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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G001885; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020124-RA_Salv SmilChr01G001885 WRKY XP_057806790.1 MP00171 AAAAGTCAACGAT

可能结合的靶基因

9833 个结合位点 7182 个候选靶基因 第 87 / 144 下载 TSV

上一页 87 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G004089 Chr01 NC_080387.1:59289459-59289471promoter 内 817-829 bp + 3172 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 59292643-59294781(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 TAAAGTCAATGCT
SmilChr01G005050 Chr01 NC_080387.1:68444615-68444627promoter 内 802-814 bp - 3187 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 68447814-68451121(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 AAAGTTGACTGTT
SmilChr03G003169 Chr03 NC_080389.1:49050625-49050637promoter 内 773-785 bp - 3216 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 49044591-49047409(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 CACAGTCAACAAC
SmilChr02G000996 Chr02 NC_080388.1:17498248-17498260promoter 内 723-735 bp + 3266 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 17491781-17494982(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 TACTTTGACTTTC
SmilChr04G000786 Chr04 NC_080390.1:9681973-9681985promoter 内 716-728 bp + 3273 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 9676495-9678700(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 ACTGTTGACTATA
SmilChr02G001678 Chr02 NC_080388.1:31012423-31012435promoter 内 656-668 bp + 3333 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 31015768-31017540(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 TAAAGTCAATGCT
SmilChr01G004936 Chr01 NC_080387.1:67464304-67464316promoter 内 555-567 bp + 3434 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 67459992-67460870(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 GCCGTTGACCGAC
SmilChr03G003247 Chr03 NC_080389.1:50354303-50354315promoter 内 512-524 bp + 3477 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 50357792-50360236(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 TGAAGTCAACCAG
SmilChr02G002957 Chr02 NC_080388.1:50098068-50098080promoter 内 488-500 bp + 3501 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 50101581-50105146(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 AACAGTCAACCAA
SmilChr03G003192 Chr03 NC_080389.1:49394202-49394214promoter 内 388-400 bp + 3601 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 49377779-49390601(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 GTTGTTGACTGTG
SmilChr02G000484 Chr02 NC_080388.1:6600275-6600287promoter 内 377-389 bp + 3612 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 6603899-6605266(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 TCAAGTCAACTGA
SmilChr01G004963 Chr01 NC_080387.1:67712470-67712482promoter 内 325-337 bp - 3664 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 67706278-67708806(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 AAGAGTCAACAGG
SmilChr02G001747 Chr02 NC_080388.1:32061720-32061732promoter 内 321-333 bp + 3668 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 32049309-32058052(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 TGTGTTGACTGTT
SmilChr02G000059 Chr02 NC_080388.1:760032-760044promoter 内 229-241 bp + 3760 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 755774-756272(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 CGAGTTGACTGTC
SmilChr01G005577 Chr01 NC_080387.1:72500058-72500070promoter 内 156-168 bp + 3833 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 72503903-72505447(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 TCCAGTCAACGCA
SmilChr01G002349 Chr01 NC_080387.1:40645431-40645443promoter 内 57-69 bp + 3932 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 40637857-40641499(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 GCATTTGACTTTG
SmilChr01G005414 Chr01 NC_080387.1:71370298-71370310promoter 内 2462-2474 bp + 1527 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 3 71366512-71368771(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 GAAGTTGACTTGA
SmilChr01G004553 Chr01 NC_080387.1:63639462-63639474promoter 内 2297-2309 bp + 1692 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 3 63635851-63637770(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 TTCGTTGACCAAG
SmilChr01G000492 Chr01 NC_080387.1:9977734-9977746promoter 内 2034-2046 bp + 1955 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 3 9972478-9975779(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 TCCGTTGACTGAA
SmilChr03G003222 Chr03 NC_080389.1:49892530-49892542promoter 内 1411-1423 bp + 2578 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 3 49888345-49889952(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 AAAGTTGACTCTG
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SmilChr03G004392 Chr03 NC_080389.1:62099879-62099891promoter 内 3887-3899 bp - 102 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 62099029-62099777(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 AAAAGTCAATGAG
