转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003688; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003637-RA_Salv SmilChr02G003688 MYB XP_057794248.1 MP00028 GGCTCAGCGCG

可能结合的靶基因

9024 个结合位点 6764 个候选靶基因 第 81 / 136 下载 TSV

上一页 81 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G002100 Chr02 NC_080388.1:37676435-37676445promoter 内 2230-2240 bp + 1761 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 37670534-37674674(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGT
SmilChr07G003996 Chr07 NC_080393.1:51009288-51009298promoter 内 2222-2232 bp - 1769 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 51006099-51007519(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCTCAGCGTT
SmilChr03G002234 Chr03 NC_080389.1:35240310-35240320promoter 内 2221-2231 bp + 1770 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 35242090-35242902(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACTTCAGCGCG
SmilChr03G001117 Chr03 NC_080389.1:12882874-12882884promoter 内 2199-2209 bp - 1792 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 12884676-12886638(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TACGCTGAGTC
SmilChr03G003293 Chr03 NC_080389.1:51039590-51039600promoter 内 2146-2156 bp - 1845 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 51041445-51043056(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GTCGCTGAGGC
SmilChr04G003130 Chr04 NC_080390.1:47904461-47904471promoter 内 2106-2116 bp - 1885 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 47902505-47902576(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCCGA
SmilChr03G001402 Chr03 NC_080389.1:16618307-16618317promoter 内 2056-2066 bp - 1935 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 16614216-16616372(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCTCAGCGTT
SmilChr07G002540 Chr07 NC_080393.1:24105461-24105471promoter 内 2024-2034 bp - 1967 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 24101438-24103494(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCCGA
SmilChr08G004441 Chr08 NC_080394.1:54127333-54127343promoter 内 1964-1974 bp + 2027 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 54119424-54125306(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAACC
SmilChr05G000755 Chr05 NC_080391.1:5846126-5846136promoter 内 1937-1947 bp - 2054 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 5842219-5844072(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCACA
SmilChr04G003034 Chr04 NC_080390.1:46819568-46819578promoter 内 1858-1868 bp + 2133 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 46821711-46828346(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCCGA
SmilChr03G001867 Chr03 NC_080389.1:25819645-25819655promoter 内 1758-1768 bp + 2233 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 25821888-25823864(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCACAGCGCG
SmilChr07G000525 Chr07 NC_080393.1:3662134-3662144promoter 内 1730-1740 bp - 2261 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 3664405-3677083(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACGCTGAGGT
SmilChr03G001179 Chr03 NC_080389.1:13527685-13527695promoter 内 1723-1733 bp + 2268 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 13529963-13531589(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGTTCAGCGCA
SmilChr01G003175 Chr01 NC_080387.1:50557088-50557098promoter 内 1699-1709 bp - 2292 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 50553129-50554796(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGTTCAGCGCA
SmilChr01G000946 Chr01 NC_080387.1:20056370-20056380promoter 内 1653-1663 bp - 2338 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 20051545-20054032(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCTCAGCGAC
SmilChr02G001175 Chr02 NC_080388.1:21584342-21584352promoter 内 1646-1656 bp - 2345 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 21579250-21581997(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCACA
SmilChr03G003827 Chr03 NC_080389.1:57376426-57376436promoter 内 1617-1627 bp + 2374 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 57378810-57384068(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGTTCAGCGCA
SmilChr02G002918 Chr02 NC_080388.1:49481458-49481468promoter 内 1600-1610 bp + 2391 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 49483859-49484563(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCCGA
SmilChr06G002965 Chr06 NC_080392.1:42439270-42439280promoter 内 1448-1458 bp - 2543 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 42432502-42436727(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACTCAGCGTA
SmilChr07G000530 Chr07 NC_080393.1:3682351-3682361promoter 内 1416-1426 bp + 2575 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 3684936-3686594(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCTCAGCGTT
SmilChr07G000526 Chr07 NC_080393.1:3662134-3662144promoter 内 1375-1385 bp - 2616 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 3664760-3666155(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACGCTGAGGT
SmilChr07G002798 Chr07 NC_080393.1:28001865-28001875promoter 内 1259-1269 bp + 2732 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 27996764-27999133(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GTCGCTGAGGC
SmilChr03G000306 Chr03 NC_080389.1:3510494-3510504promoter 内 1250-1260 bp + 2741 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 3485868-3507753(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCGGCTGAGCC
SmilChr03G000163 Chr03 NC_080389.1:1794021-1794031promoter 内 1249-1259 bp - 2742 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 1796773-1808516(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCGGCTGAGCC
SmilChr07G002533 Chr07 NC_080393.1:24022814-24022824promoter 内 1240-1250 bp + 2751 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 24025575-24027697(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCCGA
SmilChr07G002800 Chr07 NC_080393.1:28001865-28001875promoter 内 1183-1193 bp + 2808 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 28004683-28007969(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCTCAGCGAC
SmilChr01G003177 Chr01 NC_080387.1:50557088-50557098promoter 内 1143-1153 bp - 2848 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 50559946-50560389(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAACC
SmilChr05G000609 Chr05 NC_080391.1:4578961-4578971promoter 内 1110-1120 bp + 2881 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 4581852-4587387(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCTCAGCGAC
SmilChr01G000083 Chr01 NC_080387.1:1574222-1574232promoter 内 1004-1014 bp - 2987 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 1577219-1585906(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GTCGCTGAGGC
SmilChr08G003677 Chr08 NC_080394.1:41006607-41006617promoter 内 984-994 bp + 3007 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 41001806-41003600(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGT
SmilChr08G000174 Chr08 NC_080394.1:1185407-1185417promoter 内 816-826 bp - 3175 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 1188592-1197568(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGTGGT
SmilChr02G002244 Chr02 NC_080388.1:39861052-39861062promoter 内 779-789 bp + 3212 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 39856971-39857840(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGT
SmilChr01G000767 Chr01 NC_080387.1:16806049-16806059promoter 内 654-664 bp - 3337 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 16798869-16802712(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCTCAGCGAC
SmilChr06G001559 Chr06 NC_080392.1:16985468-16985478promoter 内 588-598 bp + 3403 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 16988881-16992365(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCACA
SmilChr06G001521 Chr06 NC_080392.1:16393322-16393332promoter 内 562-572 bp - 3429 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 16389787-16389893(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCTCAGCGAC
SmilChr05G000925 Chr05 NC_080391.1:7353093-7353103promoter 内 507-517 bp - 3484 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 7356587-7359309(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCGGCTGAGCC
SmilChr07G004523 Chr07 NC_080393.1:57900730-57900740promoter 内 470-480 bp + 3521 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 57894527-57897209(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGTGCTGAGCC
SmilChr02G005310 Chr02 NC_080388.1:73995161-73995171promoter 内 434-444 bp - 3557 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 73998728-74000883(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGTGGT
SmilChr01G003316 Chr01 NC_080387.1:51888147-51888157promoter 内 399-409 bp + 3592 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 51880672-51884555(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCGGCTGAGCC
SmilChr03G004618 Chr03 NC_080389.1:63884462-63884472promoter 内 370-380 bp + 3621 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 63880094-63880841(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGTGCTGAGCC
SmilChr04G003129 Chr04 NC_080390.1:47904461-47904471promoter 内 341-351 bp - 3650 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 47897872-47900811(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCCGA
SmilChr05G000072 Chr05 NC_080391.1:367180-367190promoter 内 325-335 bp - 3666 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 362702-363514(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCACAGCGCG
SmilChr03G001219 Chr03 NC_080389.1:14013859-14013869promoter 内 208-218 bp - 3783 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 14007534-14010076(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCTCAGCGTT
SmilChr05G003750 Chr05 NC_080391.1:50637058-50637068promoter 内 184-194 bp + 3807 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 50628230-50633251(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCGGCTGAGCC
SmilChr06G000170 Chr06 NC_080392.1:1173035-1173045promoter 内 182-192 bp + 3809 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 1176854-1180048(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCACA
SmilChr07G000534 Chr07 NC_080393.1:3716810-3716820promoter 内 83-93 bp + 3908 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 3710408-3712902(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACGCTGAGGT
SmilChr01G003707 Chr01 NC_080387.1:55423777-55423787promoter 内 2630-2640 bp - 1361 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 5 55420943-55422416(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGAC
SmilChr03G001751 Chr03 NC_080389.1:23738174-23738184promoter 内 1073-1083 bp + 2918 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 5 23741102-23741413(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ATCTCAGCGCC
SmilChr02G003933 Chr02 NC_080388.1:61409755-61409765promoter 内 1750-1760 bp + 2241 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 4 61405369-61407514(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCTGCTGAGCG