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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。

预计算阈值必须与当前索引一致。非法、未支持或需四舍五入的输入会报错；页面与下载均不会自动切换阈值。

257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因，每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G000741; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00002054-RA_Salv SmilChr05G000741 ARF XP_057764423.1 MP00021 TTGTCGGAAA

可能结合的靶基因

9812 个结合位点 7629 个候选靶基因 第 141 / 153 下载 TSV

上一页 141 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G002229 Chr05 NC_080391.1:23849323-23849332promoter 内 3914-3923 bp + 78 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 23849410-23854261(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 CGGTCGGAAT
SmilChr03G003520 Chr03 NC_080389.1:53809180-53809189promoter 内 3899-3908 bp + 93 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 53805883-53809087(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 ATTCCGACCG
SmilChr01G001821 Chr01 NC_080387.1:33149600-33149609promoter 内 3862-3871 bp - 130 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 33147058-33149470(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGTGT
SmilChr01G001067 Chr01 NC_080387.1:22019261-22019270promoter 内 3721-3730 bp - 271 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 22019541-22023684(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 ACACCGACAA
SmilChr02G000456 Chr02 NC_080388.1:6098323-6098332promoter 内 3683-3692 bp - 309 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 6093714-6098014(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGTGT
SmilChr04G000069 Chr04 NC_080390.1:625731-625740promoter 内 3680-3689 bp + 312 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 622735-625419(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 CGTCCGACAT
SmilChr02G003096 Chr02 NC_080388.1:51832540-51832549promoter 内 3677-3686 bp - 315 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 51829447-51832225(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGTGT
SmilChr03G003359 Chr03 NC_080389.1:51946426-51946435promoter 内 3639-3648 bp + 353 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 51946788-51949197(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 ATGTCGGACG
SmilChr04G003232 Chr04 NC_080390.1:49148945-49148954promoter 内 3516-3525 bp - 476 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 49146843-49148469(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGTGT
SmilChr04G003327 Chr04 NC_080390.1:49998980-49998989promoter 内 3491-3500 bp - 501 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 49996884-49998479(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGTGT
SmilChr01G003714 Chr01 NC_080387.1:55481209-55481218promoter 内 3407-3416 bp - 585 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 55481803-55486554(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 ACACCGACAA
SmilChr02G005563 Chr02 NC_080388.1:75555531-75555540promoter 内 3390-3399 bp + 602 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 75556142-75559613(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGTGT
SmilChr03G001268 Chr03 NC_080389.1:14717663-14717672promoter 内 3328-3337 bp + 664 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 14718336-14720534(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGTGT
SmilChr04G001930 Chr04 NC_080390.1:31408053-31408062promoter 内 3319-3328 bp - 673 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 31404416-31407380(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGTGT
SmilChr01G001144 Chr01 NC_080387.1:23383197-23383206promoter 内 3298-3307 bp - 694 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 23382398-23382503(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGTGT
SmilChr02G001500 Chr02 NC_080388.1:28044688-28044697promoter 内 3293-3302 bp - 699 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 28041638-28043989(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 CGGTCGGAAT
SmilChr02G005317 Chr02 NC_080388.1:74051123-74051132promoter 内 3259-3268 bp + 733 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 74047416-74050390(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 ACACCGACAA
SmilChr02G004140 Chr02 NC_080388.1:63682416-63682425promoter 内 3156-3165 bp + 836 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 63683261-63690250(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 CGGTCGGAAT
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SmilChr04G000186 Chr04 NC_080390.1:1651753-1651762promoter 内 3110-3119 bp - 882 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 1649188-1650871(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGTGT
SmilChr04G000208 Chr04 NC_080390.1:1852592-1852601promoter 内 3021-3030 bp - 971 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 1850725-1851621(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 ATGTCGGACG
SmilChr01G005064 Chr01 NC_080387.1:68542897-68542906promoter 内 3013-3022 bp + 979 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 68537871-68541918(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 ACACCGACAA
SmilChr04G001130 Chr04 NC_080390.1:16407350-16407359promoter 内 2956-2965 bp - 1036 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 16402897-16406314(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 CGGTCGGAAT
SmilChr02G001636 Chr02 NC_080388.1:30357108-30357117promoter 内 2857-2866 bp - 1135 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 30358252-30362714(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 ACACCGACAA
SmilChr02G001128 Chr02 NC_080388.1:20410031-20410040promoter 内 2847-2856 bp - 1145 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 20411185-20412039(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 ACACCGACAA
SmilChr02G001658 Chr02 NC_080388.1:30771210-30771219promoter 内 2844-2853 bp - 1148 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 30772367-30780224(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 ACACCGACAA
SmilChr04G003966 Chr04 NC_080390.1:55147151-55147160promoter 内 2723-2732 bp + 1269 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 55143242-55145882(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 ACACCGACAA
SmilChr04G002434 Chr04 NC_080390.1:38990366-38990375promoter 内 2711-2720 bp + 1281 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 38983845-38989085(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 CGTCCGACAT
SmilChr02G003049 Chr02 NC_080388.1:51286145-51286154promoter 内 2706-2715 bp + 1286 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 51287440-51289156(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 ATGTCGGACG
SmilChr02G000697 Chr02 NC_080388.1:11091831-11091840promoter 内 2664-2673 bp + 1328 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 11093168-11094617(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGTGT
SmilChr02G002717 Chr02 NC_080388.1:47009741-47009750promoter 内 2551-2560 bp - 1441 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 47011191-47012495(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 ACACCGACAA
SmilChr01G004697 Chr01 NC_080387.1:65073933-65073942promoter 内 2533-2542 bp + 1459 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 65070636-65072474(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 ACACCGACAA
SmilChr01G000781 Chr01 NC_080387.1:17020208-17020217promoter 内 2482-2491 bp + 1510 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 17015675-17018698(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 ATTCCGACCG
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SmilChr03G002073 Chr03 NC_080389.1:31674241-31674250promoter 内 2472-2481 bp - 1520 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 31675770-31682506(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 ACACCGACAA
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SmilChr02G003052 Chr02 NC_080388.1:51309042-51309051promoter 内 2216-2225 bp - 1776 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 51310827-51313155(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 CGTCCGACAT
SmilChr01G000357 Chr01 NC_080387.1:7391592-7391601promoter 内 2205-2214 bp + 1787 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 7389110-7389805(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 ACACCGACAA
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SmilChr04G003707 Chr04 NC_080390.1:53393101-53393110promoter 内 2004-2013 bp + 1988 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 53395098-53397421(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGTGT
SmilChr02G000509 Chr02 NC_080388.1:7008480-7008489promoter 内 1998-2007 bp - 1994 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 7010483-7028520(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 ACACCGACAA
SmilChr03G003521 Chr03 NC_080389.1:53809180-53809189promoter 内 1971-1980 bp + 2021 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 53811210-53814400(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 CGGTCGGAAT