SmilChr02G005524 Chr02 NC_080388.1:75318548-75318560promoter 内 3874-3886 bp + 115 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 75315098-75318433(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 CTAGTTGACTTGC
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SmilChr02G005338 Chr02 NC_080388.1:74227258-74227270promoter 内 3164-3176 bp - 825 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 74228095-74239539(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 CTCATTGACTTTT
SmilChr02G001130 Chr02 NC_080388.1:20438291-20438303promoter 内 2836-2848 bp - 1153 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 20436674-20437138(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 TCAAGTCAACTAT
SmilChr02G003312 Chr02 NC_080388.1:54364545-54364557promoter 内 2761-2773 bp - 1228 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 54362925-54363317(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 TTAAGTCAACAGT
SmilChr02G001291 Chr02 NC_080388.1:23731752-23731764promoter 内 2669-2681 bp + 1320 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 23726053-23730432(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 TCTGTTGACTCTT
SmilChr01G004668 Chr01 NC_080387.1:64793161-64793173promoter 内 2540-2552 bp - 1449 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 64789175-64791712(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 AGAAGTCAAAGTC
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SmilChr02G004091 Chr02 NC_080388.1:63181300-63181312promoter 内 1659-1671 bp + 2330 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 63178134-63178970(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 AAAGTTGACTCTG
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SmilChr02G001831 Chr02 NC_080388.1:33328160-33328172promoter 内 1454-1466 bp + 2535 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 33330707-33330813(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 CGCGGTCAACGGA
SmilChr03G004345 Chr03 NC_080389.1:61732827-61732839promoter 内 1244-1256 bp + 2745 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 61735584-61736510(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 TGGGGTCAACGGC
SmilChr04G000770 Chr04 NC_080390.1:9467391-9467403promoter 内 1147-1159 bp + 2842 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 9463934-9464549(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 TGCTTTGACTTAT
SmilChr01G005959 Chr01 NC_080387.1:75302783-75302795promoter 内 1141-1153 bp + 2848 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 75305643-75308359(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 TCAAGTCAACTTC
SmilChr04G000614 Chr04 NC_080390.1:6937610-6937622promoter 内 618-630 bp + 3371 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 6929908-6934239(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 TTTGTTGACTATG
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SmilChr01G001642 Chr01 NC_080387.1:30454185-30454197promoter 内 372-384 bp - 3617 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 30457814-30464973(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 CACGTTGACTAAA
SmilChr04G000998 Chr04 NC_080390.1:13822907-13822919promoter 内 289-301 bp + 3700 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 13826619-13827179(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 AGAAGTCAAAGTC
SmilChr02G004090 Chr02 NC_080388.1:63181300-63181312promoter 内 279-291 bp + 3710 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 63172916-63177590(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 AAAGTTGACTCTG
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SmilChr01G000881 Chr01 NC_080387.1:18746413-18746425promoter 内 3964-3976 bp + 25 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 18743230-18746388(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 AATGTTGACTTGG
SmilChr01G004119 Chr01 NC_080387.1:59719710-59719722promoter 内 3901-3913 bp + 88 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 59717132-59719622(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 TTAGTTGACTCTT
SmilChr03G000939 Chr03 NC_080389.1:10680690-10680702promoter 内 3861-3873 bp + 128 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 10680830-10685763(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 TTAAGTCAACAGT
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SmilChr01G001649 Chr01 NC_080387.1:30551439-30551451promoter 内 3849-3861 bp - 140 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 30549545-30551299(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 ATAAGTCAACAAA
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SmilChr04G001091 Chr04 NC_080390.1:15618514-15618526promoter 内 3772-3784 bp + 217 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 15618743-15622884(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 CCCAGTCAACGTG