Red Sage Omics 丹参基因组信息平台
首页 基因查询 ID 对照表 功能注释 结构域预测 Pfam 基因组工具 蛋白互作 亚细胞定位 表达量 共表达 同源/共线性 GO/KEGG 注释 TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变 JBrowse BLAST 下载 关于 帮助
数据资源
ID 对照表 功能注释 功能检索 次生代谢专题 文献证据 结构域预测 Pfam 同源/共线性
分析工具
基因组工具 引物设计 同源重组引物设计 核酸翻译 BLAST 蛋白互作 亚细胞定位 共表达 GO/KEGG 注释 功能检索
调控/突变
TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变
帮助
关于 帮助 资源与版本
中文 EN

转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr03G004518; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00009629-RA_Salv SmilChr03G004518 ERF XP_057799834.1 MP00529 CTCCACCGACAAAAT

可能结合的靶基因

9247 个结合位点 7559 个候选靶基因 第 73 / 152 下载 TSV

上一页 73 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr06G000725 Chr06 NC_080392.1:6681699-6681713promoter 内 3162-3176 bp - 825 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 3 6682538-6705928(+) SMil_00009629-RA_Salv MP00529 AGGATGGCGGTGGAG
SmilChr05G002294 Chr05 NC_080391.1:24772738-24772752promoter 内 2424-2438 bp + 1563 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 3 24774315-24776394(+) SMil_00009629-RA_Salv MP00529 ACCCACCGACGGACA
SmilChr05G004303 Chr05 NC_080391.1:56726335-56726349promoter 内 2277-2291 bp + 1710 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 3 56728059-56731931(+) SMil_00009629-RA_Salv MP00529 ACCCACCGACGGACA
SmilChr04G000275 Chr04 NC_080390.1:2535683-2535697promoter 内 1960-1974 bp - 2027 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 3 2533575-2533656(-) SMil_00009629-RA_Salv MP00529 CTCCACCGCCGGCAG
SmilChr08G001225 Chr08 NC_080394.1:9896523-9896537promoter 内 1109-1123 bp - 2878 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 3 9892300-9893645(-) SMil_00009629-RA_Salv MP00529 ACCCACCGACGGACA
SmilChr01G004377 Chr01 NC_080387.1:61967680-61967694promoter 内 524-538 bp - 3463 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 3 61971157-61977289(+) SMil_00009629-RA_Salv MP00529 AGGATGGCGGTGGAG
SmilChr01G000025 Chr01 NC_080387.1:461714-461728promoter 内 393-407 bp + 3594 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 3 452475-458120(-) SMil_00009629-RA_Salv MP00529 TGCCTGTCGGTGATG
SmilChr07G004657 Chr07 NC_080393.1:59499131-59499145promoter 内 73-87 bp + 3914 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 3 59493645-59495217(-) SMil_00009629-RA_Salv MP00529 TGTCCGTCGGTGGGT
SmilChr08G003851 Chr08 NC_080394.1:45031867-45031881promoter 内 3916-3930 bp + 71 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 45031952-45034403(+) SMil_00009629-RA_Salv MP00529 CTCCACCGCCGCGAT
SmilChr08G003525 Chr08 NC_080394.1:37855857-37855871promoter 内 3631-3645 bp + 356 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 37853067-37855501(-) SMil_00009629-RA_Salv MP00529 AGGATGGCGGTGGAG
SmilChr02G002122 Chr02 NC_080388.1:37997121-37997135promoter 内 3595-3609 bp - 392 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 37997527-38000094(+) SMil_00009629-RA_Salv MP00529 GGGGCGGCGGTGGAA
SmilChr01G003806 Chr01 NC_080387.1:56449151-56449165promoter 内 2910-2924 bp - 1077 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 56446152-56448074(-) SMil_00009629-RA_Salv MP00529 CTCCACCGCCATCCT
SmilChr04G000934 Chr04 NC_080390.1:12186572-12186586promoter 内 2635-2649 bp - 1352 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 12183339-12185220(-) SMil_00009629-RA_Salv MP00529 GTCCACCGCCGCCGT
SmilChr06G000407 Chr06 NC_080392.1:3330856-3330870promoter 内 2441-2455 bp - 1546 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 3326864-3329310(-) SMil_00009629-RA_Salv MP00529 CTCCACCGCCGTCGT
SmilChr08G003554 Chr08 NC_080394.1:38197029-38197043promoter 内 1867-1881 bp + 2120 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 38199163-38201868(+) SMil_00009629-RA_Salv MP00529 CGACACCGACGAGGG
SmilChr02G003985 Chr02 NC_080388.1:62110992-62111006promoter 内 1633-1647 bp + 2354 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 62105829-62108638(-) SMil_00009629-RA_Salv MP00529 TTCTTGTCGGTGACC
SmilChr07G002622 Chr07 NC_080393.1:25288032-25288046promoter 内 1514-1528 bp - 2473 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 25282843-25285559(-) SMil_00009629-RA_Salv MP00529 CTCCACCGCCATCCT
SmilChr08G002513 Chr08 NC_080394.1:24280765-24280779promoter 内 1383-1397 bp - 2604 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 24283383-24287177(+) SMil_00009629-RA_Salv MP00529 GTGGAGTCGGTGGCT
SmilChr03G001235 Chr03 NC_080389.1:14263448-14263462promoter 内 1270-1284 bp - 2717 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 14266179-14266935(+) SMil_00009629-RA_Salv MP00529 GGGGCGGCGGTGGAA
SmilChr03G000349 Chr03 NC_080389.1:3923543-3923557promoter 内 1234-1248 bp + 2753 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 3919408-3920790(-) SMil_00009629-RA_Salv MP00529 AGGATGGCGGTGGAG
SmilChr03G000350 Chr03 NC_080389.1:3923543-3923557promoter 内 815-829 bp + 3172 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 3926729-3927735(+) SMil_00009629-RA_Salv MP00529 CTCCACCGCCATCCT
SmilChr05G001840 Chr05 NC_080391.1:18459095-18459109promoter 内 731-745 bp - 3256 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 18462365-18467725(+) SMil_00009629-RA_Salv MP00529 AATGTGGCGGTGGAC
SmilChr08G004517 Chr08 NC_080394.1:54786044-54786058promoter 内 726-740 bp + 3261 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 54777871-54782783(-) SMil_00009629-RA_Salv MP00529 TCTTTGTCGGTAGGA
SmilChr02G002123 Chr02 NC_080388.1:37997121-37997135promoter 内 608-622 bp - 3379 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 38000514-38005590(+) SMil_00009629-RA_Salv MP00529 GGGGCGGCGGTGGAA
SmilChr03G001352 Chr03 NC_080389.1:15776727-15776741promoter 内 429-443 bp - 3558 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 15780299-15782533(+) SMil_00009629-RA_Salv MP00529 GGGGCGGCGGTGGAA
SmilChr07G001965 Chr07 NC_080393.1:17176230-17176244promoter 内 408-422 bp - 3579 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 17179823-17179904(+) SMil_00009629-RA_Salv MP00529 GCGTTGTCGGTATCG
SmilChr05G002952 Chr05 NC_080391.1:35637918-35637932promoter 内 182-196 bp + 3805 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 35641737-35653228(+) SMil_00009629-RA_Salv MP00529 CTACACCGACGAAGT
SmilChr03G002499 Chr03 NC_080389.1:39814524-39814538promoter 内 165-179 bp - 3822 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 39808289-39810702(-) SMil_00009629-RA_Salv MP00529 CCTTACCGACACCAA
SmilChr07G000203 Chr07 NC_080393.1:1288075-1288089promoter 内 3974-3988 bp - 13 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 1284978-1288062(-) SMil_00009629-RA_Salv MP00529 TCCTACCGACAAAGA
SmilChr06G001574 Chr06 NC_080392.1:17196314-17196328promoter 内 3941-3955 bp + 46 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 17196374-17199286(+) SMil_00009629-RA_Salv MP00529 GTTCACCGACAAATA
SmilChr07G000274 Chr07 NC_080393.1:1779124-1779138promoter 内 3923-3937 bp + 64 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 1779202-1782438(+) SMil_00009629-RA_Salv MP00529 TCCTACCGACAAAGA
SmilChr07G000196 Chr07 NC_080393.1:1233158-1233172promoter 内 3896-3910 bp - 91 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 1230491-1233067(-) SMil_00009629-RA_Salv MP00529 TCCTACCGACAAAGA
SmilChr08G004523 Chr08 NC_080394.1:54798022-54798036promoter 内 3895-3909 bp + 92 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 54798128-54800689(+) SMil_00009629-RA_Salv MP00529 TCCTACCGACAAAGA
SmilChr07G000264 Chr07 NC_080393.1:1720433-1720447promoter 内 3782-3796 bp + 205 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 1712569-1720228(-) SMil_00009629-RA_Salv MP00529 TCTTTGTCGGTAGGA
SmilChr04G001225 Chr04 NC_080390.1:19159833-19159847promoter 内 3752-3766 bp - 235 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 19160082-19170028(+) SMil_00009629-RA_Salv MP00529 ACGACGGCGGTGGAG
SmilChr01G004592 Chr01 NC_080387.1:63921058-63921072promoter 内 3624-3638 bp + 363 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 63921435-63922453(+) SMil_00009629-RA_Salv MP00529 TATCACCGACAAAAA
SmilChr01G004187 Chr01 NC_080387.1:60296477-60296491promoter 内 3595-3609 bp + 392 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 60296883-60301401(+) SMil_00009629-RA_Salv MP00529 ACGCACCGACAACAA
SmilChr05G001846 Chr05 NC_080391.1:18489467-18489481promoter 内 3569-3583 bp + 418 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 18486971-18489049(-) SMil_00009629-RA_Salv MP00529 GGGGCGGCGGTGGAA
SmilChr02G000513 Chr02 NC_080388.1:7076804-7076818promoter 内 3563-3577 bp - 424 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 7077242-7081611(+) SMil_00009629-RA_Salv MP00529 GAGGCGTCGGTGCTC
SmilChr03G000335 Chr03 NC_080389.1:3812546-3812560promoter 内 3550-3564 bp + 437 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 3797148-3812109(-) SMil_00009629-RA_Salv MP00529 AAGTTGTCGGTCGAG
SmilChr03G001732 Chr03 NC_080389.1:23282540-23282554promoter 内 3364-3378 bp + 623 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 23281811-23281917(-) SMil_00009629-RA_Salv MP00529 TTGTTGTCGGTAGCT
SmilChr06G001311 Chr06 NC_080392.1:13597445-13597459promoter 内 3329-3343 bp + 658 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 13598117-13604810(+) SMil_00009629-RA_Salv MP00529 TATCACCGACAAAAA
SmilChr05G002012 Chr05 NC_080391.1:20834624-20834638promoter 内 3246-3260 bp - 741 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 20835379-20836400(+) SMil_00009629-RA_Salv MP00529 AAAGTGGCGGTGGAC
SmilChr07G001017 Chr07 NC_080393.1:7385363-7385377promoter 内 3186-3200 bp - 801 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 7386178-7389248(+) SMil_00009629-RA_Salv MP00529 GGGGCGGCGGTGGAA
SmilChr01G002842 Chr01 NC_080387.1:46987686-46987700promoter 内 3171-3185 bp - 816 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 46988516-46992084(+) SMil_00009629-RA_Salv MP00529 GTATTGTCGGTAAAG
SmilChr01G003048 Chr01 NC_080387.1:49450073-49450087promoter 内 3171-3185 bp - 816 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 49450903-49452158(+) SMil_00009629-RA_Salv MP00529 AAAACGTCGGTGGAT
SmilChr07G001122 Chr07 NC_080393.1:8402821-8402835promoter 内 3108-3122 bp + 879 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 8348773-8401942(-) SMil_00009629-RA_Salv MP00529 AAAGTGGCGGTGGAC
SmilChr04G002580 Chr04 NC_080390.1:41172331-41172345promoter 内 3078-3092 bp - 909 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 41167175-41171422(-) SMil_00009629-RA_Salv MP00529 CTCCACCGCCGTCGT
SmilChr02G002625 Chr02 NC_080388.1:45596901-45596915promoter 内 3050-3064 bp + 937 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 45591927-45595964(-) SMil_00009629-RA_Salv MP00529 GGTTTGGCGGTGGAT
SmilChr07G001658 Chr07 NC_080393.1:14046292-14046306promoter 内 3044-3058 bp + 943 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 14041642-14045349(-) SMil_00009629-RA_Salv MP00529 AAAGTGGCGGTGGAC