转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 70 / 143 下载 TSV

上一页 70 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G004097 Chr04 NC_080390.1:55955826-55955837promoter 内 534-545 bp - 3456 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 55951584-55952370(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTCAA
SmilChr03G002696 Chr03 NC_080389.1:42955640-42955651promoter 内 506-517 bp - 3484 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 42950361-42952156(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTCAA
SmilChr03G001318 Chr03 NC_080389.1:15457092-15457103promoter 内 489-500 bp + 3501 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 15452950-15453591(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTAAT
SmilChr08G003015 Chr08 NC_080394.1:30273338-30273349promoter 内 450-461 bp + 3540 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 30276889-30277928(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTCTT
SmilChr03G002601 Chr03 NC_080389.1:41297807-41297818promoter 内 426-437 bp - 3564 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 41301382-41303904(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTAAA
SmilChr07G004264 Chr07 NC_080393.1:55052943-55052954promoter 内 417-428 bp - 3573 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 55056527-55060392(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCTAGCTGTCTC
SmilChr01G001206 Chr01 NC_080387.1:24277578-24277589promoter 内 399-410 bp + 3591 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 24281180-24282600(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGACAGCTATT
SmilChr02G002132 Chr02 NC_080388.1:38286188-38286199promoter 内 392-403 bp - 3598 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 38275997-38282590(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTCTG
SmilChr08G000280 Chr08 NC_080394.1:1923436-1923447promoter 内 392-403 bp + 3598 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 1914538-1919838(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTAAA
SmilChr03G001997 Chr03 NC_080389.1:29649594-29649605promoter 内 360-371 bp + 3630 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 29653235-29657533(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTCTA
SmilChr06G001075 Chr06 NC_080392.1:10647794-10647805promoter 内 347-358 bp - 3643 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 10651448-10655456(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTAGCTGTCAA
SmilChr07G003076 Chr07 NC_080393.1:32393544-32393555promoter 内 347-358 bp + 3643 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 32397198-32399342(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTCGA
SmilChr01G002312 Chr01 NC_080387.1:40114864-40114875promoter 内 285-296 bp - 3705 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 40109167-40111159(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTACAGCTGAT
SmilChr07G000303 Chr07 NC_080393.1:1991069-1991080promoter 内 221-232 bp + 3769 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 1994849-1998318(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTAAT
SmilChr03G004075 Chr03 NC_080389.1:59705883-59705894promoter 内 213-224 bp - 3777 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 59699018-59702106(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTACAGCTGAT
SmilChr03G000696 Chr03 NC_080389.1:7773140-7773151promoter 内 156-167 bp - 3834 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 7763238-7769306(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTCTG
SmilChr01G003432 Chr01 NC_080387.1:52957273-52957284promoter 内 149-160 bp + 3841 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 52952881-52953432(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGAGCTGTCGG
SmilChr07G001483 Chr07 NC_080393.1:11669410-11669421promoter 内 140-151 bp - 3850 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 11673271-11674896(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCGA
SmilChr07G004253 Chr07 NC_080393.1:54977150-54977161promoter 内 73-84 bp + 3917 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 54969555-54973233(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCTAGCTGTCTC
SmilChr01G001974 Chr01 NC_080387.1:35160935-35160946promoter 内 56-67 bp - 3934 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 35154693-35157001(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTAAT
SmilChr04G003176 Chr04 NC_080390.1:48444698-48444709promoter 内 48-59 bp + 3942 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 48437990-48440756(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCGG
SmilChr04G001551 Chr04 NC_080390.1:25684801-25684812promoter 内 34-45 bp - 3956 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 25688768-25694071(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTAAA
SmilChr02G004056 Chr02 NC_080388.1:62875233-62875244promoter 内 1354-1365 bp + 2636 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 62877880-62878834(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTGAG
SmilChr05G001015 Chr05 NC_080391.1:8319354-8319365promoter 内 513-524 bp - 3477 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 8313665-8315877(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTCCAGCTGTG
SmilChr03G004459 Chr03 NC_080389.1:62680062-62680073promoter 内 3927-3938 bp + 63 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 62679200-62679999(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCTC
SmilChr03G004313 Chr03 NC_080389.1:61503902-61503913promoter 内 3870-3881 bp + 120 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 61498912-61503782(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCTC
SmilChr04G002987 Chr04 NC_080390.1:46292687-46292698promoter 内 3806-3817 bp + 184 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 46286743-46292503(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGAGCTGTCCA
SmilChr05G001195 Chr05 NC_080391.1:10040689-10040700promoter 内 3670-3681 bp + 320 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 10041020-10043793(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTCCAGCTGTG
SmilChr01G005598 Chr01 NC_080387.1:72590826-72590837promoter 内 3538-3549 bp - 452 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 72589418-72590374(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTCTT
SmilChr03G004500 Chr03 NC_080389.1:63123111-63123122promoter 内 3497-3508 bp + 493 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 63120016-63122618(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCTC
SmilChr07G000112 Chr07 NC_080393.1:626888-626899promoter 内 3474-3485 bp - 516 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 622943-626372(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTCCAGCTGTG
SmilChr03G004369 Chr03 NC_080389.1:61893180-61893191promoter 内 3355-3366 bp - 635 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 61893826-61897206(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCTC
SmilChr03G004402 Chr03 NC_080389.1:62201432-62201443promoter 内 3355-3366 bp - 635 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 62202078-62204871(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCTC
SmilChr03G004317 Chr03 NC_080389.1:61527567-61527578promoter 内 3336-3347 bp + 654 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 61528232-62709468(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTCTT
SmilChr06G000100 Chr06 NC_080392.1:711426-711437promoter 内 3312-3323 bp + 678 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 712115-714846(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTCGG
SmilChr03G004405 Chr03 NC_080389.1:62220183-62220194promoter 内 3096-3107 bp - 894 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 62221088-62224231(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCTC
SmilChr02G000547 Chr02 NC_080388.1:7587877-7587888promoter 内 3031-3042 bp + 959 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 7580826-7586918(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCTC
SmilChr08G001581 Chr08 NC_080394.1:13049017-13049028promoter 内 2761-2772 bp - 1229 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 13043982-13047788(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTATC
SmilChr01G001071 Chr01 NC_080387.1:22099897-22099908promoter 内 2758-2769 bp + 1232 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 22101140-22111815(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTATC
SmilChr02G001269 Chr02 NC_080388.1:23248757-23248768promoter 内 2612-2623 bp - 1378 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 23246512-23247379(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTGAG
SmilChr03G004509 Chr03 NC_080389.1:63181321-63181332promoter 内 2547-2558 bp + 1443 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 63176058-63179878(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCTC
SmilChr02G000517 Chr02 NC_080388.1:7146824-7146835promoter 内 2436-2447 bp + 1554 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 7143063-7145270(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCTC
SmilChr01G005597 Chr01 NC_080387.1:72590826-72590837promoter 内 2341-2352 bp - 1649 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 72585811-72589177(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTCTT
SmilChr06G000563 Chr06 NC_080392.1:4799317-4799328promoter 内 2319-2330 bp - 1671 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 4800999-4802517(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTCTG
SmilChr06G000564 Chr06 NC_080392.1:4799317-4799328promoter 内 2307-2318 bp - 1683 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 4801011-4801113(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTCTG
SmilChr03G004502 Chr03 NC_080389.1:63123111-63123122promoter 内 1925-1936 bp + 2065 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 63125187-63126134(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTCTT
SmilChr05G003616 Chr05 NC_080391.1:48289744-48289755promoter 内 1779-1790 bp + 2211 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 48291966-48295838(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTCCAGCTGTG
SmilChr03G004354 Chr03 NC_080389.1:61773343-61773354promoter 内 1655-1666 bp - 2335 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 61769014-61771008(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTCTT
SmilChr08G003413 Chr08 NC_080394.1:36258666-36258677promoter 内 1511-1522 bp + 2479 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 36254074-36256187(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGAGCTGTCCT
SmilChr07G002693 Chr07 NC_080393.1:26269552-26269563promoter 内 1459-1470 bp - 2531 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 26264626-26267021(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTCCAGCTGTG