转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr03G002335; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00025053-RA_Salv SmilChr03G002335 bZIP XP_057801256.1 MP00647 TCACGTGG

可能结合的靶基因

9953 个结合位点 7133 个候选靶基因 第 88 / 143 下载 TSV

上一页 88 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr07G001822 Chr07 NC_080393.1:15726502-15726509promoter 内 458-465 bp + 3536 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 15718989-15722966(-) SMil_00025053-RA_Salv MP00647 CCACGTGT
SmilChr07G002728 Chr07 NC_080393.1:26748499-26748506promoter 内 457-464 bp + 3537 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 26742323-26744962(-) SMil_00025053-RA_Salv MP00647 CCACGTGT
SmilChr04G003215 Chr04 NC_080390.1:48988380-48988387promoter 内 455-462 bp - 3539 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 48970628-48984841(-) SMil_00025053-RA_Salv MP00647 ACACGTGG
SmilChr04G002461 Chr04 NC_080390.1:39432691-39432698promoter 内 454-461 bp + 3540 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 39436238-39442760(+) SMil_00025053-RA_Salv MP00647 ACACGTGG
SmilChr01G005849 Chr01 NC_080387.1:74440558-74440565promoter 内 447-454 bp + 3547 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 74436940-74437011(-) SMil_00025053-RA_Salv MP00647 CCACGTGT
SmilChr01G005583 Chr01 NC_080387.1:72531935-72531942promoter 内 445-452 bp + 3549 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 72527807-72528386(-) SMil_00025053-RA_Salv MP00647 CCACGTGT
SmilChr05G001904 Chr05 NC_080391.1:19302973-19302980promoter 内 443-450 bp - 3551 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 19306531-19308048(+) SMil_00025053-RA_Salv MP00647 CCACGTGT
SmilChr04G003384 Chr04 NC_080390.1:50389422-50389429promoter 内 440-447 bp - 3554 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 50380709-50385868(-) SMil_00025053-RA_Salv MP00647 ACACGTGG
SmilChr02G005324 Chr02 NC_080388.1:74112391-74112398promoter 内 435-442 bp - 3559 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 74115957-74117456(+) SMil_00025053-RA_Salv MP00647 CCACGTGT
SmilChr02G005051 Chr02 NC_080388.1:72224134-72224141promoter 内 434-441 bp - 3560 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 72227701-72227787(+) SMil_00025053-RA_Salv MP00647 CCACGTGT
SmilChr05G002872 Chr05 NC_080391.1:34399464-34399471promoter 内 428-435 bp + 3566 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 34403037-34404380(+) SMil_00025053-RA_Salv MP00647 ACACGTGG
SmilChr05G001653 Chr05 NC_080391.1:15606485-15606492promoter 内 423-430 bp + 3571 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 15610063-15611712(+) SMil_00025053-RA_Salv MP00647 ACACGTGG
SmilChr05G001050 Chr05 NC_080391.1:8696664-8696671promoter 内 418-425 bp + 3576 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 8700247-8716005(+) SMil_00025053-RA_Salv MP00647 ACACGTGG
SmilChr04G002122 Chr04 NC_080390.1:34241040-34241047promoter 内 416-423 bp + 3578 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 34244625-34244697(+) SMil_00025053-RA_Salv MP00647 ACACGTGG
SmilChr02G004126 Chr02 NC_080388.1:63505732-63505739promoter 内 411-418 bp + 3583 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 63509322-63511553(+) SMil_00025053-RA_Salv MP00647 ACACGTGG
SmilChr07G002856 Chr07 NC_080393.1:28712502-28712509promoter 内 406-413 bp - 3588 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 28706952-28708914(-) SMil_00025053-RA_Salv MP00647 ACACGTGG
SmilChr03G003084 Chr03 NC_080389.1:47881928-47881935promoter 内 403-410 bp - 3591 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 47885526-47886527(+) SMil_00025053-RA_Salv MP00647 CCACGTGT
SmilChr01G001179 Chr01 NC_080387.1:23847278-23847285promoter 内 402-409 bp - 3592 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 23836130-23843686(-) SMil_00025053-RA_Salv MP00647 ACACGTGG
SmilChr06G000786 Chr06 NC_080392.1:7377706-7377713promoter 内 402-409 bp - 3592 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 7381305-7391870(+) SMil_00025053-RA_Salv MP00647 CCACGTGT
SmilChr03G003438 Chr03 NC_080389.1:52731186-52731193promoter 内 396-403 bp - 3598 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 52734791-52736443(+) SMil_00025053-RA_Salv MP00647 CCACGTGT
SmilChr01G003933 Chr01 NC_080387.1:57622904-57622911promoter 内 391-398 bp + 3603 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 57626514-57635669(+) SMil_00025053-RA_Salv MP00647 ACACGTGG
SmilChr04G002142 Chr04 NC_080390.1:34446752-34446759promoter 内 390-397 bp - 3604 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 34442117-34443148(-) SMil_00025053-RA_Salv MP00647 ACACGTGG
SmilChr07G002854 Chr07 NC_080393.1:28687873-28687880promoter 内 389-396 bp - 3605 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 28684162-28684268(-) SMil_00025053-RA_Salv MP00647 ACACGTGG
SmilChr05G000571 Chr05 NC_080391.1:4301580-4301587promoter 内 388-395 bp - 3606 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 4297118-4297974(-) SMil_00025053-RA_Salv MP00647 ACACGTGG
SmilChr02G005018 Chr02 NC_080388.1:71961122-71961129promoter 内 386-393 bp - 3608 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 71955985-71957514(-) SMil_00025053-RA_Salv MP00647 ACACGTGG
SmilChr04G003913 Chr04 NC_080390.1:54852268-54852275promoter 内 386-393 bp + 3608 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 54855883-54859870(+) SMil_00025053-RA_Salv MP00647 ACACGTGG
SmilChr03G003765 Chr03 NC_080389.1:56786616-56786623promoter 内 385-392 bp + 3609 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 56790232-56794537(+) SMil_00025053-RA_Salv MP00647 ACACGTGG
SmilChr07G002446 Chr07 NC_080393.1:22962095-22962102promoter 内 379-386 bp + 3615 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 22955372-22958480(-) SMil_00025053-RA_Salv MP00647 CCACGTGT
SmilChr05G002818 Chr05 NC_080391.1:33172536-33172543promoter 内 377-384 bp + 3617 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 33176160-33179277(+) SMil_00025053-RA_Salv MP00647 ACACGTGG
SmilChr03G000682 Chr03 NC_080389.1:7630359-7630366promoter 内 376-383 bp - 3618 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 7625512-7626741(-) SMil_00025053-RA_Salv MP00647 ACACGTGG
SmilChr01G003255 Chr01 NC_080387.1:51252562-51252569promoter 内 374-381 bp + 3620 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 51256189-51261192(+) SMil_00025053-RA_Salv MP00647 ACACGTGG
SmilChr06G001479 Chr06 NC_080392.1:15760930-15760937promoter 内 371-378 bp + 3623 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 15755666-15757307(-) SMil_00025053-RA_Salv MP00647 CCACGTGT
SmilChr02G003368 Chr02 NC_080388.1:54813803-54813810promoter 内 369-376 bp + 3625 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 54804853-54810178(-) SMil_00025053-RA_Salv MP00647 CCACGTGT
SmilChr01G001761 Chr01 NC_080387.1:32338312-32338319promoter 内 368-375 bp + 3626 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 32341945-32346332(+) SMil_00025053-RA_Salv MP00647 ACACGTGG
SmilChr07G000823 Chr07 NC_080393.1:5795625-5795632promoter 内 368-375 bp + 3626 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 5799258-5805833(+) SMil_00025053-RA_Salv MP00647 ACACGTGG
SmilChr04G000594 Chr04 NC_080390.1:6656063-6656070promoter 内 360-367 bp + 3634 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 6651202-6652429(-) SMil_00025053-RA_Salv MP00647 CCACGTGT
SmilChr02G002193 Chr02 NC_080388.1:39157348-39157355promoter 内 356-363 bp + 3638 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 39152112-39153710(-) SMil_00025053-RA_Salv MP00647 CCACGTGT
SmilChr01G004906 Chr01 NC_080387.1:67106330-67106337promoter 内 355-362 bp + 3639 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 67109976-67110610(+) SMil_00025053-RA_Salv MP00647 ACACGTGG
SmilChr06G001652 Chr06 NC_080392.1:18723926-18723933promoter 内 355-362 bp - 3639 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 18716913-18720287(-) SMil_00025053-RA_Salv MP00647 ACACGTGG
SmilChr06G002475 Chr06 NC_080392.1:35584429-35584436promoter 内 355-362 bp + 3639 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 35588075-35590232(+) SMil_00025053-RA_Salv MP00647 ACACGTGG
SmilChr05G000134 Chr05 NC_080391.1:1080517-1080524promoter 内 344-351 bp + 3650 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 1084174-1086413(+) SMil_00025053-RA_Salv MP00647 ACACGTGG
SmilChr01G004035 Chr01 NC_080387.1:58770226-58770233promoter 内 343-350 bp - 3651 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 58773884-58775054(+) SMil_00025053-RA_Salv MP00647 CCACGTGT
SmilChr04G000294 Chr04 NC_080390.1:2750626-2750633promoter 内 342-349 bp - 3652 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 2738606-2746974(-) SMil_00025053-RA_Salv MP00647 ACACGTGG
SmilChr04G003969 Chr04 NC_080390.1:55169328-55169335promoter 内 340-347 bp + 3654 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 55162182-55165674(-) SMil_00025053-RA_Salv MP00647 CCACGTGT
SmilChr02G003504 Chr02 NC_080388.1:56223021-56223028promoter 内 338-345 bp - 3656 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 56226684-56230646(+) SMil_00025053-RA_Salv MP00647 CCACGTGT
SmilChr07G002042 Chr07 NC_080393.1:18516864-18516871promoter 内 338-345 bp + 3656 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 18520527-18524903(+) SMil_00025053-RA_Salv MP00647 ACACGTGG
SmilChr03G003247 Chr03 NC_080389.1:50354128-50354135promoter 内 337-344 bp + 3657 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 50357792-50360236(+) SMil_00025053-RA_Salv MP00647 ACACGTGG
SmilChr02G003306 Chr02 NC_080388.1:54332934-54332941promoter 内 335-342 bp - 3659 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 54325880-54329275(-) SMil_00025053-RA_Salv MP00647 ACACGTGG
SmilChr01G002215 Chr01 NC_080387.1:38481049-38481056promoter 内 334-341 bp + 3660 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 38484716-38489024(+) SMil_00025053-RA_Salv MP00647 ACACGTGG
SmilChr01G003855 Chr01 NC_080387.1:56816769-56816776promoter 内 333-340 bp - 3661 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 56820437-56822342(+) SMil_00025053-RA_Salv MP00647 CCACGTGT