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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr07G002147; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004577-RA_Salv SmilChr07G002147 MYB XP_057774045.1 MP00500 AATATGGATAAGG

可能结合的靶基因

9681 个结合位点 6697 个候选靶基因 第 98 / 134 下载 TSV

上一页 98 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G000744 Chr02 NC_080388.1:12042364-12042376promoter 内 2453-2465 bp + 1536 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 12037994-12040828(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GCTTATCCCAACT
SmilChr03G001206 Chr03 NC_080389.1:13913889-13913901promoter 内 2167-2179 bp + 1822 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 13915723-13917553(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AGCAAAGATAAGG
SmilChr02G004516 Chr02 NC_080388.1:67691908-67691920promoter 内 1946-1958 bp + 2043 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 67693963-67695138(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TTGGAGGATAAGC
SmilChr02G001304 Chr02 NC_080388.1:24189995-24190007promoter 内 1884-1896 bp + 2105 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 24192112-24198150(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATGTAAGATAAGG
SmilChr03G001754 Chr03 NC_080389.1:23819719-23819731promoter 内 1866-1878 bp - 2123 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 23821854-23824307(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ACTTATCCTCCAC
SmilChr03G001851 Chr03 NC_080389.1:25487910-25487922promoter 内 1779-1791 bp + 2210 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 25490132-25490237(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GTCCAAGATAAGG
SmilChr02G000707 Chr02 NC_080388.1:11393766-11393778promoter 内 1044-1056 bp - 2945 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 11389817-11390821(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CATATGGATAATA
SmilChr01G000203 Chr01 NC_080387.1:3479698-3479710promoter 内 390-402 bp - 3599 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 3483309-3484678(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCAAAACA
SmilChr01G002867 Chr01 NC_080387.1:47283851-47283863promoter 内 388-400 bp + 3601 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 47278591-47280250(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCTGGTT
SmilChr02G003634 Chr02 NC_080388.1:57688987-57688999promoter 内 286-298 bp + 3703 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 57677485-57685284(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCATATAT
SmilChr02G001465 Chr02 NC_080388.1:27386866-27386878promoter 内 3916-3928 bp + 73 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 27386951-27390400(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GAGATGGATAAGT
SmilChr01G001989 Chr01 NC_080387.1:35318482-35318494promoter 内 3795-3807 bp + 194 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 35312795-35318288(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCAAGATA
SmilChr02G004342 Chr02 NC_080388.1:65674634-65674646promoter 内 3754-3766 bp + 235 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 65674881-65678148(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TGTGTGGATAATA
SmilChr02G004872 Chr02 NC_080388.1:70805490-70805502promoter 内 3716-3728 bp - 273 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 70805775-70807636(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GCTTATCCCATAA
SmilChr02G000419 Chr02 NC_080388.1:5321787-5321799promoter 内 3697-3709 bp + 292 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 5319783-5321495(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCATATAT
SmilChr01G001453 Chr01 NC_080387.1:28212445-28212457promoter 内 3639-3651 bp + 350 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 28212024-28212095(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GCTTATCCTTGTT
SmilChr02G001945 Chr02 NC_080388.1:35073494-35073506promoter 内 3593-3605 bp + 396 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 35073902-35076549(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AGACTGGATAAGT
SmilChr01G004525 Chr01 NC_080387.1:63449406-63449418promoter 内 3546-3558 bp + 443 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 63446682-63448963(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ACTTATCCTGACT
SmilChr01G001452 Chr01 NC_080387.1:28212445-28212457promoter 内 3269-3281 bp + 720 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 28209347-28211725(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GCTTATCCTTGTT
SmilChr02G003748 Chr02 NC_080388.1:59134729-59134741promoter 内 3252-3264 bp - 737 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 59130392-59133992(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATTATGGATAATA
SmilChr02G004409 Chr02 NC_080388.1:66412820-66412832promoter 内 3157-3169 bp - 832 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 66408238-66411988(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TACGTGGATAAGT
SmilChr02G003635 Chr02 NC_080388.1:57699204-57699216promoter 内 3103-3115 bp - 886 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 57700102-57700797(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCATATAT
SmilChr03G000805 Chr03 NC_080389.1:9216939-9216951promoter 内 3064-3076 bp + 925 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 9213395-9216014(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TATTATCCACACA
SmilChr02G003509 Chr02 NC_080388.1:56284265-56284277promoter 内 3049-3061 bp + 940 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 56285217-56286431(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATTATGGATAATA
SmilChr02G003561 Chr02 NC_080388.1:56787689-56787701promoter 内 3041-3053 bp + 948 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 56788649-56789863(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATTATGGATAATA
SmilChr01G001638 Chr01 NC_080387.1:30416356-30416368promoter 内 2981-2993 bp + 1008 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 30417376-30420460(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GTTGTGGATAAAG
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SmilChr01G000412 Chr01 NC_080387.1:8364111-8364123promoter 内 2848-2860 bp - 1141 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 8365264-8368444(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCAAAACA
SmilChr02G001500 Chr02 NC_080388.1:28045181-28045193promoter 内 2797-2809 bp - 1192 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 28041638-28043989(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TGTGTGGATAATA
SmilChr01G005779 Chr01 NC_080387.1:73902726-73902738promoter 内 2788-2800 bp - 1201 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 73903939-73906440(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TATTATCCACACA
SmilChr01G004080 Chr01 NC_080387.1:59216529-59216541promoter 内 2730-2742 bp + 1259 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 59217800-59219762(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TTGGAGGATAAGC
SmilChr03G002101 Chr03 NC_080389.1:32542435-32542447promoter 内 2677-2689 bp + 1312 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 32543759-32560923(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TGTGTGGATAATA
SmilChr02G000479 Chr02 NC_080388.1:6584113-6584125promoter 内 2613-2625 bp - 1376 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 6579395-6582737(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AAAATGGATAACC
SmilChr02G000857 Chr02 NC_080388.1:14640063-14640075promoter 内 2470-2482 bp - 1519 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 14637642-14638544(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GTGGAGGATAAGT
SmilChr01G003517 Chr01 NC_080387.1:53778014-53778026promoter 内 2428-2440 bp + 1561 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 53771630-53776453(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCAGTATA
SmilChr01G002040 Chr01 NC_080387.1:36069398-36069410promoter 内 2197-2209 bp - 1792 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 36071202-36076483(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GGTTATCCATTTT
SmilChr02G001552 Chr02 NC_080388.1:28804743-28804755promoter 内 2144-2156 bp + 1845 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 28806600-28807767(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CAGTAAGATAAGG
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SmilChr01G002274 Chr01 NC_080387.1:39516488-39516500promoter 内 2106-2118 bp + 1883 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 39518383-39520006(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GTTGTGGATAAAG
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SmilChr03G000604 Chr03 NC_080389.1:6691056-6691068promoter 内 1993-2005 bp + 1996 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 6687924-6689060(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTTACAT
SmilChr03G001199 Chr03 NC_080389.1:13829481-13829493promoter 内 1978-1990 bp - 2011 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 13831504-13832646(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTTACAT
SmilChr03G001598 Chr03 NC_080389.1:20307739-20307751promoter 内 1915-1927 bp + 2074 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 20304955-20305665(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ACTTATCCCATAC
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SmilChr01G004526 Chr01 NC_080387.1:63449406-63449418promoter 内 1470-1482 bp + 2519 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 63451937-63461276(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AGTCAGGATAAGT