转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G002885; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00022980-RA_Salv SmilChr01G002885 ERF XP_057767601.1 MP00151 ATGGACGGTGGAGG

可能结合的靶基因

9976 个结合位点 6907 个候选靶基因 第 78 / 139 下载 TSV

上一页 78 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G003627 Chr03 NC_080389.1:54959737-54959750promoter 内 609-622 bp + 3379 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 54963129-54963792(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ATGGACGGAGGAAG
SmilChr03G003107 Chr03 NC_080389.1:48203164-48203177promoter 内 590-603 bp + 3398 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 48206575-48209756(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GTGGACGGAGGCAC
SmilChr03G004749 Chr03 NC_080389.1:64578388-64578401promoter 内 588-601 bp + 3400 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 64581801-64585901(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GAAGACGGTGGTGG
SmilChr03G000765 Chr03 NC_080389.1:8745255-8745268promoter 内 450-463 bp - 3538 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 8748806-8752097(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ATGCCACCGTCCTT
SmilChr03G003490 Chr03 NC_080389.1:53473484-53473497promoter 内 421-434 bp + 3567 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 53467266-53469917(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CCTCCACCGGCAGC
SmilChr05G003385 Chr05 NC_080391.1:44849388-44849401promoter 内 405-418 bp - 3583 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 44852984-44856191(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ATGCCACCGTCCTT
SmilChr05G002699 Chr05 NC_080391.1:30965169-30965182promoter 内 394-407 bp + 3594 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 30968776-30970811(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CCGGACGGTGGGGA
SmilChr02G003846 Chr02 NC_080388.1:60219064-60219077promoter 内 393-406 bp + 3595 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 60211654-60215469(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CTTCCTCCGTCCAT
SmilChr03G000468 Chr03 NC_080389.1:4990486-4990499promoter 内 385-398 bp - 3603 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 4994102-4997403(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ATGCCACCGTCCTT
SmilChr02G001857 Chr02 NC_080388.1:33777998-33778011promoter 内 375-388 bp - 3613 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 33781624-33784431(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CTTCCTCCGTCCAT
SmilChr05G003291 Chr05 NC_080391.1:42998596-42998609promoter 内 359-372 bp + 3629 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 43002238-43004539(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GATGGCGGTGGAGG
SmilChr03G000635 Chr03 NC_080389.1:6983301-6983314promoter 内 307-320 bp - 3681 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 6986995-6988006(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CCTCCACCGTCTCC
SmilChr01G005651 Chr01 NC_080387.1:72894032-72894045promoter 内 271-284 bp + 3717 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 72889589-72890315(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TCCCCACCGTCCGG
SmilChr05G003143 Chr05 NC_080391.1:40101621-40101634promoter 内 263-276 bp + 3725 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 40094883-40097896(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ATGCCACCGTCCTT
SmilChr02G000160 Chr02 NC_080388.1:2087711-2087724promoter 内 253-266 bp + 3735 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 2081163-2083976(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CCTCCACCGTCTCC
SmilChr01G000964 Chr01 NC_080387.1:20445428-20445441promoter 内 248-261 bp - 3740 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 20433516-20441688(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GTGGACGGAGGCAC
SmilChr06G001490 Chr06 NC_080392.1:15928202-15928215promoter 内 191-204 bp + 3797 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 15922133-15924405(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GCCCCTCCGTCCAA
SmilChr07G001066 Chr07 NC_080393.1:7848115-7848128promoter 内 188-201 bp + 3800 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 7851928-7857522(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GACGACGGTGGAGG
SmilChr06G000862 Chr06 NC_080392.1:8143691-8143704promoter 内 186-199 bp - 3802 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 8147506-8150073(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CGCCCTCCGTCCAC
SmilChr05G001449 Chr05 NC_080391.1:13225828-13225841promoter 内 155-168 bp + 3833 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 13229674-13239752(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TTGGACGGTGACTA
SmilChr01G000066 Chr01 NC_080387.1:1069648-1069661promoter 内 141-154 bp + 3847 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 1073508-1077315(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GTGGACGGAGGGCG
SmilChr01G005633 Chr01 NC_080387.1:72778594-72778607promoter 内 31-44 bp - 3957 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 72769177-72774637(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ATGGACGGAGGAAG
SmilChr04G004094 Chr04 NC_080390.1:55936070-55936083promoter 内 1811-1824 bp - 2177 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 3 55930171-55933893(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ATTGACGGTGTCGG
SmilChr04G003013 Chr04 NC_080390.1:46533639-46533652promoter 内 3363-3376 bp - 625 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 46528327-46533014(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TTGGACGGTGTGGA
SmilChr04G002443 Chr04 NC_080390.1:39125530-39125543promoter 内 3084-3097 bp + 904 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 39126447-39130683(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TTGGACGGTGTGGA
SmilChr02G002963 Chr02 NC_080388.1:50144861-50144874promoter 内 2094-2107 bp - 1894 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 50141901-50142967(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TTGGACGGCGTGGA
SmilChr04G003390 Chr04 NC_080390.1:50454857-50454870promoter 内 1902-1915 bp - 2086 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 50456956-50458161(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TCGCCACCGTCATA
SmilChr04G001724 Chr04 NC_080390.1:28490897-28490910promoter 内 1523-1536 bp + 2465 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 28493375-28494745(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ATCGCCGGTGGAGG
SmilChr03G003037 Chr03 NC_080389.1:47270272-47270285promoter 内 1402-1415 bp + 2586 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 47272871-47274909(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GTGGACGGTAGCGC
SmilChr02G001162 Chr02 NC_080388.1:21208614-21208627promoter 内 1144-1157 bp - 2844 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 21211471-21212307(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TCATCACCGTCCCT
SmilChr02G003707 Chr02 NC_080388.1:58597207-58597220promoter 内 990-1003 bp + 2998 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 58600218-58608107(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TTTGCCGGTGGAGA
SmilChr03G003603 Chr03 NC_080389.1:54670960-54670973promoter 内 828-841 bp - 3160 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 54667206-54667800(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GTGGACGGTAGCGC
SmilChr01G005421 Chr01 NC_080387.1:71403581-71403594promoter 内 3955-3968 bp + 33 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 71403627-71407525(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ATGGACGGCTGCGA
SmilChr02G004496 Chr02 NC_080388.1:67456143-67456156promoter 内 3929-3942 bp + 59 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 67456215-67458614(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ATGGACGGAGGAGT
SmilChr04G002551 Chr04 NC_080390.1:40806192-40806205promoter 内 3809-3822 bp + 179 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 40798196-40806013(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CCCTCACCGTCAAA
SmilChr04G001106 Chr04 NC_080390.1:15841227-15841240promoter 内 3319-3332 bp - 669 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 15838118-15840558(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GTGGACGGTCGTGG
SmilChr04G001056 Chr04 NC_080390.1:15078855-15078868promoter 内 3267-3280 bp + 721 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 15079589-15090553(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GTGGACGGTCGTGG
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SmilChr04G000673 Chr04 NC_080390.1:7630977-7630990promoter 内 2526-2539 bp - 1462 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 7632452-7633045(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GCGCTACCGTCCAC
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