转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 70 / 149 下载 TSV

上一页 70 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G004137 Chr04 NC_080390.1:56175592-56175602promoter 内 1735-1745 bp - 2256 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 3 56171864-56173336(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTGGGCTGTCA
SmilChr07G002654 Chr07 NC_080393.1:25710102-25710112promoter 内 1654-1664 bp - 2337 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 3 25706172-25707765(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGCCA
SmilChr02G001319 Chr02 NC_080388.1:24529284-24529294promoter 内 1600-1610 bp - 2391 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 3 24525910-24526893(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTGGGCTGTCA
SmilChr04G001206 Chr04 NC_080390.1:18658065-18658075promoter 内 1533-1543 bp + 2458 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 3 18660533-18661421(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCT
SmilChr01G000268 Chr01 NC_080387.1:5189904-5189914promoter 内 1455-1465 bp + 2536 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 3 5192450-5194560(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCT
SmilChr06G001884 Chr06 NC_080392.1:22480926-22480936promoter 内 1390-1400 bp + 2601 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 3 22483537-22505151(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCT
SmilChr02G001053 Chr02 NC_080388.1:18777857-18777867promoter 内 1186-1196 bp + 2805 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 3 18780672-18786763(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCT
SmilChr01G000223 Chr01 NC_080387.1:3958889-3958899promoter 内 856-866 bp + 3135 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 3 3953812-3955754(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGTA
SmilChr02G001052 Chr02 NC_080388.1:18777857-18777867promoter 内 795-805 bp + 3196 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 3 18772030-18774661(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGTA
SmilChr01G000224 Chr01 NC_080387.1:3977549-3977559promoter 内 657-667 bp + 3334 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 3 3980893-3981438(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCT
SmilChr02G001302 Chr02 NC_080388.1:24165475-24165485promoter 内 263-273 bp + 3728 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 3 24159815-24161747(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTTA
SmilChr06G001304 Chr06 NC_080392.1:13566834-13566844promoter 内 3984-3994 bp - 7 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 13562726-13566827(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGCCA
SmilChr02G001412 Chr02 NC_080388.1:26757158-26757168promoter 内 3954-3964 bp - 37 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 26752421-26757121(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TAAGGCTGTCA
SmilChr01G004533 Chr01 NC_080387.1:63500276-63500286promoter 内 3893-3903 bp - 98 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 63495354-63500178(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCT
SmilChr07G000326 Chr07 NC_080393.1:2226300-2226310promoter 内 3760-3770 bp + 231 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 2220627-2226069(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCAC
SmilChr07G002708 Chr07 NC_080393.1:26475724-26475734promoter 内 3713-3723 bp - 278 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 26466911-26475446(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGCCA
SmilChr01G004109 Chr01 NC_080387.1:59600532-59600542promoter 内 3549-3559 bp + 442 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 59600984-59603871(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCT
SmilChr02G001282 Chr02 NC_080388.1:23646462-23646472promoter 内 3334-3344 bp + 657 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 23644815-23645805(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTCTC
SmilChr05G001706 Chr05 NC_080391.1:16295203-16295213promoter 内 3180-3190 bp - 811 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 16296024-16296868(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGTA
SmilChr02G002788 Chr02 NC_080388.1:47947175-47947185promoter 内 3047-3057 bp + 944 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 47945171-47946231(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTAG
SmilChr05G003999 Chr05 NC_080391.1:53873811-53873821promoter 内 3019-3029 bp + 972 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 53870814-53872839(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGAG
SmilChr06G001178 Chr06 NC_080392.1:12000084-12000094promoter 内 3006-3016 bp + 985 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 11982009-11999099(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCAC
SmilChr06G002587 Chr06 NC_080392.1:37077495-37077505promoter 内 2862-2872 bp + 1129 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 37075459-37076366(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGTA
SmilChr02G005386 Chr02 NC_080388.1:74515625-74515635promoter 内 2851-2861 bp + 1140 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 74512208-74514485(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTGT
SmilChr01G005588 Chr01 NC_080387.1:72557622-72557632promoter 内 2796-2806 bp + 1195 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 72554953-72556427(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTTA
SmilChr06G002144 Chr06 NC_080392.1:29121800-29121810promoter 内 2779-2789 bp - 1212 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 29123022-29125299(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTTA
SmilChr01G001219 Chr01 NC_080387.1:24470136-24470146promoter 内 2641-2651 bp - 1350 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 24471496-24475714(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATT
SmilChr03G001823 Chr03 NC_080389.1:24949783-24949793promoter 内 2598-2608 bp + 1393 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 24946586-24948390(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTTA
SmilChr01G005185 Chr01 NC_080387.1:69567889-69567899promoter 内 2559-2569 bp + 1432 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 69569331-69575575(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCT
SmilChr02G005396 Chr02 NC_080388.1:74548203-74548213promoter 内 2542-2552 bp + 1449 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 74549662-74551166(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACAAGCTGTCT
SmilChr03G002555 Chr03 NC_080389.1:40725307-40725317promoter 内 2457-2467 bp + 1534 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 40726851-40729666(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACAAGCTGTCT
SmilChr03G004088 Chr03 NC_080389.1:59780850-59780860promoter 内 2420-2430 bp + 1571 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 59775918-59779279(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTAG
SmilChr06G001035 Chr06 NC_080392.1:10271805-10271815promoter 内 2014-2024 bp - 1977 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 10269755-10269828(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TAAGGCTGTCA
SmilChr05G000351 Chr05 NC_080391.1:2634349-2634359promoter 内 1982-1992 bp + 2009 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 2630799-2632340(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGAG
SmilChr06G001034 Chr06 NC_080392.1:10271805-10271815promoter 内 1948-1958 bp - 2043 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 10267852-10269762(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TAAGGCTGTCA
SmilChr06G000764 Chr06 NC_080392.1:7122468-7122478promoter 内 1861-1871 bp - 2130 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 7109058-7120338(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCT
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SmilChr02G002826 Chr02 NC_080388.1:48367162-48367172promoter 内 1691-1701 bp + 2300 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 48358381-48364862(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTTA
SmilChr04G002905 Chr04 NC_080390.1:45326804-45326814promoter 内 1681-1691 bp + 2310 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 45323556-45324494(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGTA
SmilChr01G001626 Chr01 NC_080387.1:30337541-30337551promoter 内 1602-1612 bp + 2389 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 30334013-30335152(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTAG
SmilChr04G001316 Chr04 NC_080390.1:21080441-21080451promoter 内 1570-1580 bp - 2421 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 21082872-21088011(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTTA
SmilChr03G002168 Chr03 NC_080389.1:33726076-33726086promoter 内 1327-1337 bp - 2664 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 33722564-33723412(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCT
SmilChr03G000199 Chr03 NC_080389.1:2263527-2263537promoter 内 1181-1191 bp - 2810 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 2266347-2275551(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATT
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SmilChr04G001181 Chr04 NC_080390.1:17911658-17911668promoter 内 951-961 bp - 3040 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 17914708-17915253(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGTA
SmilChr05G000353 Chr05 NC_080391.1:2634349-2634359promoter 内 896-906 bp + 3095 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 2637454-2639308(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCAGCTGTCT
SmilChr07G002254 Chr07 NC_080393.1:20719062-20719072promoter 内 654-664 bp - 3337 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 20714064-20715725(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCT
SmilChr06G000894 Chr06 NC_080392.1:8453230-8453240promoter 内 636-646 bp + 3355 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 8445897-8449875(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGTA
SmilChr01G000187 Chr01 NC_080387.1:3188702-3188712promoter 内 611-621 bp + 3380 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 3183053-3185322(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGTA