转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G004009; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00018864-RA_Salv SmilChr05G004009 MYB XP_057810662.1 MP00216 AAAAAAGTTAGGTAG

可能结合的靶基因

9832 个结合位点 7342 个候选靶基因 第 107 / 147 下载 TSV

上一页 107 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G004286 Chr01 NC_080387.1:61074455-61074469promoter 内 1093-1107 bp - 2894 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 61077363-61166893(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TGGCCTAACTGGCAA
SmilChr03G000544 Chr03 NC_080389.1:5903517-5903531promoter 内 1082-1096 bp + 2905 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 5906436-5914549(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TCTAGGGTTAGGTTT
SmilChr01G004642 Chr01 NC_080387.1:64454539-64454553promoter 内 1076-1090 bp - 2911 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 64457464-64462184(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TTACCTAAGTTCAGA
SmilChr02G004701 Chr02 NC_080388.1:69320023-69320037promoter 内 960-974 bp - 3027 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 69323064-69328271(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 ATACCTAAATTGTCG
SmilChr03G003484 Chr03 NC_080389.1:53411812-53411826promoter 内 955-969 bp - 3032 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 53414858-53417863(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TGACCTAACATTGAG
SmilChr04G001581 Chr04 NC_080390.1:26293084-26293098promoter 内 952-966 bp + 3035 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 26296133-26297296(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TCTGAACTTAGGTAA
SmilChr03G003482 Chr03 NC_080389.1:53381588-53381602promoter 内 909-923 bp - 3078 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 53375085-53378510(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 GTGTGTGTTAGGTGA
SmilChr02G002757 Chr02 NC_080388.1:47609189-47609203promoter 内 895-909 bp - 3092 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 47612295-47615093(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 ATACCTAACGAATTT
SmilChr01G002441 Chr01 NC_080387.1:41988684-41988698promoter 内 877-891 bp + 3110 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 41991808-41992807(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 GCATCAATTAGGTAT
SmilChr01G001869 Chr01 NC_080387.1:33684645-33684659promoter 内 833-847 bp - 3154 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 33680262-33681491(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TAAACAATTAGGTAA
SmilChr02G000960 Chr02 NC_080388.1:16739127-16739141promoter 内 780-794 bp + 3207 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 16742348-16754621(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TCGGTGGTTAGGTTA
SmilChr02G004483 Chr02 NC_080388.1:67299674-67299688promoter 内 698-712 bp + 3289 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 67302977-67307054(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 AACCAATTTAGGTAA
SmilChr02G000276 Chr02 NC_080388.1:3534685-3534699promoter 内 694-708 bp + 3293 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 3529212-3531392(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TTACCTAATTTAGAG
SmilChr01G001983 Chr01 NC_080387.1:35214863-35214877promoter 内 643-657 bp + 3344 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 35218221-35220823(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 AGTCTTGTTAGGTTC
SmilChr01G005671 Chr01 NC_080387.1:72986849-72986863promoter 内 629-643 bp - 3358 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 72990221-72990890(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TTACCTAAGTTCAGA
SmilChr03G002997 Chr03 NC_080389.1:46782710-46782724promoter 内 625-639 bp + 3362 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 46777814-46779348(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 AAACCTAACCAAACT
SmilChr02G002149 Chr02 NC_080388.1:38668275-38668289promoter 内 574-588 bp + 3413 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 38671702-38672587(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 AAACTCGTTAGGTGA
SmilChr03G000010 Chr03 NC_080389.1:116326-116340promoter 内 518-532 bp + 3469 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 110983-112857(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 ATACCTAAGATTCTC
SmilChr04G000309 Chr04 NC_080390.1:2850592-2850606promoter 内 507-521 bp - 3480 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 2854086-2855614(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 ATACCTAACACGTAA
SmilChr01G001630 Chr01 NC_080387.1:30362991-30363005promoter 内 371-385 bp + 3616 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 30366621-30368468(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 ATTTCAGTTAGGCTT
SmilChr01G000627 Chr01 NC_080387.1:14054471-14054485promoter 内 365-379 bp - 3622 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 14049918-14050849(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TCTGAACTTAGGTAA
SmilChr03G002395 Chr03 NC_080389.1:37910070-37910084promoter 内 342-356 bp - 3645 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 37913729-37916535(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 GAACCTAACAATGGG
SmilChr02G004328 Chr02 NC_080388.1:65558314-65558328promoter 内 341-355 bp + 3646 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 65561974-65565788(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 CTTCAGGTTAGGTTT
SmilChr03G001475 Chr03 NC_080389.1:17719667-17719681promoter 内 341-355 bp + 3646 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 17712300-17716021(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 AGACCTAACAAGTTG
SmilChr01G001692 Chr01 NC_080387.1:31147689-31147703promoter 内 278-292 bp - 3709 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 31142274-31143980(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 AAACTAGGTAGGTAG
SmilChr03G002293 Chr03 NC_080389.1:36132764-36132778promoter 内 245-259 bp + 3742 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 36136520-36139697(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TCGAAATTTAGGTAT
SmilChr03G003835 Chr03 NC_080389.1:57502160-57502174promoter 内 166-180 bp - 3821 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 57494674-57498339(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TTCAAGGTTAGGTTT
SmilChr01G002485 Chr01 NC_080387.1:42567044-42567058promoter 内 144-158 bp + 3843 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 42570901-42575733(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 CTTAATGTTAGGTCT
SmilChr02G000829 Chr02 NC_080388.1:14050230-14050244promoter 内 91-105 bp + 3896 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 14045221-14046334(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TCACCTAACACACAC
SmilChr02G005280 Chr02 NC_080388.1:73841875-73841889promoter 内 57-71 bp + 3930 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 73845819-73847714(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TGATTAATTAGGTAT
SmilChr02G004512 Chr02 NC_080388.1:67645513-67645527promoter 内 3672-3686 bp + 315 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 3 67645842-67654174(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TACTAGATTAGGTAG
SmilChr03G003932 Chr03 NC_080389.1:58391736-58391750promoter 内 2564-2578 bp - 1423 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 3 58380573-58390313(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TACTAGATTAGGTAG
SmilChr02G003605 Chr02 NC_080388.1:57300996-57301010promoter 内 1996-2010 bp + 1991 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 3 57303001-57304523(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TACTAGATTAGGTAG
SmilChr01G003940 Chr01 NC_080387.1:57744591-57744605promoter 内 1801-1815 bp + 2186 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 3 57740197-57742405(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 CTACCTACCTTTAAC
SmilChr04G001393 Chr04 NC_080390.1:22661745-22661759promoter 内 3883-3897 bp + 104 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 22661863-22663866(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 CGCAGACTTAGGTAA
SmilChr03G000269 Chr03 NC_080389.1:3105118-3105132promoter 内 3700-3714 bp - 287 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 3100105-3104831(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TATTATGTTAGGTGC
SmilChr04G000246 Chr04 NC_080390.1:2224413-2224427promoter 内 3628-3642 bp + 359 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 2224786-2231203(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 ATTTTAATTAGGTAT
SmilChr03G003238 Chr03 NC_080389.1:50282502-50282516promoter 内 3587-3601 bp + 400 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 50282916-50286115(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TGTGAGGTTAGGTTT
SmilChr03G000305 Chr03 NC_080389.1:3481164-3481178promoter 内 3554-3568 bp + 433 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 3475239-3480731(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 AAACCTAACCCTATA
SmilChr02G003718 Chr02 NC_080388.1:58803002-58803016promoter 内 3552-3566 bp + 435 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 58803451-58803524(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TCAAAAGTTAGGGCG
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SmilChr02G005318 Chr02 NC_080388.1:74054110-74054124promoter 内 2433-2447 bp + 1554 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 74055678-74059067(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 AAATGGATTAGGTAT
SmilChr04G000226 Chr04 NC_080390.1:2022177-2022191promoter 内 1762-1776 bp + 2225 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 2015766-2019952(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TTACCTAATGTTTTT
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SmilChr02G001468 Chr02 NC_080388.1:27411715-27411729promoter 内 1570-1584 bp - 2417 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 27407029-27409298(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 GGAGCGGTTAGGTTA
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SmilChr02G002278 Chr02 NC_080388.1:40265834-40265848promoter 内 1368-1382 bp + 2619 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 40268467-40269588(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TCCGGACTTAGGTAG
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SmilChr01G004237 Chr01 NC_080387.1:60712309-60712323promoter 内 1237-1251 bp - 2750 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 60709018-60709559(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TTTACAGTTAGGCTT