bp - 174 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 263971-265533(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CGTTGACCTAAGAAAAAAA
SmilChr03G000910 Chr03 NC_080389.1:10430731-10430749promoter 内 3791-3809 bp - 192 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 10430941-10432728(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GCCCTCACTCAAGTCAACA
SmilChr03G002656 Chr03 NC_080389.1:42237052-42237070promoter 内 3791-3809 bp - 192 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 42237262-42237342(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CAACCTATCAAAGTCAACC
SmilChr07G002259 Chr07 NC_080393.1:20793454-20793472promoter 内 3778-3796 bp - 205 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 20792285-20793249(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CGTTGACTTCCTCCTTATG
SmilChr05G002511 Chr05 NC_080391.1:27869805-27869823promoter 内 3717-3735 bp + 266 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 27869027-27869539(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CTAACTCCGCCAGTCAACG
SmilChr05G002540 Chr05 NC_080391.1:28350422-28350440promoter 内 3716-3734 bp - 267 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 28350707-28351219(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CTAACTCCGCCAGTCAACG
SmilChr08G000111 Chr08 NC_080394.1:700752-700770promoter 内 3716-3734 bp - 267 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 701037-704287(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CCGGTAGCTCAAGTCAACT
SmilChr03G002084 Chr03 NC_080389.1:32052133-32052151promoter 内 3680-3698 bp + 303 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 32052454-32055245(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GGTTGACTATGACTACGTG
SmilChr02G005044 Chr02 NC_080388.1:72151828-72151846promoter 内 3661-3679 bp - 322 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 72152168-72164421(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CATGATTAAAAGGTCAACG
SmilChr04G004159 Chr04 NC_080390.1:56274300-56274318promoter 内 3641-3659 bp + 342 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 56274660-56278615(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TGTTGACTTGTGTTGTTGT
SmilChr02G001675 Chr02 NC_080388.1:31002687-31002705promoter 内 3640-3658 bp + 343 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 30999605-31002344(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GAAGTGGTCATAGTCAACT
SmilChr03G000463 Chr03 NC_080389.1:4957616-4957634promoter 内 3588-3606 bp - 395 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 4952720-4957221(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GGTTGACTTTCGATTAAAC
SmilChr04G002898 Chr04 NC_080390.1:45268360-45268378promoter 内 3587-3605 bp - 396 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 45266190-45267964(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TGTTGACTCGGATGAACCT
SmilChr05G004044 Chr05 NC_080391.1:54409034-54409052promoter 内 3585-3603 bp - 398 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 54407526-54408636(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CGTTGACTAATATGTCTAT
SmilChr02G002001 Chr02 NC_080388.1:36163608-36163626promoter 内 3578-3596 bp + 405 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 36164031-36167642(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 AGTTGACTCTCTCTCTCTC
SmilChr06G000050 Chr06 NC_080392.1:410826-410844promoter 内 3565-3583 bp + 418 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 408241-410408(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CACCCAATCCGAGTCAACT
SmilChr08G001710 Chr08 NC_080394.1:14307964-14307982promoter 内 3535-3553 bp - 448 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 14308430-14310308(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 AAGGAAAAAAAAGTCAACA
SmilChr06G002828 Chr06 NC_080392.1:41049697-41049715promoter 内 3527-3545 bp + 456 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 41048896-41049241(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CGGCTTCTGCTGGTCAACG
SmilChr05G001874 Chr05 NC_080391.1:18961960-18961978promoter 内 3485-3503 bp + 498 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 18959891-18961462(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TGAAGTCCGATAGTCAACG
SmilChr08G002023 Chr08 NC_080394.1:18034823-18034841promoter 内 3479-3497 bp - 504 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 18035345-18038200(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 AGAGCAGCAGCAGTCAACT
SmilChr07G002296 Chr07 NC_080393.1:21252403-21252421promoter 内 3477-3495 bp + 506 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 21250101-21251897(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 ACTTCAACAATAGTCAACA
SmilChr05G002360 Chr05 NC_080391.1:25641181-25641199promoter 内 3372-3390 bp + 611 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 25639558-25640570(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 ATTAAGGTTATGGTCAACG
SmilChr01G005985 Chr01 NC_080387.1:75484898-75484916promoter 内 3353-3371 bp - 630 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 75482810-75484268(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 AGTTGACTCAGGTCTATCA
SmilChr02G003461 Chr02 NC_080388.1:55900652-55900670promoter 内 3336-3354 bp + 647 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 55901317-55907160(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 AGTTGACTCTTCTTATGCT
SmilChr02G003918 Chr02 NC_080388.1:61272860-61272878promoter 内 3312-3330 bp + 671 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 61266207-61272189(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CGGATATTCCAAGTCAACT
SmilChr06G001584 Chr06 NC_080392.1:17277406-17277424promoter 内 3310-3328 bp + 673 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 17278097-17283063(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GGTTGACTTGCTCGATCAT
SmilChr08G002462 Chr08 NC_080394.1:23451344-23451362promoter 内 3301-3319 bp + 682 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 23443044-23450662(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TGGCGGTAAGCAGTCAACG
SmilChr01G005698 Chr01 NC_080387.1:73243691-73243709promoter 内 3268-3286 bp + 715 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 73244424-73246790(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 AGTTGACTTTGCCTACAAT
SmilChr05G003702 Chr05 NC_080391.1:50111943-50111961promoter 内 3209-3227 bp - 774 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 50112735-50115205(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GTCTTTGGAAGAGTCAACT
SmilChr02G004290 Chr02 NC_080388.1:65225581-65225599promoter 内 3164-3182 bp - 819 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 65223581-65224762(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CGTTGACTCACTTCCCGTA
SmilChr04G001123 Chr04 NC_080390.1:16281444-16281462promoter 内 3130-3148 bp - 853 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 16282315-16283636(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CAGAACCCGTGAGTCAACG
SmilChr02G002131 Chr02 NC_080388.1:38152208-38152226promoter 内 3010-3028 bp + 973 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 38153199-38200690(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TGTTGACTTGAGCAATTCC
SmilChr02G004072 Chr02 NC_080388.1:63008177-63008195promoter 内 2977-2995 bp + 1006 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 63005876-63007171(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CCTAAGGTGATGGTCAACG
SmilChr03G003919 Chr03 NC_080389.1:58287272-58287290promoter 内 2927-2945 bp - 1056 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 58283199-58286216(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TGTTGACTCTGGGGAAGCT
SmilChr06G000561 Chr06 NC_080392.1:4787767-4787785promoter 内 2830-2848 bp + 1153 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 4783392-4786614(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TTTTTGTTCCTGGTCAACG
SmilChr07G002168 Chr07 NC_080393.1:19867313-19867331promoter 内 2814-2832 bp - 1169 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 19865119-19866144(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CGTTGACTAACGGAGTTAA
SmilChr01G006096 Chr01 NC_080387.1:76428124-76428142promoter 内 2811-2829 bp + 1172 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 76429314-76437730(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 AGTTGACTTAGACTTGACT
SmilChr01G005222 Chr01 NC_080387.1:69773706-69773724promoter 内 2804-2822 bp + 1179 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 69769582-69772527(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GACTAAACTCGAGTCAACT
SmilChr07G000372 Chr07 NC_080393.1:2529778-2529796promoter 内 2786-2804 bp + 1197 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 2530993-2534845(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 AGTTGACTTCTGCTGGAAT
SmilChr04G000274 Chr04 NC_080390.1:2527635-2527653promoter 内 2776-2794 bp - 1207 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 2528860-2529789(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 ATAGAAGACCAAGTCAACT
SmilChr07G002585 Chr07 NC_080393.1:24729928-24729946promoter 内 2768-2786 bp - 1215 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 24724410-24728713(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CGTTGACCATCATCTTAAA
SmilChr01G003014 Chr01 NC_080387.1:49171523-49171541promoter 内 2760-2778 bp - 1223 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 49172764-49176736(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CGTCTTATCAAAGTCAACT
SmilChr04G002821 Chr04 NC_080390.1:44268393-44268411promoter 内 2702-2720 bp - 1281 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 44266637-44267112(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 AGTTGACTTTTTTAGATTA
SmilChr02G001334 Chr02 NC_080388.1:24803966-24803984promoter 内 2696-2714 bp + 1287 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 24805271-24808516(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CGTTGACCACATCCATGAG