转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr07G002147; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004577-RA_Salv SmilChr07G002147 MYB XP_057774045.1 MP00500 AATATGGATAAGG

可能结合的靶基因

9681 个结合位点 6697 个候选靶基因 第 1 / 134 下载 TSV

1 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G000096 Chr01 NC_080387.1:1701005-1701017promoter 内 2477-2489 bp + 1512 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.6/ 100 3 1702529-1704456(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GAAGTGGATAAGG
SmilChr01G000085 Chr01 NC_080387.1:1596473-1596485promoter 内 2387-2399 bp + 1602 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.6/ 100 3 1598087-1599924(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GAAGTGGATAAGG
SmilChr02G001494 Chr02 NC_080388.1:27888744-27888756promoter 内 2541-2553 bp - 1448 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.6/ 100 2 27886473-27887296(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GATGAGGATAAGG
SmilChr01G004123 Chr01 NC_080387.1:59729981-59729993promoter 内 2258-2270 bp + 1731 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.6/ 100 2 59731724-59733088(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GATGAGGATAAGG
SmilChr01G004803 Chr01 NC_080387.1:66242886-66242898promoter 内 2118-2130 bp + 1871 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.6/ 100 2 66237564-66241015(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCTCATC
SmilChr02G000591 Chr02 NC_080388.1:8463825-8463837promoter 内 1971-1983 bp + 2018 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.6/ 100 2 8465855-8466898(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GAAGTGGATAAGG
SmilChr01G004141 Chr01 NC_080387.1:59913637-59913649promoter 内 1904-1916 bp + 2085 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.6/ 100 2 59900126-59911552(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCACTTC
SmilChr03G002248 Chr03 NC_080389.1:35408429-35408441promoter 内 1855-1867 bp + 2134 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.6/ 100 2 35410575-35412657(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GATGAGGATAAGG
SmilChr01G004121 Chr01 NC_080387.1:59729981-59729993promoter 内 1363-1375 bp + 2626 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.6/ 100 2 59724107-59727355(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCTCATC
SmilChr01G001611 Chr01 NC_080387.1:30259600-30259612promoter 内 1151-1163 bp - 2838 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.6/ 100 2 30255606-30256762(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GATGAGGATAAGG
SmilChr01G000200 Chr01 NC_080387.1:3437613-3437625promoter 内 352-364 bp - 3637 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.6/ 100 2 3441262-3444125(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCTCATC
SmilChr02G002727 Chr02 NC_080388.1:47201554-47201566promoter 内 199-211 bp - 3790 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.6/ 100 2 47190273-47197764(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GATGAGGATAAGG
SmilChr02G000032 Chr02 NC_080388.1:392208-392220promoter 内 2974-2986 bp - 1015 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.6/ 100 1 393235-397954(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCACTTC
SmilChr01G000591 Chr01 NC_080387.1:12876850-12876862promoter 内 2908-2920 bp + 1081 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.6/ 100 1 12877943-12878883(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GAAGTGGATAAGG
SmilChr01G005920 Chr01 NC_080387.1:75033023-75033035promoter 内 2884-2896 bp - 1105 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.6/ 100 1 75030558-75031918(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GATGAGGATAAGG
SmilChr01G000084 Chr01 NC_080387.1:1596473-1596485promoter 内 2763-2775 bp + 1226 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.6/ 100 1 1589839-1595247(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCACTTC
SmilChr01G000586 Chr01 NC_080387.1:12669310-12669322promoter 内 2351-2363 bp - 1638 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.6/ 100 1 12667289-12667672(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GAAGTGGATAAGG
SmilChr01G003564 Chr01 NC_080387.1:54230400-54230412promoter 内 2081-2093 bp + 1908 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.6/ 100 1 54232320-54235647(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GAAGTGGATAAGG
SmilChr01G000854 Chr01 NC_080387.1:18413987-18413999promoter 内 2072-2084 bp + 1917 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.6/ 100 1 18415916-18419064(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GATGAGGATAAGG
SmilChr01G000402 Chr01 NC_080387.1:8221896-8221908promoter 内 1712-1724 bp - 2277 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.6/ 100 1 8224185-8226475(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCACTTC
SmilChr01G005959 Chr01 NC_080387.1:75303250-75303262promoter 内 1608-1620 bp + 2381 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.6/ 100 1 75305643-75308359(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GATGAGGATAAGG
SmilChr02G000863 Chr02 NC_080388.1:14822809-14822821promoter 内 1116-1128 bp - 2873 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.6/ 100 1 14819324-14819936(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GAAGTGGATAAGG
SmilChr02G002669 Chr02 NC_080388.1:46211003-46211015promoter 内 584-596 bp + 3405 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.6/ 100 1 46195215-46207598(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCACTTC
SmilChr01G003563 Chr01 NC_080387.1:54230400-54230412promoter 内 290-302 bp + 3699 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.6/ 100 1 54224244-54226701(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCACTTC
SmilChr02G004230 Chr02 NC_080388.1:64494691-64494703promoter 内 78-90 bp + 3911 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.6/ 100 1 64498614-64500758(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GATGAGGATAAGG
SmilChr03G001969 Chr03 NC_080389.1:28367066-28367078promoter 内 1738-1750 bp + 2251 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 3 28369329-28369772(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GTTGTGGATAAGG
SmilChr02G004670 Chr02 NC_080388.1:69057080-69057092promoter 内 2921-2933 bp + 1068 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 2 69053031-69056012(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCACAAC
SmilChr02G003471 Chr02 NC_080388.1:56013429-56013441promoter 内 14-26 bp + 3975 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 1 56017416-56023072(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GTTGTGGATAAGG
SmilChr01G003718 Chr01 NC_080387.1:55516629-55516641promoter 内 3100-3112 bp - 889 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 4 55517530-55519386(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCATATC
SmilChr02G005223 Chr02 NC_080388.1:73442528-73442540promoter 内 2038-2050 bp - 1951 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 3 73444491-73453091(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCTCTTC
SmilChr01G002069 Chr01 NC_080387.1:36564057-36564069promoter 内 2251-2263 bp - 1738 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 2 36559137-36562319(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GTAGTGGATAAGG
SmilChr02G003608 Chr02 NC_080388.1:57322383-57322395promoter 内 1208-1220 bp + 2781 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 2 57314820-57319602(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCACATT
SmilChr02G001976 Chr02 NC_080388.1:35723278-35723290promoter 内 3741-3753 bp + 248 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 1 35723538-35723879(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AATGTGGATAAGG
SmilChr02G001975 Chr02 NC_080388.1:35723278-35723290promoter 内 2870-2882 bp + 1119 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 1 35719848-35722159(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCACATT
SmilChr01G005448 Chr01 NC_080387.1:71549603-71549615promoter 内 1553-1565 bp - 2436 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 1 71552051-71552827(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCATATC
SmilChr01G003719 Chr01 NC_080387.1:55516629-55516641promoter 内 1102-1114 bp - 2887 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 1 55519528-55523997(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCATATC
SmilChr02G002092 Chr02 NC_080388.1:37554375-37554387promoter 内 727-739 bp - 3262 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 1 37557649-37560198(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCTCTTC
SmilChr02G001974 Chr02 NC_080388.1:35723278-35723290promoter 内 258-270 bp + 3731 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 1 35718038-35719547(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCACATT
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SmilChr02G002724 Chr02 NC_080388.1:47136974-47136986promoter 内 3926-3938 bp + 63 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 2 47137049-47139241(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GGTGTGGATAAGG
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SmilChr02G002200 Chr02 NC_080388.1:39233940-39233952promoter 内 253-265 bp + 3736 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 3 39230132-39230204(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCTCATT
SmilChr01G005564 Chr01 NC_080387.1:72445898-72445910promoter 内 213-225 bp + 3776 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 3 72440327-72442122(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCAAATC
SmilChr02G005507 Chr02 NC_080388.1:75194603-75194615promoter 内 3576-3588 bp + 413 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 2 75195028-75198078(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GATTTGGATAAGG