转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G002885; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00022980-RA_Salv SmilChr01G002885 ERF XP_057767601.1 MP00151 ATGGACGGTGGAGG

可能结合的靶基因

9976 个结合位点 6907 个候选靶基因 第 101 / 139 下载 TSV

上一页 101 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G002683 Chr03 NC_080389.1:42601980-42601993promoter 内 1518-1531 bp + 2470 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 42604463-42611829(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GTCGACGGTGGTGT
SmilChr01G001692 Chr01 NC_080387.1:31146513-31146526promoter 内 1455-1468 bp + 2533 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 31142274-31143980(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 AGTGCGCCGTCCAC
SmilChr04G001547 Chr04 NC_080390.1:25573288-25573301promoter 内 1365-1378 bp + 2623 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 25575924-25578550(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GTTGACGGTGAGAG
SmilChr06G002972 Chr06 NC_080392.1:42551417-42551430promoter 内 1328-1341 bp + 2660 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 42554090-42556657(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CTGGACGGCGATCG
SmilChr01G001182 Chr01 NC_080387.1:23882830-23882843promoter 内 1286-1299 bp - 2702 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 23866677-23880128(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ATGGACGGCGTCTA
SmilChr05G000565 Chr05 NC_080391.1:4254599-4254612promoter 内 1284-1297 bp - 2704 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 4250011-4251895(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TTCGACGGTGGAGA
SmilChr03G000074 Chr03 NC_080389.1:911766-911779promoter 内 1136-1149 bp + 2852 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 914631-920110(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GAGGACGGTTGCGA
SmilChr05G001920 Chr05 NC_080391.1:19474903-19474916promoter 内 1136-1149 bp - 2852 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 19465429-19472051(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GGCGACGGTGGCGC
SmilChr04G002233 Chr04 NC_080390.1:36043776-36043789promoter 内 1117-1130 bp + 2871 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 36046660-36053627(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GTCGACGGTGGTTG
SmilChr04G001545 Chr04 NC_080390.1:25573288-25573301promoter 内 977-990 bp + 3011 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 25568897-25570277(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CTCTCACCGTCAAC
SmilChr05G002268 Chr05 NC_080391.1:24399059-24399072promoter 内 802-815 bp + 3186 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 24390986-24395873(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CAGACGCCGTCCAG
SmilChr04G001689 Chr04 NC_080390.1:27942899-27942912promoter 内 786-799 bp + 3202 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 27936161-27939697(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TCTCCACCGTCGAA
SmilChr01G001175 Chr01 NC_080387.1:23810298-23810311promoter 内 671-684 bp + 3317 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 23813628-23815370(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ATGGACGGTGCACC
SmilChr02G002553 Chr02 NC_080388.1:44422100-44422113promoter 内 530-543 bp - 3458 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 44425571-44436481(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TTCACACCGTCCAC
SmilChr01G000875 Chr01 NC_080387.1:18621752-18621765promoter 内 514-527 bp + 3474 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 18625239-18626543(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GTAGTCGGTGGAAG
SmilChr03G002924 Chr03 NC_080389.1:45999599-45999612promoter 内 446-459 bp - 3542 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 46003154-46019684(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CAACCTCCGTCCAA
SmilChr01G002259 Chr01 NC_080387.1:39386773-39386786promoter 内 402-415 bp + 3586 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 39380525-39383187(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GAGTCGCCGTCCAG
SmilChr05G000985 Chr05 NC_080391.1:7980801-7980814promoter 内 188-201 bp + 3800 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 7976363-7977001(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TCATCACCGTCAAT
SmilChr01G005785 Chr01 NC_080387.1:73947331-73947344promoter 内 159-172 bp + 3829 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 73940626-73943502(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CTCTCACCGTCAAC
SmilChr07G000645 Chr07 NC_080393.1:4346795-4346808promoter 内 44-57 bp + 3944 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 4339941-4342851(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GCGTCACCGTCATC
SmilChr01G000546 Chr01 NC_080387.1:11272503-11272516promoter 内 3591-3604 bp - 397 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 11270593-11272106(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 AGAGACGGTGGTGG
SmilChr02G004605 Chr02 NC_080388.1:68558386-68558399promoter 内 3587-3600 bp + 401 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 68558800-68560419(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 AATGACGGTGAAGG
SmilChr01G002197 Chr01 NC_080387.1:38119687-38119700promoter 内 3219-3232 bp - 769 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 38120469-38123859(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CGGTCTCCGTCCAC
SmilChr01G006062 Chr01 NC_080387.1:76051323-76051336promoter 内 2006-2019 bp + 1982 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 76053318-76053403(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GATGTCGGTGGAAG
SmilChr06G002005 Chr06 NC_080392.1:25722879-25722892promoter 内 1558-1571 bp + 2430 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 25725322-25727894(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GAAGACGGTGGAGA
SmilChr05G001003 Chr05 NC_080391.1:8202207-8202220promoter 内 1345-1358 bp - 2643 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 8204863-8207199(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CTCCAGCCGTCCAC
SmilChr06G002215 Chr06 NC_080392.1:30986916-30986929promoter 内 137-150 bp + 3851 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 30990780-30994656(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ATGGGCGGTGGATT
SmilChr05G002205 Chr05 NC_080391.1:23518084-23518097promoter 内 3974-3987 bp - 14 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 23518111-23519943(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TTGCCTCCGTCCAA
SmilChr02G003883 Chr02 NC_080388.1:60891231-60891244promoter 内 3890-3903 bp + 98 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 60886579-60891133(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TCCCAACCGTCCAT
SmilChr04G002678 Chr04 NC_080390.1:42215844-42215857promoter 内 3719-3732 bp + 269 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 42216126-42218986(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GTGGACGGAGGGTC
SmilChr02G001365 Chr02 NC_080388.1:25722697-25722710promoter 内 3498-3511 bp - 490 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 25723200-25723790(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CTTCCACCGTCTAT
SmilChr02G003347 Chr02 NC_080388.1:54681630-54681643promoter 内 3380-3393 bp - 608 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 54682251-54684804(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GCGTCTCCGTCCAA
SmilChr06G003068 Chr06 NC_080392.1:43577934-43577947promoter 内 3354-3367 bp - 634 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 43576080-43577300(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TTGGACGGCGTTAG
SmilChr06G002107 Chr06 NC_080392.1:28149296-28149309promoter 内 3333-3346 bp - 655 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 28147321-28148641(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 AGAGACGGTGGTGG
SmilChr06G002108 Chr06 NC_080392.1:28158677-28158690promoter 内 3333-3346 bp - 655 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 28156702-28158022(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 AGAGACGGTGGTGG
SmilChr03G003226 Chr03 NC_080389.1:49937425-49937438promoter 内 3291-3304 bp + 697 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 49938135-49940369(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ATAGACGGTGGAAG
SmilChr06G002106 Chr06 NC_080392.1:28139913-28139926promoter 内 3155-3168 bp - 833 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 28137937-28139080(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 AGAGACGGTGGTGG
SmilChr07G000095 Chr07 NC_080393.1:517202-517215promoter 内 3106-3119 bp - 882 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 516250-516320(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 AGTGGCGGTGGAGG
SmilChr03G001025 Chr03 NC_080389.1:11912714-11912727promoter 内 3089-3102 bp - 899 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 11910604-11911815(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 AGAGACGGTGGTGG
SmilChr06G002586 Chr06 NC_080392.1:37072195-37072208promoter 内 3004-3017 bp + 984 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 37065944-37071211(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CCACCACCGTCTCT
SmilChr03G001263 Chr03 NC_080389.1:14602125-14602138promoter 内 2970-2983 bp + 1018 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 14598107-14601107(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TCTCCACCGTCTTC
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SmilChr07G001375 Chr07 NC_080393.1:10679620-10679633promoter 内 2817-2830 bp - 1171 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 10674834-10678449(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TTGGACGGAGCCGA
SmilChr06G002963 Chr06 NC_080392.1:42410030-42410043promoter 内 2750-2763 bp + 1238 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 42405206-42408792(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CCTCCACCGCCACT
SmilChr01G001306 Chr01 NC_080387.1:26013292-26013305promoter 内 2724-2737 bp + 1264 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 26006197-26012028(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CGGCCACCGTCATT
SmilChr03G004135 Chr03 NC_080389.1:60193255-60193268promoter 内 2706-2719 bp - 1282 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 60188638-60191973(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ATGGACGGCTGTGA
SmilChr01G004202 Chr01 NC_080387.1:60485844-60485857promoter 内 2578-2591 bp - 1410 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 60483973-60484434(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CTGGACGGCGTTGC