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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。

预计算阈值必须与当前索引一致。非法、未支持或需四舍五入的输入会报错；页面与下载均不会自动切换阈值。

257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID 家族 基序 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因，每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G002704; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族蛋白基序共识序列
SMil_00005062-RA_Salv SmilChr04G002704 ERF XP_057807081.1 MP00026 CACCGACCAT

可能结合的靶基因

9854 个结合位点 7408 个候选靶基因 第 125 / 149 下载 TSV

上一页 125 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF 基序 匹配序列
SmilChr02G002603 Chr02 NC_080388.1:45158109-45158118promoter 内 3979-3988 bp + 13 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 45158131-45159911(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 CACCGACTGT
SmilChr04G000651 Chr04 NC_080390.1:7360154-7360163promoter 内 3772-3781 bp - 220 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 7360383-7361896(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 AAGGTCGGTT
SmilChr01G002770 Chr01 NC_080387.1:46145982-46145991promoter 内 3561-3570 bp + 431 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 46144436-46145551(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 GACGTCGGTG
SmilChr03G000968 Chr03 NC_080389.1:10968559-10968568promoter 内 3501-3510 bp - 491 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 10969059-10972258(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 GACGTCGGTG
SmilChr03G001248 Chr03 NC_080389.1:14377197-14377206promoter 内 3247-3256 bp + 745 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 14377951-14385049(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 AACCGACCTT
SmilChr04G002066 Chr04 NC_080390.1:33421633-33421642promoter 内 3034-3043 bp + 958 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 33419599-33420675(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 AAGGTCGGTT
SmilChr01G001748 Chr01 NC_080387.1:32220314-32220323promoter 内 2914-2923 bp + 1078 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 32221401-32235748(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 TACCGACCGA
SmilChr04G002296 Chr04 NC_080390.1:37218798-37218807promoter 内 2847-2856 bp - 1145 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 37219952-37224381(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 GACGTCGGTG
SmilChr01G004453 Chr01 NC_080387.1:62656031-62656040promoter 内 2653-2662 bp + 1339 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 62657379-62661525(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 CACCGACGTC
SmilChr04G001331 Chr04 NC_080390.1:21508016-21508025promoter 内 2301-2310 bp + 1691 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 21509716-21510660(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 AACCGACCTT
SmilChr01G001749 Chr01 NC_080387.1:32220314-32220323promoter 内 1902-1911 bp + 2090 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 32222413-32224941(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 TACCGACCGA
SmilChr01G002769 Chr01 NC_080387.1:46145982-46145991promoter 内 1440-1449 bp + 2552 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 46136304-46143430(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 GACGTCGGTG
SmilChr04G002294 Chr04 NC_080390.1:37218798-37218807promoter 内 1286-1295 bp - 2706 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 37215355-37216092(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 CACCGACGTC
SmilChr03G000435 Chr03 NC_080389.1:4708699-4708708promoter 内 1237-1246 bp + 2755 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 4711463-4714015(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 AACCGACCTT
SmilChr04G003901 Chr04 NC_080390.1:54780226-54780235promoter 内 1146-1155 bp + 2846 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 54776041-54777380(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 GACGTCGGTG
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SmilChr03G002795 Chr03 NC_080389.1:44438766-44438775promoter 内 402-411 bp - 3590 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 44434064-44435176(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 CACCGACGTC
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SmilChr01G001907 Chr01 NC_080387.1:34150083-34150092promoter 内 142-151 bp - 3850 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 34153942-34154646(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 GACGTCGGTG
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SmilChr01G003654 Chr01 NC_080387.1:54995864-54995873promoter 内 3990-3999 bp - 2 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 54995875-54999867(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 CAGGTCGGTA
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SmilChr01G002811 Chr01 NC_080387.1:46660772-46660781promoter 内 3975-3984 bp - 17 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 46660798-46662101(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 ACAGTCGGTG
SmilChr01G005314 Chr01 NC_080387.1:70393232-70393241promoter 内 3935-3944 bp - 57 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 70392116-70393175(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 AACCGACCTT
SmilChr03G002027 Chr03 NC_080389.1:30399191-30399200promoter 内 3902-3911 bp + 90 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 30399290-30401540(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 CACCGACGTC
SmilChr02G000377 Chr02 NC_080388.1:4758832-4758841promoter 内 3897-3906 bp + 95 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 4758936-4763213(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 AACCGACCTT
SmilChr04G004005 Chr04 NC_080390.1:55392310-55392319promoter 内 3882-3891 bp - 110 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 55392429-55393504(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 ACAGTCGGTG
SmilChr04G003912 Chr04 NC_080390.1:54848579-54848588promoter 内 3876-3885 bp + 116 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 54848704-54850082(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 CACCGACGTC
SmilChr03G002958 Chr03 NC_080389.1:46349966-46349975promoter 内 3867-3876 bp + 125 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 46350100-46352683(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 AACCGACCTT
SmilChr04G002713 Chr04 NC_080390.1:42743176-42743185promoter 内 3861-3870 bp - 131 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 42743316-42745112(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 CGCGTCGGTG
SmilChr01G002127 Chr01 NC_080387.1:37279040-37279049promoter 内 3750-3759 bp - 242 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 37279291-37283213(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 TCGGTCGGTA
SmilChr02G002451 Chr02 NC_080388.1:42759620-42759629promoter 内 3619-3628 bp + 373 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 42760002-42761349(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 AACCGACCTT
SmilChr03G004473 Chr03 NC_080389.1:62836603-62836612promoter 内 3613-3622 bp - 379 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 62832482-62836224(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 TACCGACCGA
SmilChr03G003122 Chr03 NC_080389.1:48382081-48382090promoter 内 3518-3527 bp - 474 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 48379685-48381607(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 CACCGACGCG
SmilChr06G000381 Chr06 NC_080392.1:3007899-3007908promoter 内 3510-3519 bp - 482 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 3008390-3013696(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 AAGGTCGGTT
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SmilChr06G001011 Chr06 NC_080392.1:9992286-9992295promoter 内 3457-3466 bp - 535 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 9989929-9991751(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 CACCGACGTC
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SmilChr05G002098 Chr05 NC_080391.1:21954520-21954529promoter 内 3400-3409 bp + 592 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 21955121-21958091(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 CACCGACGCG
SmilChr02G002520 Chr02 NC_080388.1:43779427-43779436promoter 内 3386-3395 bp + 606 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 43776311-43778821(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 GACGTCGGTG
SmilChr02G003233 Chr02 NC_080388.1:53602539-53602548promoter 内 3378-3387 bp - 614 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 53600462-53601925(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 TACCGACCGA
SmilChr03G000668 Chr03 NC_080389.1:7478847-7478856promoter 内 3325-3334 bp - 667 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 7479523-7482210(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 CGCGTCGGTG
SmilChr03G002715 Chr03 NC_080389.1:43110221-43110230promoter 内 3308-3317 bp - 684 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 43110914-43112917(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 ACAGTCGGTG
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SmilChr04G003443 Chr04 NC_080390.1:50947702-50947711promoter 内 3207-3216 bp + 785 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 50945181-50946917(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 GACGTCGGTG
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SmilChr02G005266 Chr02 NC_080388.1:73744706-73744715promoter 内 3166-3175 bp - 826 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 73745541-73756597(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 GACGTCGGTG