转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 103 / 149 下载 TSV

上一页 103 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr06G000350 Chr06 NC_080392.1:2643499-2643509promoter 内 3104-3114 bp - 887 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 2644396-2651485(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTCTC
SmilChr04G003741 Chr04 NC_080390.1:53719336-53719346promoter 内 3058-3068 bp - 933 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 53716410-53718403(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTGGGCTGTCA
SmilChr06G000706 Chr06 NC_080392.1:6338543-6338553promoter 内 3045-3055 bp - 946 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 6334841-6337597(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTGGGCTGTCA
SmilChr05G004089 Chr05 NC_080391.1:54743799-54743809promoter 内 2984-2994 bp - 1007 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 54739566-54742792(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TAGAGCTGTCG
SmilChr04G001777 Chr04 NC_080390.1:29197126-29197136promoter 内 2874-2884 bp + 1117 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 29195041-29196009(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTTG
SmilChr05G000016 Chr05 NC_080391.1:72076-72086promoter 内 2864-2874 bp + 1127 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 68838-70949(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTTG
SmilChr01G002412 Chr01 NC_080387.1:41482809-41482819promoter 内 2796-2806 bp - 1195 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 41484014-41484626(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTTG
SmilChr02G000315 Chr02 NC_080388.1:3972366-3972376promoter 内 2784-2794 bp - 1207 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 3973583-3976334(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCAA
SmilChr07G002918 Chr07 NC_080393.1:29559583-29559593promoter 内 2710-2720 bp - 1281 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 29560874-29563161(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCAA
SmilChr03G003535 Chr03 NC_080389.1:53962942-53962952promoter 内 2684-2694 bp - 1307 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 53951902-53961635(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCAGCTGTAA
SmilChr03G004423 Chr03 NC_080389.1:62397982-62397992promoter 内 2617-2627 bp - 1374 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 62394783-62396608(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCAGCTGTAA
SmilChr05G003210 Chr05 NC_080391.1:41152863-41152873promoter 内 2581-2591 bp + 1410 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 41154283-41155149(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAGAGCTGTCT
SmilChr05G003930 Chr05 NC_080391.1:53061692-53061702promoter 内 2546-2556 bp + 1445 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 53059032-53060247(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTTG
SmilChr04G000516 Chr04 NC_080390.1:5674818-5674828promoter 内 2506-2516 bp - 1485 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 5670757-5673333(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TAGAGCTGTCG
SmilChr03G002124 Chr03 NC_080389.1:33021922-33021932promoter 内 2482-2492 bp + 1509 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 33019287-33020413(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCAA
SmilChr02G000436 Chr02 NC_080388.1:5701151-5701161promoter 内 2468-2478 bp + 1523 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 5697018-5699628(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCAA
SmilChr05G003919 Chr05 NC_080391.1:52947493-52947503promoter 内 2323-2333 bp + 1668 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 52949171-52957577(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCAGCTGTAA
SmilChr01G000974 Chr01 NC_080387.1:20602580-20602590promoter 内 2260-2270 bp + 1731 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 20596198-20600849(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCAA
SmilChr03G003536 Chr03 NC_080389.1:53962942-53962952promoter 内 2259-2269 bp - 1732 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 53964684-53974120(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTACAGCTGAG
SmilChr06G002807 Chr06 NC_080392.1:40783612-40783622promoter 内 2234-2244 bp - 1757 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 40780705-40781855(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTGAGCTGTCG
SmilChr03G001955 Chr03 NC_080389.1:27967036-27967046promoter 内 2212-2222 bp + 1779 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 27951797-27965257(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTTG
SmilChr07G001246 Chr07 NC_080393.1:9548558-9548568promoter 内 2167-2177 bp - 1824 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 9550392-9551038(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTACAGCTGAG
SmilChr01G000868 Chr01 NC_080387.1:18551088-18551098promoter 内 2159-2169 bp - 1832 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 18548401-18549256(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTGAGCTGTCG
SmilChr01G005019 Chr01 NC_080387.1:68187135-68187145promoter 内 2151-2161 bp + 1840 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 68182488-68185295(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTCTC
SmilChr04G002284 Chr04 NC_080390.1:37094118-37094128promoter 内 2124-2134 bp + 1867 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 37089830-37092251(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCAA
SmilChr07G002257 Chr07 NC_080393.1:20759438-20759448promoter 内 2091-2101 bp + 1900 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 20751363-20757538(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTTG
SmilChr01G005056 Chr01 NC_080387.1:68491213-68491223promoter 内 2077-2087 bp - 1914 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 68486364-68489299(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTGGGCTGTCA
SmilChr04G001371 Chr04 NC_080390.1:22271973-22271983promoter 内 1936-1946 bp - 2055 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 22251609-22269918(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TAGAGCTGTCG
SmilChr04G001366 Chr04 NC_080390.1:22172718-22172728promoter 内 1840-1850 bp - 2151 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 22174879-22175848(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTCTC
SmilChr04G002141 Chr04 NC_080390.1:34427391-34427401promoter 内 1822-1832 bp - 2169 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 34429570-34437474(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTCTA
SmilChr04G001776 Chr04 NC_080390.1:29197126-29197136promoter 内 1802-1812 bp + 2189 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 29193652-29194937(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTTG
SmilChr04G004136 Chr04 NC_080390.1:56168411-56168421promoter 内 1739-1749 bp - 2252 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 56161622-56166159(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TAGAGCTGTCG
SmilChr05G001264 Chr05 NC_080391.1:10772099-10772109promoter 内 1694-1704 bp + 2297 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 10774406-10778654(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCAGCTGTAA
SmilChr05G002832 Chr05 NC_080391.1:33653253-33653263promoter 内 1694-1704 bp - 2297 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 33646582-33650956(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAAAGCTGTCT
SmilChr05G004168 Chr05 NC_080391.1:55592868-55592878promoter 内 1547-1557 bp - 2444 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 55587514-55590424(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCAGCTGTAA
SmilChr04G002657 Chr04 NC_080390.1:41964342-41964352promoter 内 1537-1547 bp - 2454 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 41966806-41972197(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCAA
SmilChr05G002265 Chr05 NC_080391.1:24364762-24364772promoter 内 1532-1542 bp + 2459 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 24357252-24362303(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTACAGCTGAG
SmilChr02G000193 Chr02 NC_080388.1:2410234-2410244promoter 内 1464-1474 bp - 2527 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 2412771-2413870(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCAA
SmilChr03G004265 Chr03 NC_080389.1:61131577-61131587promoter 内 1460-1470 bp - 2531 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 61134118-61138266(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTCTA
SmilChr03G002689 Chr03 NC_080389.1:42766662-42766672promoter 内 1387-1397 bp - 2604 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 42769276-42770620(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTTG
SmilChr02G002628 Chr02 NC_080388.1:45640643-45640653promoter 内 1367-1377 bp + 2624 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 45635359-45638019(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTACAGCTGAG
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SmilChr04G000034 Chr04 NC_080390.1:335560-335570promoter 内 1110-1120 bp - 2881 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 331538-332679(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAGAGCTGTCT
SmilChr05G003653 Chr05 NC_080391.1:49145756-49145766promoter 内 1108-1118 bp + 2883 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 49140235-49142873(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTCAG
SmilChr05G000018 Chr05 NC_080391.1:72076-72086promoter 内 983-993 bp + 3008 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 75094-79727(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAAAGCTGTCT
SmilChr02G005542 Chr02 NC_080388.1:75426124-75426134promoter 内 940-950 bp + 3051 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 75429185-75435963(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAGAGCTGTCT
SmilChr05G001042 Chr05 NC_080391.1:8528874-8528884promoter 内 938-948 bp + 3053 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 8531937-8532604(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCAGCTGTAA
SmilChr03G002563 Chr03 NC_080389.1:40838025-40838035promoter 内 902-912 bp + 3089 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 40832043-40834936(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTCTC
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