转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 125 / 143 下载 TSV

上一页 125 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G003080 Chr03 NC_080389.1:47835171-47835182promoter 内 936-947 bp + 3054 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 47829385-47832117(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTACT
SmilChr02G001392 Chr02 NC_080388.1:26449716-26449727promoter 内 903-914 bp + 3087 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 26442907-26446629(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGAGCTGTCCG
SmilChr06G000170 Chr06 NC_080392.1:1173713-1173724promoter 内 860-871 bp + 3130 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 1176854-1180048(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTCGA
SmilChr04G002672 Chr04 NC_080390.1:42116685-42116696promoter 内 815-826 bp + 3175 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 42119871-42119944(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTAACAGCTGAA
SmilChr04G001035 Chr04 NC_080390.1:14711100-14711111promoter 内 743-754 bp - 3247 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 14714358-14715337(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTTGC
SmilChr02G005434 Chr02 NC_080388.1:74761871-74761882promoter 内 683-694 bp - 3307 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 74755413-74758564(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CGGACAGCTCAT
SmilChr06G001048 Chr06 NC_080392.1:10345450-10345461promoter 内 597-608 bp - 3393 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 10348854-10350723(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTTAC
SmilChr04G001010 Chr04 NC_080390.1:14092706-14092717promoter 内 494-505 bp - 3496 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 14096213-14099180(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTTAA
SmilChr04G002127 Chr04 NC_080390.1:34268744-34268755promoter 内 494-505 bp + 3496 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 34263665-34265248(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTTAA
SmilChr05G000265 Chr05 NC_080391.1:2007675-2007686promoter 内 392-403 bp + 3598 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 2011284-2013186(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTAACAGCTGAA
SmilChr06G000095 Chr06 NC_080392.1:679084-679095promoter 内 319-330 bp - 3671 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 673955-675413(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CGGACAGCTCAT
SmilChr01G001273 Chr01 NC_080387.1:25428464-25428475promoter 内 305-316 bp - 3685 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 25418890-25424779(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGGTCGC
SmilChr02G003824 Chr02 NC_080388.1:59886428-59886439promoter 内 287-298 bp - 3703 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 59890142-59890868(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTTAA
SmilChr02G002997 Chr02 NC_080388.1:50661106-50661117promoter 内 164-175 bp - 3826 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 50655176-50657280(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTAACAGCTGAG
SmilChr05G003405 Chr05 NC_080391.1:45147190-45147201promoter 内 58-69 bp - 3932 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 45141729-45143258(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGACAGCTGCG
SmilChr02G004549 Chr02 NC_080388.1:68033933-68033944promoter 内 3707-3718 bp + 283 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 3 68031027-68033650(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGAACTGTCAA
SmilChr01G001162 Chr01 NC_080387.1:23612371-23612382promoter 内 1597-1608 bp - 2393 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 2 23614775-23616980(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTTGA
SmilChr02G002334 Chr02 NC_080388.1:41035705-41035716promoter 内 3743-3754 bp + 247 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 41031885-41035458(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGAACTGTCAA
SmilChr03G002269 Chr03 NC_080389.1:35821572-35821583promoter 内 3635-3646 bp - 355 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 35819285-35821217(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGACAGCTGCT
SmilChr05G002830 Chr05 NC_080391.1:33596469-33596480promoter 内 3594-3605 bp - 396 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 33595013-33596073(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACAACAGCTGGG
SmilChr08G003644 Chr08 NC_080394.1:39920279-39920290promoter 内 3539-3550 bp + 451 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 39918819-39919828(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGAACTGTCAA
SmilChr07G002528 Chr07 NC_080393.1:23950449-23950460promoter 内 3532-3543 bp - 458 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 23947690-23949991(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCAACAGCTGTG
SmilChr06G001914 Chr06 NC_080392.1:23162667-23162678promoter 内 3511-3522 bp - 479 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 23120011-23162188(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGAAAGCTGTA
SmilChr03G002667 Chr03 NC_080389.1:42368599-42368610promoter 内 3474-3485 bp + 516 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 42363952-42368083(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACCTGTCAA
SmilChr02G003308 Chr02 NC_080388.1:54345809-54345820promoter 内 3462-3473 bp + 528 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 54342393-54345281(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTTGA
SmilChr05G003563 Chr05 NC_080391.1:47562378-47562389promoter 内 3409-3420 bp - 581 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 47562970-47563805(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGCAGCTGTCGT
SmilChr08G002199 Chr08 NC_080394.1:19934673-19934684promoter 内 3355-3366 bp - 635 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 19931942-19934038(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCAACAGCTGTG
SmilChr04G002446 Chr04 NC_080390.1:39163158-39163169promoter 内 3250-3261 bp + 740 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 39163909-39167473(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTGCC
SmilChr03G002911 Chr03 NC_080389.1:45858956-45858967promoter 内 3236-3247 bp - 754 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 45859721-45861379(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGAACTGTCAA
SmilChr07G003733 Chr07 NC_080393.1:45383820-45383831promoter 内 3117-3128 bp + 873 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 45384704-45387551(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGAAAGCTGTA
SmilChr06G001910 Chr06 NC_080392.1:23091394-23091405promoter 内 3072-3083 bp + 918 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 23086690-23090476(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACCTGTCAA
SmilChr07G004076 Chr07 NC_080393.1:52217369-52217380promoter 内 3051-3062 bp + 939 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 52213855-52216430(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGCAGCTGTCGT
SmilChr02G004329 Chr02 NC_080388.1:65567076-65567087promoter 内 3041-3052 bp + 949 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 65568036-65572115(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTCTA
SmilChr06G000605 Chr06 NC_080392.1:5237884-5237895promoter 内 3015-3026 bp + 975 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 5232307-5236909(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTTAT
SmilChr02G004469 Chr02 NC_080388.1:67092411-67092422promoter 内 3000-3011 bp + 990 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 67093412-67237173(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGAAAGCTGTA
SmilChr07G001864 Chr07 NC_080393.1:16153589-16153600promoter 内 2791-2802 bp - 1199 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 16150679-16152390(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTCTA
SmilChr04G002618 Chr04 NC_080390.1:41593449-41593460promoter 内 2495-2506 bp - 1495 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 41594955-41600347(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTTAGCTGTCCG
SmilChr03G002910 Chr03 NC_080389.1:45858956-45858967promoter 内 2441-2452 bp - 1549 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 45856219-45857407(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTCTA
SmilChr03G002605 Chr03 NC_080389.1:41437241-41437252promoter 内 2280-2291 bp + 1710 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 41438962-41444298(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATAACAGCTGAA
SmilChr01G002500 Chr01 NC_080387.1:42832642-42832653promoter 内 2279-2290 bp + 1711 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 42834364-42835534(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATAACAGCTGAA
SmilChr05G000622 Chr05 NC_080391.1:4707002-4707013promoter 内 2246-2257 bp + 1744 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 4703618-4705258(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGAACTGTCAA
SmilChr06G003195 Chr06 NC_080392.1:44831254-44831265promoter 内 2098-2109 bp - 1892 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 44833157-44835112(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTTGT
SmilChr04G000288 Chr04 NC_080390.1:2687043-2687054promoter 内 2058-2069 bp + 1932 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 2685038-2685111(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTTAT
SmilChr01G003048 Chr01 NC_080387.1:49448917-49448928promoter 内 2015-2026 bp - 1975 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 49450903-49452158(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGAACTGTCAA
SmilChr06G000497 Chr06 NC_080392.1:4090431-4090442promoter 内 1999-2010 bp - 1991 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 4092433-4095893(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTTAT
SmilChr08G001587 Chr08 NC_080394.1:13120475-13120486promoter 内 1954-1965 bp - 2036 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 13110992-13118439(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCAACAGCTGTG
SmilChr04G001234 Chr04 NC_080390.1:19353483-19353494promoter 内 1842-1853 bp + 2148 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 19355642-19357036(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTCTA
SmilChr07G000022 Chr07 NC_080393.1:107311-107322promoter 内 1680-1691 bp - 2310 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 102928-105001(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTCTA
SmilChr02G004835 Chr02 NC_080388.1:70470241-70470252promoter 内 1637-1648 bp - 2353 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 70472605-70475789(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGAACTGTCAA
SmilChr03G002250 Chr03 NC_080389.1:35433424-35433435promoter 内 1635-1646 bp - 2355 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 35428730-35431069(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTGCC