转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr06G001829; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004434-RA_Salv SmilChr06G001829 MYB XP_057766988.1 MP00510 TTTACCTACCTTT

可能结合的靶基因

9799 个结合位点 7526 个候选靶基因 第 82 / 151 下载 TSV

上一页 82 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G000494 Chr02 NC_080388.1:6813566-6813578promoter 内 3883-3895 bp - 106 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 3 6813684-6815029(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAAAGTAGGTATG
SmilChr04G003057 Chr04 NC_080390.1:47143823-47143835promoter 内 3683-3695 bp - 306 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 3 47141270-47143517(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTACCTAATATC
SmilChr01G004229 Chr01 NC_080387.1:60672192-60672204promoter 内 2687-2699 bp - 1302 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 3 60673506-60674711(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CATGGTAGGTATA
SmilChr02G002247 Chr02 NC_080388.1:39907420-39907432promoter 内 2568-2580 bp + 1421 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 3 39908853-39912236(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTGCCTACCTCT
SmilChr04G002429 Chr04 NC_080390.1:38922931-38922943promoter 内 2271-2283 bp - 1718 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 3 38920395-38921213(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CGTACCTACTCGT
SmilChr04G002529 Chr04 NC_080390.1:40364016-40364028promoter 内 3882-3894 bp + 107 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 40362913-40363909(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GAAATTAGGTAAT
SmilChr04G001745 Chr04 NC_080390.1:28737251-28737263promoter 内 3296-3308 bp - 693 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 28737956-28740115(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTTGTAGGTAAG
SmilChr01G002805 Chr01 NC_080387.1:46592204-46592216promoter 内 2358-2370 bp - 1631 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 46593847-46601851(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACAGGTAGGTTAA
SmilChr01G004208 Chr01 NC_080387.1:60522544-60522556promoter 内 2177-2189 bp + 1812 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 60524368-60527197(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CATACCTACTACT
SmilChr04G003431 Chr04 NC_080390.1:50886969-50886981promoter 内 1835-1847 bp - 2154 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 50889135-50892864(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GATATTAGGTAAT
SmilChr01G004541 Chr01 NC_080387.1:63563322-63563334promoter 内 1665-1677 bp - 2324 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 63559863-63560998(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTACCTAATATC
SmilChr05G001588 Chr05 NC_080391.1:14582407-14582419promoter 内 1374-1386 bp - 2615 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 14579370-14579792(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTACCTAATATC
SmilChr01G001192 Chr01 NC_080387.1:24055703-24055715promoter 内 1362-1374 bp - 2627 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 24058342-24059483(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTAGGTAGGTATG
SmilChr04G002577 Chr04 NC_080390.1:41136537-41136549promoter 内 1354-1366 bp - 2635 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 41139184-41143763(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GATATTAGGTAAT
SmilChr02G003622 Chr02 NC_080388.1:57531685-57531697promoter 内 1282-1294 bp + 2707 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 57528041-57528978(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GATATTAGGTAAT
SmilChr04G002563 Chr04 NC_080390.1:40952142-40952154promoter 内 1247-1259 bp - 2742 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 40954896-40961603(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GATATTAGGTAAT
SmilChr03G004269 Chr03 NC_080389.1:61173259-61173271promoter 内 1187-1199 bp - 2802 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 61165887-61170457(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAAAACC
SmilChr05G001699 Chr05 NC_080391.1:16209006-16209018promoter 内 1089-1101 bp + 2900 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 16204431-16206106(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GATATTAGGTAAT
SmilChr01G005341 Chr01 NC_080387.1:70624947-70624959promoter 内 349-361 bp - 3640 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 70628599-70630450(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AACTGTAGGTAGA
SmilChr02G004368 Chr02 NC_080388.1:65976879-65976891promoter 内 3937-3949 bp + 52 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 65974899-65976827(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGAATTAGGTAAT
SmilChr02G004371 Chr02 NC_080388.1:66043715-66043727promoter 内 3937-3949 bp + 52 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 66042505-66043663(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGAATTAGGTAAT
SmilChr04G001561 Chr04 NC_080390.1:25910186-25910198promoter 内 3887-3899 bp - 102 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 25910300-25911847(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGAATTAGGTAAT
SmilChr05G001398 Chr05 NC_080391.1:12569240-12569252promoter 内 3856-3868 bp - 133 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 12569385-12576372(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TAGGGTAGGTATA
SmilChr02G000816 Chr02 NC_080388.1:13655252-13655264promoter 内 3839-3851 bp - 150 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 13655414-13658807(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGAATTAGGTAAT
SmilChr05G000918 Chr05 NC_080391.1:7284409-7284421promoter 内 3807-3819 bp + 182 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 7284603-7285698(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTACCTAATATC
SmilChr03G000285 Chr03 NC_080389.1:3250486-3250498promoter 内 3744-3756 bp - 245 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 3248378-3250241(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAAATTC
SmilChr03G003688 Chr03 NC_080389.1:55772308-55772320promoter 内 3676-3688 bp + 313 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 55772633-55776823(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAAATTC
SmilChr04G002845 Chr04 NC_080390.1:44573846-44573858promoter 内 3477-3489 bp - 512 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 44574370-44577009(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGATTTAGGTAAA
SmilChr04G003160 Chr04 NC_080390.1:48228110-48228122promoter 内 3415-3427 bp + 574 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 48226904-48227536(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGTATTAGGTAAT
SmilChr04G002441 Chr04 NC_080390.1:39098929-39098941promoter 内 3408-3420 bp + 581 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 39096952-39098348(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGAGGTAGGCAGG
SmilChr02G005339 Chr02 NC_080388.1:74239699-74239711promoter 内 3329-3341 bp + 660 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 74240371-74242892(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTGCCTACCTTT
SmilChr04G002430 Chr04 NC_080390.1:38922931-38922943promoter 内 3244-3256 bp - 745 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 38923688-38940900(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACGAGTAGGTACG
SmilChr01G003066 Chr01 NC_080387.1:49507931-49507943promoter 内 3200-3212 bp + 789 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 49505497-49507142(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAAAGTAGGTATG
SmilChr03G003369 Chr03 NC_080389.1:52049726-52049738promoter 内 3074-3086 bp + 915 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 52050653-52052145(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CATACCTACTTTT
SmilChr03G001629 Chr03 NC_080389.1:20991327-20991339promoter 内 3066-3078 bp + 923 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 20992262-20994544(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CATACCTACCTAA
SmilChr05G000186 Chr05 NC_080391.1:1498637-1498649promoter 内 3058-3070 bp + 931 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 1493467-1497706(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTGGTAGGTATA
SmilChr05G000613 Chr05 NC_080391.1:4609265-4609277promoter 内 2974-2986 bp - 1015 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 4610292-4612813(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GATTTTAGGTAAA
SmilChr03G002745 Chr03 NC_080389.1:43629573-43629585promoter 内 2880-2892 bp - 1109 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 43610234-43628464(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CATACCTACTATT
SmilChr03G002758 Chr03 NC_080389.1:43841305-43841317promoter 内 2875-2887 bp - 1114 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 43821928-43840191(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CATACCTACTATT
SmilChr04G002893 Chr04 NC_080390.1:45151153-45151165promoter 内 2812-2824 bp - 1177 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 45152342-45155913(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GATTTTAGGTAAA
SmilChr02G004111 Chr02 NC_080388.1:63405620-63405632promoter 内 2794-2806 bp + 1195 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 63406827-63409082(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATACCTACCGTT
SmilChr02G003879 Chr02 NC_080388.1:60857819-60857831promoter 内 2757-2769 bp + 1232 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 60859063-60860480(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTGCCTACCTCT
SmilChr04G003068 Chr04 NC_080390.1:47213937-47213949promoter 内 2750-2762 bp + 1239 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 47215188-47223158(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAAAATC
SmilChr03G003722 Chr03 NC_080389.1:56240309-56240321promoter 内 2744-2756 bp - 1245 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 56241566-56245128(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGAGGTAGGCAAG
SmilChr03G003424 Chr03 NC_080389.1:52572984-52572996promoter 内 2661-2673 bp - 1328 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 52560603-52571656(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAAATTC
SmilChr03G000465 Chr03 NC_080389.1:4975053-4975065promoter 内 2485-2497 bp - 1504 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 4970292-4973549(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CATACCTACTTCT
SmilChr02G004986 Chr02 NC_080388.1:71736440-71736452promoter 内 2260-2272 bp - 1729 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 71738181-71743056(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GAAATTAGGTAAT
SmilChr01G003025 Chr01 NC_080387.1:49309809-49309821promoter 内 2227-2239 bp + 1762 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 49303042-49308047(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGAATTAGGTAAT
SmilChr03G004671 Chr03 NC_080389.1:64164676-64164688promoter 内 2118-2130 bp + 1871 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 64166559-64168856(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTACCTAATTCC
SmilChr02G003594 Chr02 NC_080388.1:57143432-57143444promoter 内 1978-1990 bp - 2011 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 57145455-57146741(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GAATTTAGGTAAA