转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 13 / 143 下载 TSV

上一页 13 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G004074 Chr03 NC_080389.1:59695742-59695753promoter 内 2683-2694 bp - 1307 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 59697060-59697653(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCAA
SmilChr01G002759 Chr01 NC_080387.1:45932502-45932513promoter 内 2594-2605 bp - 1396 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 45924199-45931106(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTGAG
SmilChr01G005220 Chr01 NC_080387.1:69769042-69769053promoter 内 2206-2217 bp + 1784 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 69765732-69767258(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCAA
SmilChr02G003713 Chr02 NC_080388.1:58738770-58738781promoter 内 2186-2197 bp - 1804 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 58732871-58736966(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGAA
SmilChr01G005755 Chr01 NC_080387.1:73647015-73647026promoter 内 2160-2171 bp + 1830 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 73641169-73645185(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCAA
SmilChr05G000507 Chr05 NC_080391.1:3928628-3928639promoter 内 2090-2101 bp + 1900 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 3930539-3931111(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGAA
SmilChr02G000418 Chr02 NC_080388.1:5311788-5311799promoter 内 1594-1605 bp - 2396 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 5314195-5315689(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTCAC
SmilChr03G002343 Chr03 NC_080389.1:36941355-36941366promoter 内 1356-1367 bp + 2634 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 36936490-36938721(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCAA
SmilChr01G006032 Chr01 NC_080387.1:75851365-75851376promoter 内 1275-1286 bp - 2715 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 75854091-75856855(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTCAC
SmilChr01G005211 Chr01 NC_080387.1:69741530-69741541promoter 内 1266-1277 bp + 2724 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 69738297-69738806(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCAA
SmilChr03G001193 Chr03 NC_080389.1:13747554-13747565promoter 内 1208-1219 bp + 2782 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 13750347-13751267(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGAA
SmilChr04G002265 Chr04 NC_080390.1:36634161-36634172promoter 内 1187-1198 bp + 2803 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 36636975-36642906(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGAA
SmilChr03G004715 Chr03 NC_080389.1:64392642-64392653promoter 内 995-1006 bp + 2995 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 64395648-64397776(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTGAG
SmilChr01G004021 Chr01 NC_080387.1:58602993-58603004promoter 内 818-829 bp - 3172 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 58606176-58610147(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTCAC
SmilChr06G002803 Chr06 NC_080392.1:40748828-40748839promoter 内 752-763 bp - 3238 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 40741892-40745590(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGAA
SmilChr04G001320 Chr04 NC_080390.1:21289049-21289060promoter 内 717-728 bp - 3273 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 21283386-21285776(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGAA
SmilChr08G001469 Chr08 NC_080394.1:11829476-11829487promoter 内 632-643 bp - 3358 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 11832845-11838794(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTCAC
SmilChr01G001148 Chr01 NC_080387.1:23439710-23439721promoter 内 609-620 bp + 3381 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 23443102-23449748(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGAA
SmilChr03G002509 Chr03 NC_080389.1:39951059-39951070promoter 内 468-479 bp - 3522 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 39954592-39957361(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCAA
SmilChr02G001933 Chr02 NC_080388.1:34742805-34742816promoter 内 160-171 bp + 3830 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 34746646-34746781(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGAA
SmilChr02G001754 Chr02 NC_080388.1:32289560-32289571promoter 内 1538-1549 bp + 2452 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 4 32292023-32295229(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGCCAGCTGTC
SmilChr05G000089 Chr05 NC_080391.1:495546-495557promoter 内 2845-2856 bp + 1145 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 3 496702-497737(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGAA
SmilChr07G002041 Chr07 NC_080393.1:18522683-18522694promoter 内 1669-1680 bp - 2321 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 3 18517892-18520362(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGAA
SmilChr07G002043 Chr07 NC_080393.1:18522683-18522694promoter 内 749-760 bp - 3241 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 3 18525935-18527535(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCAT
SmilChr08G000821 Chr08 NC_080394.1:6068930-6068941promoter 内 3906-3917 bp - 84 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 6068304-6068846(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGACAGCTGGG
SmilChr02G000145 Chr02 NC_080388.1:1937787-1937798promoter 内 3379-3390 bp - 611 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 1938409-1944296(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTCGA
SmilChr02G000851 Chr02 NC_080388.1:14449113-14449124promoter 内 3154-3165 bp + 836 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 14436538-14448277(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GACAGCTGGCCA
SmilChr03G001784 Chr03 NC_080389.1:24416264-24416275promoter 内 3065-3076 bp + 925 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 24405198-24415339(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCAT
SmilChr07G003321 Chr07 NC_080393.1:35474242-35474253promoter 内 2802-2813 bp - 1188 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 35469003-35473054(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGACAGCTGGG
SmilChr02G001563 Chr02 NC_080388.1:28895236-28895247promoter 内 2745-2756 bp + 1245 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 28896492-28899647(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGCCAGCTGTC
SmilChr08G001790 Chr08 NC_080394.1:15090812-15090823promoter 内 2487-2498 bp + 1503 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 15085488-15089309(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTCGA
SmilChr05G003639 Chr05 NC_080391.1:48815672-48815683promoter 内 1344-1355 bp - 2646 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 48812920-48813026(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGAA
SmilChr03G001786 Chr03 NC_080389.1:24416264-24416275promoter 内 1343-1354 bp + 2647 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 24418922-24420385(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGAA
SmilChr05G002100 Chr05 NC_080391.1:21973758-21973769promoter 内 1190-1201 bp + 2800 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 21966500-21970958(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GACAGCTGGCTT
SmilChr08G002603 Chr08 NC_080394.1:25399415-25399426promoter 内 1111-1122 bp - 2879 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 25402305-25403450(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCAT
SmilChr02G002835 Chr02 NC_080388.1:48502481-48502492promoter 内 1009-1020 bp - 2981 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 48496202-48499500(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGCCAGCTGTC
SmilChr03G003406 Chr03 NC_080389.1:52416335-52416346promoter 内 755-766 bp + 3235 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 52407989-52413100(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GACAGCTGGCTT
SmilChr04G002676 Chr04 NC_080390.1:42208337-42208348promoter 内 744-755 bp + 3246 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 42202658-42205091(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCAT
SmilChr02G000758 Chr02 NC_080388.1:12350299-12350310promoter 内 505-516 bp - 3485 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 12353795-12361407(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GACAGCTGGCTT
SmilChr06G002332 Chr06 NC_080392.1:33842500-33842511promoter 内 463-474 bp + 3527 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 33818395-33838973(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GACAGCTGGCTT
SmilChr07G003323 Chr07 NC_080393.1:35474242-35474253promoter 内 430-441 bp - 3560 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 35477813-35478363(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTCGT
SmilChr05G000473 Chr05 NC_080391.1:3592731-3592742promoter 内 351-362 bp - 3639 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 3596381-3596928(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCAT
SmilChr08G003233 Chr08 NC_080394.1:33245511-33245522promoter 内 268-279 bp + 3722 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 33238606-33241789(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCAT
SmilChr08G000257 Chr08 NC_080394.1:1787339-1787350promoter 内 168-179 bp + 3822 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 1777540-1783517(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GACAGCTGGCTT
SmilChr01G002456 Chr01 NC_080387.1:42189306-42189317promoter 内 73-84 bp + 3917 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 42184695-42185389(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTCGA
SmilChr05G003476 Chr05 NC_080391.1:46135658-46135669promoter 内 3838-3849 bp - 152 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 46135821-46137214(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCAT
SmilChr01G001429 Chr01 NC_080387.1:27926341-27926352promoter 内 3424-3435 bp - 566 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 27924911-27925775(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGAA
SmilChr06G001665 Chr06 NC_080392.1:18930913-18930924promoter 内 3391-3402 bp + 599 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 18929405-18930314(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCAT
SmilChr07G004147 Chr07 NC_080393.1:53291130-53291141promoter 内 3331-3342 bp + 659 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 53291800-53293393(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGAA
SmilChr05G001573 Chr05 NC_080391.1:14403835-14403846promoter 内 3258-3269 bp - 732 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 14402231-14403103(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGAA