转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G002743; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00022510-RA_Salv SmilChr01G002743 MYB_related XP_057765725.1 MP00565 AACCTTATCCATAAA

可能结合的靶基因

9785 个结合位点 7412 个候选靶基因 第 76 / 149 下载 TSV

上一页 76 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G001330 Chr03 NC_080389.1:15546645-15546659promoter 内 1986-2000 bp - 2001 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 15544519-15544644(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AAAATTATCCATTTA
SmilChr03G004704 Chr03 NC_080389.1:64331411-64331425promoter 内 1957-1971 bp + 2030 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 64333455-64336742(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATCCTTATCCCAAAA
SmilChr02G001565 Chr02 NC_080388.1:28965274-28965288promoter 内 1921-1935 bp + 2066 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 28967354-28969139(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AAGATTATCCAAACA
SmilChr03G002167 Chr03 NC_080389.1:33715334-33715348promoter 内 1906-1920 bp + 2081 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 33707549-33713253(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AAAATGGATAAAATA
SmilChr02G001085 Chr02 NC_080388.1:19448689-19448703promoter 内 1823-1837 bp + 2164 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 19444271-19446525(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AGTATGGATAACACT
SmilChr03G004512 Chr03 NC_080389.1:63194352-63194366promoter 内 1818-1832 bp - 2169 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 63189498-63192183(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AGTGTTATCCATACT
SmilChr02G003220 Chr02 NC_080388.1:53426631-53426645promoter 内 1815-1829 bp + 2172 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 53422811-53424459(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TGTATGGATAATAAT
SmilChr01G004855 Chr01 NC_080387.1:66729140-66729154promoter 内 1791-1805 bp + 2196 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 66731350-66734673(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GCCATTATCCATATC
SmilChr02G002414 Chr02 NC_080388.1:42120266-42120280promoter 内 1759-1773 bp - 2228 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 42113950-42118038(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AAAGTTATCCAAAAT
SmilChr03G000273 Chr03 NC_080389.1:3120887-3120901promoter 内 1748-1762 bp + 2239 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 3115970-3118648(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GGAATGGATAAAATA
SmilChr03G003142 Chr03 NC_080389.1:48635194-48635208promoter 内 1746-1760 bp - 2241 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 48631919-48632953(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ACCCCTATCCATATG
SmilChr02G005247 Chr02 NC_080388.1:73614504-73614518promoter 内 1712-1726 bp - 2275 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 73616793-73625585(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AAATTGGATAATAAT
SmilChr01G001677 Chr01 NC_080387.1:30966225-30966239promoter 内 1640-1654 bp - 2347 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 30962534-30963878(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GCCCTTATCCATTGC
SmilChr01G002303 Chr01 NC_080387.1:39903237-39903251promoter 内 1635-1649 bp - 2352 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 39892365-39900885(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TGTATTATCCATATA
SmilChr01G006124 Chr01 NC_080387.1:76753438-76753452promoter 内 1631-1645 bp + 2356 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 76750274-76751082(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GGAATGGATAAAATA
SmilChr01G005614 Chr01 NC_080387.1:72670285-72670299promoter 内 1611-1625 bp - 2376 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 72666111-72667909(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AAACTTATCCTCTAG
SmilChr02G000164 Chr02 NC_080388.1:2135202-2135216promoter 内 1611-1625 bp - 2376 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 2130772-2132826(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 CATTTTATCCATTTC
SmilChr04G002560 Chr04 NC_080390.1:40905023-40905037promoter 内 1605-1619 bp + 2382 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 40907419-40910282(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AAACTTATCCGATAT
SmilChr02G004261 Chr02 NC_080388.1:64818935-64818949promoter 内 1524-1538 bp - 2463 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 64821412-64823701(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GCTATGGATAAAATT
SmilChr03G004491 Chr03 NC_080389.1:63032965-63032979promoter 内 1345-1359 bp + 2642 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 63027925-63030323(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GGATTGGATAATATC
SmilChr01G002404 Chr01 NC_080387.1:41393247-41393261promoter 内 1341-1355 bp + 2646 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 41395907-41396679(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AAAATTATCCATTTA
SmilChr02G003026 Chr02 NC_080388.1:50931599-50931613promoter 内 1320-1334 bp + 2667 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 50925664-50928932(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GTACAAGATAAGGTT
SmilChr02G004602 Chr02 NC_080388.1:68541070-68541084promoter 内 1238-1252 bp - 2749 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 68537309-68538321(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AAGTTTATCCAAAAG
SmilChr03G000293 Chr03 NC_080389.1:3361886-3361900promoter 内 1157-1171 bp + 2830 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 3357796-3359056(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 CTTTTGGATAATTTT
SmilChr02G004571 Chr02 NC_080388.1:68210310-68210324promoter 内 1131-1145 bp - 2856 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 68213180-68218239(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GTTATGGATATGATT
SmilChr01G005509 Chr01 NC_080387.1:71945563-71945577promoter 内 1129-1143 bp + 2858 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 71948435-71949956(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AAAATTATCCATTAA
SmilChr01G003953 Chr01 NC_080387.1:57914252-57914266promoter 内 892-906 bp + 3095 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 57917361-57918624(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TCTCTTATCCACATT
SmilChr04G001928 Chr04 NC_080390.1:31388556-31388570promoter 内 886-900 bp - 3101 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 31384665-31385455(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TATTTTATCCAATAA
SmilChr02G002804 Chr02 NC_080388.1:48110825-48110839promoter 内 846-860 bp + 3141 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 48113980-48115436(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TTTCTTATCCTTTTT
SmilChr02G003601 Chr02 NC_080388.1:57250010-57250024promoter 内 836-850 bp + 3151 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 57243195-57246859(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AAAATGGATAAAATA
SmilChr02G001401 Chr02 NC_080388.1:26596423-26596437promoter 内 787-801 bp + 3200 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 26591744-26593223(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AGTTCGGATAAGGAG
SmilChr01G001977 Chr01 NC_080387.1:35177652-35177666promoter 内 735-749 bp + 3252 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 35173127-35174400(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AAAAAGGATAAGAAA
SmilChr03G004645 Chr03 NC_080389.1:64021810-64021824promoter 内 715-729 bp + 3272 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 64017454-64018538(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AAATCGGATAAGTTT
SmilChr04G000855 Chr04 NC_080390.1:10821468-10821482promoter 内 707-721 bp - 3280 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 10817802-10818188(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TATCTTATCCATGAA
SmilChr01G000806 Chr01 NC_080387.1:17438073-17438087promoter 内 683-697 bp - 3304 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 17431542-17434769(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TGTATTATCCAATTC
SmilChr02G004446 Chr02 NC_080388.1:66810440-66810454promoter 内 622-636 bp - 3365 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 66813819-66814358(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TTATTGGATAACATG
SmilChr03G004045 Chr03 NC_080389.1:59439637-59439651promoter 内 581-595 bp - 3406 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 59432094-59436231(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATTCTTATCCTATCG
SmilChr02G000466 Chr02 NC_080388.1:6290078-6290092promoter 内 566-580 bp - 3421 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 6293513-6297640(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TTATAGGATAAGAAA
SmilChr01G003668 Chr01 NC_080387.1:55087600-55087614promoter 内 558-572 bp - 3429 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 55091043-55092374(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TGTTTGGATAATCTT
SmilChr02G003674 Chr02 NC_080388.1:58124274-58124288promoter 内 484-498 bp - 3503 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 58127791-58131837(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TATTTGGATAAAGCG
SmilChr02G003858 Chr02 NC_080388.1:60376064-60376078promoter 内 416-430 bp + 3571 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 60369218-60372493(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AGTAAGGATAAGTTT
SmilChr01G004107 Chr01 NC_080387.1:59592444-59592458promoter 内 340-354 bp + 3647 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 59584356-59588797(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TTAATGGATAATTTT
SmilChr01G001489 Chr01 NC_080387.1:28667252-28667266promoter 内 332-346 bp + 3655 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 28670921-28673589(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 CCTCTTATCCATATA
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SmilChr03G001177 Chr03 NC_080389.1:13521287-13521301promoter 内 219-233 bp + 3768 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 13525069-13537051(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TATCTTATCCATGAA
SmilChr03G004702 Chr03 NC_080389.1:64331411-64331425promoter 内 190-204 bp + 3797 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 64324390-64327614(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TTTTGGGATAAGGAT
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