转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 102 / 149 下载 TSV

上一页 102 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G003525 Chr04 NC_080390.1:51631123-51631133promoter 内 74-84 bp - 3917 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 51635050-51636032(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTTTT
SmilChr06G000817 Chr06 NC_080392.1:7698784-7698794promoter 内 55-65 bp - 3936 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 7692165-7694848(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTGAGCTGTCG
SmilChr04G003582 Chr04 NC_080390.1:52236439-52236449promoter 内 52-62 bp + 3939 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 52240388-52242144(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGAT
SmilChr04G000096 Chr04 NC_080390.1:867979-867989promoter 内 44-54 bp - 3947 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 871936-875416(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGGCAGCTGGA
SmilChr01G000213 Chr01 NC_080387.1:3762687-3762697promoter 内 39-49 bp + 3952 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 3766649-3767632(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGAT
SmilChr02G004535 Chr02 NC_080388.1:67905648-67905658promoter 内 30-40 bp - 3961 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 67909619-67911240(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTTC
SmilChr03G003122 Chr03 NC_080389.1:48385588-48385598promoter 内 10-20 bp - 3981 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 48379685-48381607(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGAT
SmilChr03G001829 Chr03 NC_080389.1:25066223-25066233promoter 内 1419-1429 bp + 2572 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 3 25063548-25063651(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTCAG
SmilChr06G002906 Chr06 NC_080392.1:41865598-41865608promoter 内 672-682 bp - 3319 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 3 41858253-41862279(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAAAGCTGTCT
SmilChr05G001927 Chr05 NC_080391.1:19557355-19557365promoter 内 3895-3905 bp - 96 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 19557461-19560655(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCAA
SmilChr04G002065 Chr04 NC_080390.1:33377718-33377728promoter 内 3838-3848 bp - 153 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 33375366-33377565(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTGGGCTGTCA
SmilChr01G002133 Chr01 NC_080387.1:37321770-37321780promoter 内 3789-3799 bp + 202 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 37316020-37321568(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCAA
SmilChr01G001041 Chr01 NC_080387.1:21642597-21642607promoter 内 3490-3500 bp - 501 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 21637958-21642096(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGGAC
SmilChr01G005057 Chr01 NC_080387.1:68491213-68491223promoter 内 3373-3383 bp - 618 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 68491841-68495297(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCAA
SmilChr01G001520 Chr01 NC_080387.1:29117687-29117697promoter 内 2509-2519 bp - 1482 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 29114737-29116205(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGGAC
SmilChr03G001662 Chr03 NC_080389.1:21554319-21554329promoter 内 1915-1925 bp - 2076 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 21549798-21552243(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAGAGCTGTCT
SmilChr01G000346 Chr01 NC_080387.1:7057416-7057426promoter 内 1653-1663 bp + 2338 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 7059764-7061098(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAAAGCTGTCT
SmilChr03G001754 Chr03 NC_080389.1:23818796-23818806promoter 内 943-953 bp + 3048 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 23821854-23824307(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAGAGCTGTCT
SmilChr06G002136 Chr06 NC_080392.1:28930666-28930676promoter 内 835-845 bp + 3156 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 28933832-28933938(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGGAC
SmilChr01G005393 Chr01 NC_080387.1:71205618-71205628promoter 内 645-655 bp + 3346 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 71208974-71214212(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAGAGCTGTCT
SmilChr04G001365 Chr04 NC_080390.1:22172718-22172728promoter 内 598-608 bp - 3393 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 22167772-22169325(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAGAGCTGTCT
SmilChr02G003346 Chr02 NC_080388.1:54673250-54673260promoter 内 510-520 bp + 3481 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 54676741-54680443(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCAGCTGTAA
SmilChr01G001707 Chr01 NC_080387.1:31506060-31506070promoter 内 364-374 bp - 3627 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 31496041-31502433(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTGGGCTGTCA
SmilChr03G000555 Chr03 NC_080389.1:6013698-6013708promoter 内 309-319 bp - 3682 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 6006474-6010016(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGGAC
SmilChr04G001555 Chr04 NC_080390.1:25744203-25744213promoter 内 305-315 bp + 3686 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 25739893-25740517(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTCCAGCTGGA
SmilChr03G001320 Chr03 NC_080389.1:15457093-15457103promoter 内 60-70 bp - 3931 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 15461034-15462749(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTACAGCTGAG
SmilChr05G001362 Chr05 NC_080391.1:12116289-12116299promoter 内 3977-3987 bp - 14 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 12108986-12116275(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCAGCTGTAA
SmilChr02G001938 Chr02 NC_080388.1:34831919-34831929promoter 内 3960-3970 bp + 31 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 34831960-34835432(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCAGCTGTAA
SmilChr01G000876 Chr01 NC_080387.1:18626904-18626914promoter 内 3891-3901 bp - 100 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 18627014-18632149(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCAA
SmilChr04G002062 Chr04 NC_080390.1:33363068-33363078promoter 内 3884-3894 bp + 107 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 33363185-33367784(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTGGGCTGTCA
SmilChr02G004050 Chr02 NC_080388.1:62835371-62835381promoter 内 3873-3883 bp - 118 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 62833526-62835253(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAAAGCTGTCT
SmilChr02G003248 Chr02 NC_080388.1:53744943-53744953promoter 内 3813-3823 bp - 178 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 53743126-53744765(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TAGAGCTGTCG
SmilChr03G001956 Chr03 NC_080389.1:27967036-27967046promoter 内 3711-3721 bp + 280 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 27967326-27967778(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAAAGCTGTCT
SmilChr05G001363 Chr05 NC_080391.1:12116289-12116299promoter 内 3661-3671 bp - 330 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 12113929-12115959(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCAGCTGTAA
SmilChr01G003230 Chr01 NC_080387.1:51077509-51077519promoter 内 3602-3612 bp - 389 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 51075306-51077120(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTGGGCTGTCA
SmilChr04G001385 Chr04 NC_080390.1:22521004-22521014promoter 内 3561-3571 bp + 430 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 22521444-22523065(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAGAGCTGTCT
SmilChr04G001959 Chr04 NC_080390.1:31792126-31792136promoter 内 3549-3559 bp - 442 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 31792578-31795541(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTCTC
SmilChr05G001508 Chr05 NC_080391.1:13839254-13839264promoter 内 3537-3547 bp - 454 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 13839718-13844321(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTTG
SmilChr01G003137 Chr01 NC_080387.1:50161875-50161885promoter 内 3459-3469 bp + 532 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 50162417-50164538(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCAGCTGTAA
SmilChr03G002161 Chr03 NC_080389.1:33648007-33648017promoter 内 3446-3456 bp + 545 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 33648562-33653721(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAGAGCTGTCT
SmilChr04G003358 Chr04 NC_080390.1:50183174-50183184promoter 内 3445-3455 bp + 546 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 50183730-50186953(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTGAGCTGTCG
SmilChr02G004440 Chr02 NC_080388.1:66769769-66769779promoter 内 3440-3450 bp + 551 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 66770330-66774028(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTGGGCTGTCA
SmilChr05G003582 Chr05 NC_080391.1:47850961-47850971promoter 内 3423-3433 bp - 568 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 47851539-47854876(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTCTC
SmilChr04G000035 Chr04 NC_080390.1:335560-335570promoter 内 3403-3413 bp - 588 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 332948-334972(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAGAGCTGTCT
SmilChr01G004073 Chr01 NC_080387.1:59134744-59134754promoter 内 3387-3397 bp - 604 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 59127187-59134140(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTGGGCTGTCA
SmilChr03G002342 Chr03 NC_080389.1:36925250-36925260promoter 内 3371-3381 bp - 620 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 36920193-36924630(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAAAGCTGTCT
SmilChr02G000192 Chr02 NC_080388.1:2410234-2410244promoter 内 3311-3321 bp - 680 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 2410924-2412487(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCAA
SmilChr04G001958 Chr04 NC_080390.1:31792126-31792136promoter 内 3238-3248 bp - 753 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 31790335-31791373(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAGAGCTGTCT
SmilChr01G005133 Chr01 NC_080387.1:69134236-69134246promoter 内 3158-3168 bp + 833 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 69131839-69133403(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTTG
SmilChr05G000273 Chr05 NC_080391.1:2117034-2117044promoter 内 3109-3119 bp - 882 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 2117926-2122041(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTCTC