转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004199; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00010571-RA_Salv SmilChr01G004199 bHLH XP_057782208.1 MP00074 AGAAGGTCACGTGG

可能结合的靶基因

9969 个结合位点 7396 个候选靶基因 第 69 / 148 下载 TSV

上一页 69 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G000587 Chr05 NC_080391.1:4439215-4439228promoter 内 720-733 bp - 3268 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 4442496-4444238(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCTGATC
SmilChr06G002782 Chr06 NC_080392.1:40497784-40497797promoter 内 692-705 bp - 3296 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 40501093-40503339(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAATCTTC
SmilChr04G001015 Chr04 NC_080390.1:14133396-14133409promoter 内 578-591 bp + 3410 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 14136819-14138438(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AACCAGGCACGTGG
SmilChr03G003999 Chr03 NC_080389.1:59037543-59037556promoter 内 575-588 bp + 3413 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 59031020-59034130(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGATATGAC
SmilChr01G000604 Chr01 NC_080387.1:13155196-13155209promoter 内 491-504 bp + 3497 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 13148705-13151699(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAAACAAC
SmilChr04G000049 Chr04 NC_080390.1:442234-442247promoter 内 470-483 bp - 3518 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 445765-452720(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCCAATT
SmilChr01G004407 Chr01 NC_080387.1:62160454-62160467promoter 内 370-383 bp - 3618 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 62164085-62166532(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCTCTCTC
SmilChr06G000961 Chr06 NC_080392.1:9306445-9306458promoter 内 325-338 bp + 3663 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 9300779-9302782(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCTGATC
SmilChr03G003531 Chr03 NC_080389.1:53917245-53917258promoter 内 317-330 bp + 3671 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 53912837-53913574(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCTGGTA
SmilChr01G002831 Chr01 NC_080387.1:46923260-46923273promoter 内 251-264 bp + 3737 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 46909817-46919523(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGACGACTC
SmilChr01G002401 Chr01 NC_080387.1:41353539-41353552promoter 内 249-262 bp + 3739 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 41357291-41358965(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GACGTTGCACGTGG
SmilChr06G001369 Chr06 NC_080392.1:14318753-14318766promoter 内 227-240 bp - 3761 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 14322527-14329787(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCTATTC
SmilChr01G002192 Chr01 NC_080387.1:38058905-38058918promoter 内 201-214 bp + 3787 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 38062705-38063397(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TTAGTGTCACGTGT
SmilChr02G003849 Chr02 NC_080388.1:60239498-60239511promoter 内 108-121 bp - 3880 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 60233021-60235618(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGGTGAGCACGTGG
SmilChr05G001085 Chr05 NC_080391.1:9025315-9025328promoter 内 3650-3663 bp - 338 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 3 9025666-9036993(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCAAAAC
SmilChr07G004510 Chr07 NC_080393.1:57752819-57752832promoter 内 3558-3571 bp + 430 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 3 57751022-57752389(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGAGATGCA
SmilChr03G002902 Chr03 NC_080389.1:45774694-45774707promoter 内 3006-3019 bp + 982 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 3 45768550-45773712(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGACATCTA
SmilChr02G003797 Chr02 NC_080388.1:59609190-59609203promoter 内 3931-3944 bp - 57 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 59607839-59609133(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGGCCTCCACGTGG
SmilChr02G003769 Chr02 NC_080388.1:59389239-59389252promoter 内 3927-3940 bp - 61 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 59387920-59389178(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGGCCTCCACGTGG
SmilChr06G003227 Chr06 NC_080392.1:45018279-45018292promoter 内 3252-3265 bp - 736 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 45016293-45017543(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGTGGAGCACGTGG
SmilChr03G003097 Chr03 NC_080389.1:48017221-48017234promoter 内 3070-3083 bp - 918 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 48018152-48026537(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGACATCTA
SmilChr01G002447 Chr01 NC_080387.1:42064573-42064586promoter 内 2763-2776 bp - 1225 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 42058999-42063348(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGTATTTCACGTGG
SmilChr04G002693 Chr04 NC_080390.1:42343653-42343666promoter 内 2674-2687 bp + 1314 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 42338177-42342339(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCGTTTTC
SmilChr02G003768 Chr02 NC_080388.1:59389239-59389252promoter 内 2236-2249 bp - 1752 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 59384811-59387487(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGGCCTCCACGTGG
SmilChr07G000364 Chr07 NC_080393.1:2496235-2496248promoter 内 2221-2234 bp + 1767 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 2498015-2500329(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CGTGATTCACGTGG
SmilChr02G003796 Chr02 NC_080388.1:59609190-59609203promoter 内 2188-2201 bp - 1800 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 59604815-59607390(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGGCCTCCACGTGG
SmilChr05G002028 Chr05 NC_080391.1:21062622-21062635promoter 内 2099-2112 bp - 1889 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 21064524-21068807(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCTGGAG
SmilChr01G004549 Chr01 NC_080387.1:63612817-63612830promoter 内 1953-1966 bp - 2035 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 63608236-63610782(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGCAACTCACGTGT
SmilChr04G001096 Chr04 NC_080390.1:15682257-15682270promoter 内 1769-1782 bp - 2219 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 15677664-15680038(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTCTTCTCACGTGG
SmilChr07G004509 Chr07 NC_080393.1:57752819-57752832promoter 内 1641-1654 bp + 2347 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 57749489-57750472(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGAGATGCA
SmilChr05G002750 Chr05 NC_080391.1:31726781-31726794promoter 内 1366-1379 bp - 2622 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 31722956-31724159(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTCTTCTCACGTGG
SmilChr06G001080 Chr06 NC_080392.1:10750624-10750637promoter 内 1274-1287 bp - 2714 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 10753351-10754692(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGAGATGCA
SmilChr06G001892 Chr06 NC_080392.1:22632327-22632340promoter 内 1076-1089 bp - 2912 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 22635252-22645011(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGAGGTTCG
SmilChr05G000223 Chr05 NC_080391.1:1744956-1744969promoter 内 556-569 bp - 3432 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 1738801-1741524(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGTAATTCACGTGG
SmilChr01G004360 Chr01 NC_080387.1:61794277-61794290promoter 内 432-445 bp + 3556 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 61789442-61790721(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCAAAAC
SmilChr04G003708 Chr04 NC_080390.1:53395625-53395638promoter 内 333-346 bp + 3655 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 53399293-53401585(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGCCGATCACGTGC
SmilChr01G003303 Chr01 NC_080387.1:51722799-51722812promoter 内 252-265 bp - 3736 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 51711980-51719063(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TTGGCCTCACGTGA
SmilChr07G004601 Chr07 NC_080393.1:58824388-58824401promoter 内 164-177 bp - 3824 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 58818492-58820564(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGTAATTCACGTGG
SmilChr02G003770 Chr02 NC_080388.1:59389239-59389252promoter 内 130-143 bp - 3858 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 59393110-59398775(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGAGGCCT
SmilChr02G000930 Chr02 NC_080388.1:16205006-16205019promoter 内 3960-3973 bp - 28 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 16205047-16214520(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTACTTAT
SmilChr01G001963 Chr01 NC_080387.1:34963156-34963169promoter 内 3859-3872 bp + 129 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 34961171-34963027(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCCAAAAC
SmilChr06G000224 Chr06 NC_080392.1:2050454-2050467promoter 内 3782-3795 bp - 206 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 1499006-2050248(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCTCCTCACGTGC
SmilChr01G000492 Chr01 NC_080387.1:9976045-9976058promoter 内 3722-3735 bp + 266 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 9972478-9975779(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAGAAGAC
SmilChr08G000106 Chr08 NC_080394.1:654337-654350promoter 内 3421-3434 bp + 567 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 648931-653770(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGAGACTCT
SmilChr05G001140 Chr05 NC_080391.1:9532387-9532400promoter 内 3290-3303 bp - 698 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 9529481-9531689(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGAAGACCACGTGG
SmilChr02G003936 Chr02 NC_080388.1:61436721-61436734promoter 内 3269-3282 bp + 719 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 61434867-61436002(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAAACACG
SmilChr04G001292 Chr04 NC_080390.1:20581079-20581092promoter 内 3202-3215 bp - 786 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 20581878-20584922(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGACGAGTA
SmilChr03G001256 Chr03 NC_080389.1:14485603-14485616promoter 内 3166-3179 bp - 822 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 14483713-14484781(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CGGAATCCACGTGG
SmilChr01G000601 Chr01 NC_080387.1:13069369-13069382promoter 内 3132-3145 bp + 856 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 13065988-13068513(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGATCCACT
SmilChr04G001289 Chr04 NC_080390.1:20565308-20565321promoter 内 2833-2846 bp - 1155 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 20566476-20567639(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGACGAGTA