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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G000040; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00000579-RA_Salv SmilChr04G000040 ERF XP_057808382.1 MP00312 AATTGTCGGTGGAGT

可能结合的靶基因

8490 个结合位点 7006 个候选靶基因 第 1 / 141 下载 TSV

1 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr07G004075 Chr07 NC_080393.1:52165882-52165896promoter 内 3477-3491 bp - 510 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.4/ 100 1 52164743-52165372(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CTGTGTCGGTGGCGG
SmilChr08G003822 Chr08 NC_080394.1:44400014-44400028promoter 内 1161-1175 bp + 2826 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 1 44402854-44408539(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 AGGTGTCGGTGGCGG
SmilChr02G003645 Chr02 NC_080388.1:57823573-57823587promoter 内 3435-3449 bp + 552 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.7/ 100 1 57804805-57823021(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCGCCACCGACGCCG
SmilChr03G003388 Chr03 NC_080389.1:52256717-52256731promoter 内 2911-2925 bp + 1076 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.7/ 100 1 52257807-52261126(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CGGCGTCGGTGGCGG
SmilChr04G000503 Chr04 NC_080390.1:5501523-5501537promoter 内 1913-1927 bp - 2074 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.7/ 100 1 5495844-5499449(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CGGCGTCGGTGGCGG
SmilChr04G003282 Chr04 NC_080390.1:49493403-49493417promoter 内 1246-1260 bp + 2741 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.7/ 100 1 49496158-49498946(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CGGCGTCGGTGGCGG
SmilChr01G001815 Chr01 NC_080387.1:33098837-33098851promoter 内 637-651 bp - 3350 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.7/ 100 1 33093871-33095487(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CGGCGTCGGTGGCGG
SmilChr03G000444 Chr03 NC_080389.1:4767932-4767946promoter 内 89-103 bp + 3898 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.7/ 100 1 4760496-4764034(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCGCCACCGACGCCG
SmilChr02G005449 Chr02 NC_080388.1:74849577-74849591promoter 内 1045-1059 bp - 2942 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.6/ 100 1 74843521-74846635(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CTGTGTCGGTGGTGG
SmilChr03G003691 Chr03 NC_080389.1:55849895-55849909promoter 内 1556-1570 bp - 2431 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 3 55852340-55858688(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GCGCCACCGACACAG
SmilChr04G002298 Chr04 NC_080390.1:37237978-37237992promoter 内 3467-3481 bp + 520 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 37230755-37237458(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 ACGCCACCGACACCT
SmilChr01G003446 Chr01 NC_080387.1:53026611-53026625promoter 内 3323-3337 bp - 664 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 53027289-53033056(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCACCACCGACACCT
SmilChr01G003507 Chr01 NC_080387.1:53646911-53646925promoter 内 3297-3311 bp - 690 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 53647615-53653795(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCACCACCGACACCT
SmilChr08G001148 Chr08 NC_080394.1:9058002-9058016promoter 内 1754-1768 bp - 2233 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 3 9053507-9055769(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TGGTGTCGGTGGCGT
SmilChr08G002488 Chr08 NC_080394.1:23785940-23785954promoter 内 2424-2438 bp + 1563 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 23787517-23789223(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TGTTGTCGGTGGCGG
SmilChr04G000411 Chr04 NC_080390.1:4286677-4286691promoter 内 813-827 bp + 3174 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 4289865-4291808(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CGTTGTCGGCGGCGG
SmilChr04G003549 Chr04 NC_080390.1:51825808-51825822promoter 内 591-605 bp + 3396 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 1 51829218-51840224(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TGGTGTCGGTGGCGT
SmilChr02G002458 Chr02 NC_080388.1:42873512-42873526promoter 内 1797-1811 bp + 2190 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 3 42869922-42871322(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCGGCACCGACACCG
SmilChr02G000356 Chr02 NC_080388.1:4592281-4592295promoter 内 1654-1668 bp + 2333 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 3 4594628-4601151(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TGCTGTCGGTGGCGG
SmilChr04G004072 Chr04 NC_080390.1:55812353-55812367promoter 内 2825-2839 bp + 1162 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 55813529-55815622(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 AGGTGTCGGTGGCGA
SmilChr07G002817 Chr07 NC_080393.1:28210783-28210797promoter 内 1379-1393 bp - 2608 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 28213405-28215417(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCGCCACCGACATCG
SmilChr01G002276 Chr01 NC_080387.1:39523249-39523263promoter 内 1203-1217 bp + 2784 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 39526047-39527688(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TGCTGTCGGTGGCGG
SmilChr04G000664 Chr04 NC_080390.1:7506027-7506041promoter 内 521-535 bp + 3466 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 7500051-7502561(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCACCACCGACAGCG
SmilChr04G002533 Chr04 NC_080390.1:40425234-40425248promoter 内 149-163 bp - 3838 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 40429086-40434077(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GCACCACCGACACCG
SmilChr04G000741 Chr04 NC_080390.1:9107194-9107208promoter 内 555-569 bp - 3432 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 3 9101059-9103762(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CGGCGTCGGTGGAGG
SmilChr04G000675 Chr04 NC_080390.1:7707526-7707540promoter 内 3855-3869 bp - 132 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 1 7707672-7708575(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCTCCACCGACGCCG
SmilChr08G001762 Chr08 NC_080394.1:14843679-14843693promoter 内 3400-3414 bp + 587 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 1 14837264-14843092(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCTCCACCGACGCCG
SmilChr03G002915 Chr03 NC_080389.1:45904580-45904594promoter 内 3276-3290 bp + 711 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 1 45905305-45905967(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CGGCGTCGGTGGAGG
SmilChr02G000694 Chr02 NC_080388.1:11032042-11032056promoter 内 3102-3116 bp - 885 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 1 11032941-11043944(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCTCCACCGACGCCG
SmilChr03G002695 Chr03 NC_080389.1:42939148-42939162promoter 内 3083-3097 bp + 904 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 1 42936360-42938244(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCTCCACCGACGCCG
SmilChr05G003035 Chr05 NC_080391.1:38046552-38046566promoter 内 3040-3054 bp + 947 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 1 38042036-38045605(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCTCCACCGACGCCG
SmilChr02G001881 Chr02 NC_080388.1:34126471-34126485promoter 内 2967-2981 bp - 1020 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 1 34127505-34128953(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCTCCACCGACGCCG
SmilChr01G003428 Chr01 NC_080387.1:52940633-52940647promoter 内 2537-2551 bp - 1450 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 1 52942097-52942661(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCTCCACCGACGCCG
SmilChr08G002376 Chr08 NC_080394.1:22554691-22554705promoter 内 2345-2359 bp + 1642 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 1 22549680-22553049(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCTCCACCGACGCCG
SmilChr01G001444 Chr01 NC_080387.1:28139668-28139682promoter 内 2119-2133 bp + 1868 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 1 28136280-28137800(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCTCCACCGACGCCG
SmilChr01G003429 Chr01 NC_080387.1:52940633-52940647promoter 内 1872-1886 bp - 2115 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 1 52942762-52943529(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCTCCACCGACGCCG
SmilChr04G003658 Chr04 NC_080390.1:53063157-53063171promoter 内 1790-1804 bp - 2197 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 1 53065368-53066314(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCGCCACCGACACGT
SmilChr08G001763 Chr08 NC_080394.1:14843679-14843693promoter 内 1246-1260 bp + 2741 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 1 14846434-14850099(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CGGCGTCGGTGGAGG
SmilChr02G002552 Chr02 NC_080388.1:44417304-44417318promoter 内 1231-1245 bp + 2756 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 1 44412869-44414548(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCTCCACCGACGCCG
SmilChr01G000647 Chr01 NC_080387.1:14452453-14452467promoter 内 1097-1111 bp - 2890 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 1 14448406-14449563(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CGGCGTCGGTGGAGG
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SmilChr04G001674 Chr04 NC_080390.1:27758551-27758565promoter 内 969-983 bp - 3018 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 1 27748707-27755533(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CGGCGTCGGTGGAGG
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SmilChr07G004028 Chr07 NC_080393.1:51408461-51408475promoter 内 3818-3832 bp - 169 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 51407350-51408292(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 AGGCGTCGGTGGCGG
SmilChr06G001152 Chr06 NC_080392.1:11661160-11661174promoter 内 2930-2944 bp - 1057 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 11662231-11664586(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCGCCACCGACGCCT