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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G004009; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00018864-RA_Salv SmilChr05G004009 MYB XP_057810662.1 MP00216 AAAAAAGTTAGGTAG

可能结合的靶基因

9832 个结合位点 7342 个候选靶基因 第 13 / 147 下载 TSV

上一页 13 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G004478 Chr03 NC_080389.1:62891685-62891699promoter 内 1745-1759 bp + 2242 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 62888347-62889443(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 CTACCTAACTTTGAA
SmilChr01G001088 Chr01 NC_080387.1:22333940-22333954promoter 内 1732-1746 bp - 2255 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 22328507-22331685(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 GCGCGAGTTAGGTAC
SmilChr03G000592 Chr03 NC_080389.1:6588136-6588150promoter 内 1536-1550 bp - 2451 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 6583413-6585685(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 GTGAAAGTTAGGCTT
SmilChr02G004669 Chr02 NC_080388.1:69054447-69054461promoter 内 1515-1529 bp - 2472 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 69048687-69051975(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 GTGAAAGTTAGGCTT
SmilChr01G003727 Chr01 NC_080387.1:55594526-55594540promoter 内 1355-1369 bp - 2632 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 55588948-55591894(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 AAATAAGTTAGGCCT
SmilChr01G001301 Chr01 NC_080387.1:25921957-25921971promoter 内 1238-1252 bp - 2749 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 25924720-25928691(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 CAGCCTAACTCACGT
SmilChr04G001117 Chr04 NC_080390.1:16064460-16064474promoter 内 1042-1056 bp - 2945 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 16060810-16061515(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 GATGGAGTTAGGCAC
SmilChr03G003233 Chr03 NC_080389.1:50139359-50139373promoter 内 987-1001 bp + 3000 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 50133213-50136359(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 CTACCTAACTATGGA
SmilChr02G000853 Chr02 NC_080388.1:14527006-14527020promoter 内 857-871 bp + 3130 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 14530150-14530911(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TCCATAGTTAGGTAG
SmilChr02G005011 Chr02 NC_080388.1:71906043-71906057promoter 内 726-740 bp - 3261 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 71909318-71912747(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 CAGCCTAACTCCTTG
SmilChr03G002331 Chr03 NC_080389.1:36775144-36775158promoter 内 647-661 bp + 3340 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 36770655-36771804(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 CTACCTAACTATGGA
SmilChr02G001357 Chr02 NC_080388.1:25349735-25349749promoter 内 533-547 bp - 3454 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 25353203-25354734(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 CTACCTAACTATGGA
SmilChr01G002322 Chr01 NC_080387.1:40297026-40297040promoter 内 429-443 bp - 3558 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 40287385-40293468(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 CAATTAGTTAGGCAC
SmilChr01G003729 Chr01 NC_080387.1:55594526-55594540promoter 内 222-236 bp - 3765 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 55598305-55600228(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 AGGCCTAACTTATTT
SmilChr02G001712 Chr02 NC_080388.1:31514160-31514174promoter 内 3790-3804 bp - 197 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 3 31512651-31513963(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 GGAATTGTTAGGTAG
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SmilChr03G002326 Chr03 NC_080389.1:36621474-36621488promoter 内 3976-3990 bp - 11 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 36621499-36622803(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 GTACCTAACTCATTC
SmilChr03G004306 Chr03 NC_080389.1:61412040-61412054promoter 内 3882-3896 bp + 105 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 61412159-61418590(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 AAAAAGGTTAGGTGA
SmilChr02G000521 Chr02 NC_080388.1:7163087-7163101promoter 内 3869-3883 bp - 118 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 7163219-7165430(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 ATACCTAACTCTATC
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SmilChr03G003261 Chr03 NC_080389.1:50516178-50516192promoter 内 3551-3565 bp + 436 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 50516628-50517259(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 GATCGAGTTAGGCCG
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SmilChr01G005169 Chr01 NC_080387.1:69458577-69458591promoter 内 2463-2477 bp + 1524 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 69460115-69467600(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TAATTAGTTAGGTAG
SmilChr02G000007 Chr02 NC_080388.1:63806-63820promoter 内 2206-2220 bp + 1781 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 60632-62025(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 CTACCTAATTTCTTT
SmilChr02G004603 Chr02 NC_080388.1:68548113-68548127promoter 内 2194-2208 bp + 1793 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 68540602-68546320(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 CTACCTAACAATTCT
SmilChr01G002138 Chr01 NC_080387.1:37348232-37348246promoter 内 2056-2070 bp - 1931 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 37350177-37351940(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 CAACCTAACTTTCCA
SmilChr03G003179 Chr03 NC_080389.1:49248610-49248624promoter 内 1507-1521 bp + 2480 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 49251104-49254743(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 AAAATAATTAGGTAG
SmilChr01G003555 Chr01 NC_080387.1:54178134-54178148promoter 内 1390-1404 bp - 2597 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 54180745-54184910(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 GTACCTAACTCATTC
SmilChr02G004312 Chr02 NC_080388.1:65468389-65468403promoter 内 1098-1112 bp + 2889 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 65471292-65472692(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 AATGTAGTTAGGCAT
SmilChr01G003029 Chr01 NC_080387.1:49343076-49343090promoter 内 1008-1022 bp + 2979 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 49346069-49350693(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 ACGCATGTTAGGTAG
SmilChr01G001746 Chr01 NC_080387.1:32135161-32135175promoter 内 749-763 bp - 3238 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 32138413-32139448(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TTGCCTAACTTAAAT
SmilChr01G005061 Chr01 NC_080387.1:68523316-68523330promoter 内 316-330 bp + 3671 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 68527001-68528110(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 GAATGAGTTAGGCGA
SmilChr03G004416 Chr03 NC_080389.1:62327199-62327213promoter 内 112-126 bp - 3875 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 62320607-62323324(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 AGAGATGTTAGGTAG
SmilChr02G004893 Chr02 NC_080388.1:70961497-70961511promoter 内 3958-3972 bp - 29 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 70961540-70963494(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 ATGCCTAACTTCCTA
SmilChr01G003554 Chr01 NC_080387.1:54178134-54178148promoter 内 3835-3849 bp - 152 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 54178300-54179238(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 GTACCTAACTCATTC
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SmilChr02G000875 Chr02 NC_080388.1:15078660-15078674promoter 内 3412-3426 bp + 575 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 15075885-15078085(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 AAGCCTAACTCTTCC
SmilChr01G001914 Chr01 NC_080387.1:34279428-34279442promoter 内 3330-3344 bp + 657 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 34280099-34282089(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 CCATAAGTTAGGTAT
SmilChr01G001870 Chr01 NC_080387.1:33690458-33690472promoter 内 3294-3308 bp + 693 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 33691165-33693111(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 CCATAAGTTAGGTAT
SmilChr02G004892 Chr02 NC_080388.1:70961497-70961511promoter 内 3107-3121 bp - 880 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 70959676-70960617(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TAGGAAGTTAGGCAT
SmilChr01G004850 Chr01 NC_080387.1:66649250-66649264promoter 内 2872-2886 bp + 1115 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 66645360-66648135(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 CAACCTAACTTTGAC
SmilChr02G004949 Chr02 NC_080388.1:71438551-71438565promoter 内 2611-2625 bp + 1376 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 71429678-71437175(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 CTACCTAATTTTAGT
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SmilChr02G000093 Chr02 NC_080388.1:1220783-1220797promoter 内 1635-1649 bp + 2352 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 1215198-1218431(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TTGCCTAACTTAAAT
SmilChr01G006026 Chr01 NC_080387.1:75828645-75828659promoter 内 1611-1625 bp - 2376 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 75831035-75834081(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 ATACCTAACTCTATC