转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 71 / 149 下载 TSV

上一页 71 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr06G002453 Chr06 NC_080392.1:35313151-35313161promoter 内 566-576 bp - 3425 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 35316586-35319706(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGTA
SmilChr01G001974 Chr01 NC_080387.1:35160430-35160440promoter 内 562-572 bp + 3429 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 35154693-35157001(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTGT
SmilChr05G003998 Chr05 NC_080391.1:53873811-53873821promoter 内 487-497 bp + 3504 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 53869692-53870307(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGAG
SmilChr05G001019 Chr05 NC_080391.1:8362373-8362383promoter 内 417-427 bp + 3574 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 8356817-8358799(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGGCAGCTGGG
SmilChr06G001012 Chr06 NC_080392.1:10004062-10004072promoter 内 309-319 bp + 3682 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 9998499-10000380(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGTA
SmilChr03G000681 Chr03 NC_080389.1:7597889-7597899promoter 内 278-288 bp + 3713 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 7601612-7614503(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCT
SmilChr07G002885 Chr07 NC_080393.1:29098498-29098508promoter 内 215-225 bp + 3776 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 29102284-29102733(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCT
SmilChr05G000653 Chr05 NC_080391.1:4928070-4928080promoter 内 3985-3995 bp + 6 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 4928086-4928156(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TAAGGCTGTCA
SmilChr02G000154 Chr02 NC_080388.1:2020689-2020699promoter 内 3937-3947 bp + 54 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 2018728-2020635(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATT
SmilChr03G002296 Chr03 NC_080389.1:36156891-36156901promoter 内 3912-3922 bp + 79 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 36156980-36160773(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGCCA
SmilChr01G003861 Chr01 NC_080387.1:56878770-56878780promoter 内 3911-3921 bp - 80 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 56878860-56881340(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGGCAGCTGGG
SmilChr01G004857 Chr01 NC_080387.1:66739717-66739727promoter 内 3886-3896 bp - 105 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 66736214-66739612(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGCCA
SmilChr05G003268 Chr05 NC_080391.1:42326362-42326372promoter 内 3835-3845 bp + 156 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 42325292-42326206(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTAG
SmilChr02G004081 Chr02 NC_080388.1:63092164-63092174promoter 内 3793-3803 bp + 198 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 63092372-63096688(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACAAGCTGTCT
SmilChr01G003860 Chr01 NC_080387.1:56878770-56878780promoter 内 3768-3778 bp - 223 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 56874432-56878547(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGCCA
SmilChr01G003859 Chr01 NC_080387.1:56872306-56872316promoter 内 3767-3777 bp - 224 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 56867968-56872082(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGCCA
SmilChr03G002574 Chr03 NC_080389.1:40959800-40959810promoter 内 3734-3744 bp - 257 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 40957815-40959543(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGCCA
SmilChr07G000327 Chr07 NC_080393.1:2226300-2226310promoter 内 3685-3695 bp + 306 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 2226616-2232780(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTGGGCTGTCA
SmilChr07G002690 Chr07 NC_080393.1:26256035-26256045promoter 内 3638-3648 bp - 353 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 26256398-26257794(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTCTC
SmilChr04G004021 Chr04 NC_080390.1:55448184-55448194promoter 内 3630-3640 bp - 361 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 55448555-55454161(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTGT
SmilChr01G001031 Chr01 NC_080387.1:21475161-21475171promoter 内 3573-3583 bp - 418 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 21469046-21474743(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGCCA
SmilChr07G000441 Chr07 NC_080393.1:3086661-3086671promoter 内 3566-3576 bp + 425 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 3083628-3086236(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGAG
SmilChr03G002363 Chr03 NC_080389.1:37272166-37272176promoter 内 3519-3529 bp - 472 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 37268295-37271694(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGCCA
SmilChr02G003239 Chr02 NC_080388.1:53662898-53662908promoter 内 3457-3467 bp - 534 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 53663442-53668441(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTTG
SmilChr05G002125 Chr05 NC_080391.1:22327272-22327282promoter 内 3456-3466 bp + 535 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 22327817-22331050(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGCCA
SmilChr02G001148 Chr02 NC_080388.1:20881701-20881711promoter 内 3449-3459 bp - 542 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 20878858-20881159(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTAGGCTGTCA
SmilChr02G002466 Chr02 NC_080388.1:43014696-43014706promoter 内 3448-3458 bp + 543 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 43015249-43018157(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGCCA
SmilChr02G002465 Chr02 NC_080388.1:43008875-43008885promoter 内 3447-3457 bp + 544 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 43009429-43013088(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGCCA
SmilChr07G001060 Chr07 NC_080393.1:7815365-7815375promoter 内 3395-3405 bp + 596 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 7813277-7814769(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGGCAGCTGGG
SmilChr04G003654 Chr04 NC_080390.1:53030210-53030220promoter 内 3387-3397 bp - 604 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 53028888-53029606(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACAAGCTGTCT
SmilChr05G001723 Chr05 NC_080391.1:16500814-16500824promoter 内 3385-3395 bp - 606 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 16501430-16503046(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTCTC
SmilChr03G001926 Chr03 NC_080389.1:27022027-27022037promoter 内 3379-3389 bp - 612 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 27018285-27021415(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGCCA
SmilChr06G000302 Chr06 NC_080392.1:2175943-2175953promoter 内 3309-3319 bp + 682 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 2176635-2183150(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTGGGCTGTCA
SmilChr02G005499 Chr02 NC_080388.1:75139461-75139471promoter 内 3267-3277 bp - 724 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 75140195-75145256(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTTA
SmilChr03G004537 Chr03 NC_080389.1:63399416-63399426promoter 内 3261-3271 bp - 730 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 63397902-63398686(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AATAGCTGTCA
SmilChr04G003441 Chr04 NC_080390.1:50939224-50939234promoter 内 3179-3189 bp + 812 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 50935472-50938412(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTTG
SmilChr06G000993 Chr06 NC_080392.1:9809832-9809842promoter 内 3120-3130 bp + 871 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 9810713-9813662(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AATAGCTGTCA
SmilChr01G004675 Chr01 NC_080387.1:64845712-64845722promoter 内 3105-3115 bp - 886 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 64846608-64849641(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCAC
SmilChr01G000028 Chr01 NC_080387.1:543279-543289promoter 内 3076-3086 bp + 915 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 541403-542364(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATT
SmilChr02G004309 Chr02 NC_080388.1:65460646-65460656promoter 内 3068-3078 bp + 923 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 65461579-65465385(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAAAGCTGTCG
SmilChr04G001707 Chr04 NC_080390.1:28201317-28201327promoter 内 3066-3076 bp + 925 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 28202252-28203307(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCAGCTGTCT
SmilChr04G002725 Chr04 NC_080390.1:42860515-42860525promoter 内 2994-3004 bp - 997 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 42853277-42859518(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AATAGCTGTCA
SmilChr05G002310 Chr05 NC_080391.1:24939892-24939902promoter 内 2969-2979 bp + 1022 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 24936549-24938870(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTAG
SmilChr03G001499 Chr03 NC_080389.1:18324233-18324243promoter 内 2947-2957 bp + 1044 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 18325287-18328025(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TAAGGCTGTCA
SmilChr01G004880 Chr01 NC_080387.1:66889480-66889490promoter 内 2899-2909 bp + 1092 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 66884000-66888388(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGAG
SmilChr05G001029 Chr05 NC_080391.1:8443943-8443953promoter 内 2893-2903 bp + 1098 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 8445051-8448787(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACAAGCTGTCT
SmilChr01G002766 Chr01 NC_080387.1:46057476-46057486promoter 内 2856-2866 bp - 1135 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 46051009-46056341(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AATAGCTGTCA
SmilChr06G002615 Chr06 NC_080392.1:37624157-37624167promoter 内 2841-2851 bp - 1150 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 37625317-37631093(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATT
SmilChr03G003948 Chr03 NC_080389.1:58535277-58535287promoter 内 2826-2836 bp + 1165 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 58531954-58534112(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCAC
SmilChr07G001325 Chr07 NC_080393.1:10192492-10192502promoter 内 2785-2795 bp + 1206 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 10184553-10191286(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTAG