转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G001896; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004057-RA_Salv SmilChr08G001896 MYB XP_057783815.1 MP00564 AAAAATTAGGTGAAA

可能结合的靶基因

9893 个结合位点 6984 个候选靶基因 第 19 / 140 下载 TSV

上一页 19 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G001377 Chr02 NC_080388.1:26054484-26054498promoter 内 3773-3787 bp + 214 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 26054712-26057441(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 AAAATGTAGGTGAAA
SmilChr03G000987 Chr03 NC_080389.1:11181242-11181256promoter 内 3733-3747 bp - 254 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 11181510-11189568(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TTTCACCTACTATAC
SmilChr03G000481 Chr03 NC_080389.1:5123028-5123042promoter 内 3439-3453 bp - 548 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 5118033-5122480(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 ATATAGTAGGTGAAA
SmilChr03G003160 Chr03 NC_080389.1:48960064-48960078promoter 内 3306-3320 bp + 681 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 48960759-48964130(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 ATAAGTTAGGTGCAA
SmilChr01G000127 Chr01 NC_080387.1:2139130-2139144promoter 内 2990-3004 bp - 997 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 2140141-2140734(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TTTCACCAAATTTTG
SmilChr03G000503 Chr03 NC_080389.1:5421110-5421124promoter 内 2967-2981 bp - 1020 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 5422144-5426627(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TTTCACCTACTATAC
SmilChr01G000057 Chr01 NC_080387.1:903398-903412promoter 内 2615-2629 bp - 1372 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 901436-902026(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 CAGAATTAGGTGTAC
SmilChr01G000058 Chr01 NC_080387.1:903398-903412promoter 内 2325-2339 bp - 1662 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 905074-909862(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 GTACACCTAATTCTG
SmilChr02G004778 Chr02 NC_080388.1:69948600-69948614promoter 内 2089-2103 bp - 1898 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 69950512-69956552(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TTTCACCTACTATAT
SmilChr01G004862 Chr01 NC_080387.1:66765291-66765305promoter 内 1702-1716 bp + 2285 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 66758287-66763006(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TTTTACCTAATTTCA
SmilChr02G000643 Chr02 NC_080388.1:9726864-9726878promoter 内 1405-1419 bp - 2582 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 9721651-9724282(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TTTAATTAGGTGGGA
SmilChr02G005434 Chr02 NC_080388.1:74761223-74761237promoter 内 1328-1342 bp + 2659 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 74755413-74758564(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 CCTTACCTAATTATC
SmilChr02G004777 Chr02 NC_080388.1:69948600-69948614promoter 内 1176-1190 bp - 2811 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 69943037-69945789(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 ATATAGTAGGTGAAA
SmilChr01G003774 Chr01 NC_080387.1:56122454-56122468promoter 内 1039-1053 bp + 2948 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 56125416-56134061(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TATAATTAGGTGGAT
SmilChr02G001029 Chr02 NC_080388.1:18214917-18214931promoter 内 781-795 bp + 3206 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 18211138-18211711(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TGCTACCTAATTCTT
SmilChr01G004542 Chr01 NC_080387.1:63567875-63567889promoter 内 748-762 bp - 3239 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 63571128-63574750(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TTTCACCTACTATAC
SmilChr03G002520 Chr03 NC_080389.1:40180159-40180173promoter 内 220-234 bp - 3767 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 40175528-40176392(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TTTAATTAGGTGGGA
SmilChr03G000065 Chr03 NC_080389.1:729483-729497promoter 内 3953-3967 bp - 34 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 729531-824790(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 GCTCACCTACTCTAC
SmilChr01G004863 Chr01 NC_080387.1:66765291-66765305promoter 内 3659-3673 bp + 328 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 66765633-66772172(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TGAAATTAGGTAAAA
SmilChr03G001713 Chr03 NC_080389.1:22905268-22905282promoter 内 3586-3600 bp + 401 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 22905683-22908207(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 AAAAATTAGGTGTAA
SmilChr02G000620 Chr02 NC_080388.1:9144465-9144479promoter 内 3448-3462 bp + 539 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 9145018-9145100(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 CAAGGTTAGGTGACC
SmilChr03G001300 Chr03 NC_080389.1:15225450-15225464promoter 内 3352-3366 bp + 635 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 15222696-15224815(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 CTTTACCTAATTTGG
SmilChr01G002455 Chr01 NC_080387.1:42156766-42156780promoter 内 3286-3300 bp - 701 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 42152156-42156065(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 CAAAATTTGGTGAAA
SmilChr03G001301 Chr03 NC_080389.1:15225450-15225464promoter 内 3261-3275 bp + 726 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 15226190-15228415(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 CCAAATTAGGTAAAG
SmilChr03G000067 Chr03 NC_080389.1:768505-768519promoter 内 3251-3265 bp - 736 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 766367-767769(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 GTAGAGTAGGTGAGC
SmilChr02G004223 Chr02 NC_080388.1:64438559-64438573promoter 内 2381-2395 bp + 1606 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 64440179-64441027(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 GGGAAGTTGGTGAAA
SmilChr02G000644 Chr02 NC_080388.1:9726864-9726878promoter 内 2191-2205 bp - 1796 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 9724364-9725068(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TTTAATTAGGTGGGA
SmilChr03G000064 Chr03 NC_080389.1:729483-729497promoter 内 1526-1540 bp - 2461 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 725468-727022(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 GTAGAGTAGGTGAGC
SmilChr03G002540 Chr03 NC_080389.1:40559388-40559402promoter 内 1072-1086 bp + 2915 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 40551539-40556473(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 CTCCACCTAACACAC
SmilChr01G000851 Chr01 NC_080387.1:18389433-18389447promoter 内 917-931 bp - 3070 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 18382740-18386363(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 GTATAGTAGGTGAAA
SmilChr01G005505 Chr01 NC_080387.1:71911562-71911576promoter 内 899-913 bp + 3088 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 71906613-71908474(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TTTCACCAAATTTTG
SmilChr01G003619 Chr01 NC_080387.1:54726023-54726037promoter 内 838-852 bp - 3149 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 54729186-54734505(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 CCCTACCTAATTCTA
SmilChr01G002404 Chr01 NC_080387.1:41392674-41392688promoter 内 768-782 bp - 3219 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 41395907-41396679(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TTTCACCTACTATAC
SmilChr03G003507 Chr03 NC_080389.1:53667301-53667315promoter 内 752-766 bp + 3235 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 53670550-53673864(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 GTGTGTTAGGTGGAG
SmilChr03G002514 Chr03 NC_080389.1:40007996-40008010promoter 内 496-510 bp + 3491 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 40011501-40012238(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 GTATAGTAGGTGAAA
SmilChr01G000593 Chr01 NC_080387.1:12925374-12925388promoter 内 456-470 bp - 3531 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 12914528-12921843(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 ACAAATTAGGTCAAC
SmilChr02G001792 Chr02 NC_080388.1:32676603-32676617promoter 内 438-452 bp + 3549 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 32680166-32682314(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 GCAAATTAGGTCAAC
SmilChr01G004282 Chr01 NC_080387.1:61043708-61043722promoter 内 226-240 bp - 3761 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 61047483-61049109(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TGTCACCTACTTTAA
SmilChr02G004224 Chr02 NC_080388.1:64438559-64438573promoter 内 69-83 bp + 3918 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 64442491-64444781(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 GGGAAGTTGGTGAAA
SmilChr03G001052 Chr03 NC_080389.1:12241333-12241347promoter 内 3945-3959 bp + 42 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 5 12241389-12243025(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TTAAATTAGGTGGCA
SmilChr03G000793 Chr03 NC_080389.1:9015031-9015045promoter 内 2767-2781 bp - 1220 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 4 9016265-9021580(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TTCCACCTAATACTA
SmilChr02G004833 Chr02 NC_080388.1:70448546-70448560promoter 内 2335-2349 bp + 1652 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 4 70444929-70446894(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TTTTACCTAATTCAT
SmilChr03G000497 Chr03 NC_080389.1:5314642-5314656promoter 内 2014-2028 bp + 1973 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 4 5316629-5320251(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TAGTATTAGGTGGAA
SmilChr03G000496 Chr03 NC_080389.1:5314642-5314656promoter 内 1635-1649 bp + 2352 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 4 5308165-5312290(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TTCCACCTAATACTA
SmilChr01G000355 Chr01 NC_080387.1:7355700-7355714promoter 内 1192-1206 bp - 2795 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 4 7344787-7352905(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 CAATATTAGGTGAAG
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SmilChr01G003161 Chr01 NC_080387.1:50427778-50427792promoter 内 3427-3441 bp + 560 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 3 50424449-50427218(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 CCTCACCTACCACAC
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SmilChr03G000791 Chr03 NC_080389.1:9015031-9015045promoter 内 2617-2631 bp - 1370 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 3 9008587-9013661(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TAGTATTAGGTGGAA