转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr06G001829; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004434-RA_Salv SmilChr06G001829 MYB XP_057766988.1 MP00510 TTTACCTACCTTT

可能结合的靶基因

9799 个结合位点 7526 个候选靶基因 第 20 / 151 下载 TSV

上一页 20 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G001712 Chr02 NC_080388.1:31514155-31514167promoter 内 3797-3809 bp + 192 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 31512651-31513963(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTAGGTAGGTAAG
SmilChr01G002597 Chr01 NC_080387.1:44145824-44145836promoter 内 3776-3788 bp + 213 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 44145540-44145611(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GAAAGTAGGTAAA
SmilChr02G002284 Chr02 NC_080388.1:40315306-40315318promoter 内 3730-3742 bp - 259 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 40312535-40315047(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACTATT
SmilChr02G003449 Chr02 NC_080388.1:55729725-55729737promoter 内 3704-3716 bp - 285 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 55730022-55732077(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GAAAGTAGGTAGA
SmilChr02G001768 Chr02 NC_080388.1:32430062-32430074promoter 内 3702-3714 bp - 287 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 32427898-32429775(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACTTTC
SmilChr02G004923 Chr02 NC_080388.1:71245846-71245858promoter 内 3321-3333 bp - 668 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 71246526-71248861(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AATGTTAGGTAAG
SmilChr04G002017 Chr04 NC_080390.1:32722643-32722655promoter 内 3080-3092 bp + 909 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 32717587-32721734(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGTGTTAGGTAAG
SmilChr03G004305 Chr03 NC_080389.1:61406906-61406918promoter 内 2546-2558 bp + 1443 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 61405392-61405463(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTGGTAGGTAGG
SmilChr04G003663 Chr04 NC_080390.1:53090734-53090746promoter 内 2478-2490 bp - 1511 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 53087306-53089223(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAACTTC
SmilChr01G004072 Chr01 NC_080387.1:59127063-59127075promoter 内 2408-2420 bp + 1581 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 59120898-59125482(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATAGGTAGGTGAC
SmilChr02G005448 Chr02 NC_080388.1:74844246-74844258promoter 内 2354-2366 bp + 1635 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 74838279-74842611(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CATGGTAGGTAGA
SmilChr05G001680 Chr05 NC_080391.1:15944620-15944632promoter 内 2324-2336 bp - 1665 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 15942253-15942955(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACTATT
SmilChr01G004588 Chr01 NC_080387.1:63897863-63897875promoter 内 2134-2146 bp - 1855 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 63894616-63896008(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCCACCTACCTAT
SmilChr01G004255 Chr01 NC_080387.1:60828700-60828712promoter 内 1470-1482 bp + 2519 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 60831231-60832355(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAACTTC
SmilChr04G000241 Chr04 NC_080390.1:2156623-2156635promoter 内 1370-1382 bp - 2619 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 2152602-2154004(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACTTTC
SmilChr04G003926 Chr04 NC_080390.1:54935872-54935884promoter 内 1291-1303 bp + 2698 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 54932033-54933174(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGCGGTAGGTGAA
SmilChr04G000542 Chr04 NC_080390.1:6046358-6046370promoter 内 1276-1288 bp + 2713 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 6039265-6043645(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTGGTAGGTAGG
SmilChr03G003353 Chr03 NC_080389.1:51856462-51856474promoter 内 1208-1220 bp + 2781 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 51859255-51861492(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACCTAA
SmilChr05G001257 Chr05 NC_080391.1:10700087-10700099promoter 内 881-893 bp + 3108 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 10703207-10707900(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACTATT
SmilChr03G003472 Chr03 NC_080389.1:53212895-53212907promoter 内 764-776 bp - 3225 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 53204994-53209670(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCCACCTACCCAC
SmilChr04G003581 Chr04 NC_080390.1:52218293-52218305promoter 内 553-565 bp - 3436 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 52221741-52225468(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTGGTAGGTAAG
SmilChr04G001589 Chr04 NC_080390.1:26451313-26451325promoter 内 551-563 bp - 3438 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 26434610-26447875(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACTTTC
SmilChr02G003383 Chr02 NC_080388.1:54945011-54945023promoter 内 469-481 bp + 3520 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 54948543-54951563(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACCAAA
SmilChr01G000331 Chr01 NC_080387.1:6764113-6764125promoter 内 267-279 bp + 3722 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 6759336-6760391(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TACGGTAGGTGAA
SmilChr03G003035 Chr03 NC_080389.1:47251576-47251588promoter 内 188-200 bp - 3801 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 47255389-47259511(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GAAAGTAGGTAAA
SmilChr02G004543 Chr02 NC_080388.1:67986045-67986057promoter 内 63-75 bp - 3926 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 67989983-67994776(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TAGGGTAGGTAGA
SmilChr02G000432 Chr02 NC_080388.1:5624522-5624534promoter 内 19-31 bp - 3970 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 5617091-5620552(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACCTAA
SmilChr01G002271 Chr01 NC_080387.1:39471523-39471535promoter 内 15-27 bp + 3974 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 39475509-39476317(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCTACCTACTTTC
SmilChr03G003298 Chr03 NC_080389.1:51097604-51097616promoter 内 3575-3587 bp + 414 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 4 51098030-51098693(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACTACC
SmilChr02G004808 Chr02 NC_080388.1:70259678-70259690promoter 内 3682-3694 bp - 307 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 3 70256688-70259371(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTCACCTACCAAT
SmilChr02G004809 Chr02 NC_080388.1:70259678-70259690promoter 内 1270-1282 bp - 2719 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 3 70262409-70265309(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTGGTAGGTGAC
SmilChr02G001763 Chr02 NC_080388.1:32372404-32372416promoter 内 3506-3518 bp - 483 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 2 32372899-32374214(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTGGTAGGTGAC
SmilChr04G002439 Chr04 NC_080390.1:39079013-39079025promoter 内 3418-3430 bp - 571 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 2 39076091-39078442(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTCACCTACCGGC
SmilChr01G001010 Chr01 NC_080387.1:21233950-21233962promoter 内 2693-2705 bp + 1296 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 2 21227796-21232654(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CAAGGTAGGTGGC
SmilChr03G003947 Chr03 NC_080389.1:58520436-58520448promoter 内 2554-2566 bp - 1435 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 2 58521883-58526951(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GATGTTAGGTAAA
SmilChr01G001135 Chr01 NC_080387.1:23131789-23131801promoter 内 2253-2265 bp + 1736 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 2 23125739-23130053(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTAGGTAGGTGAA
SmilChr02G000417 Chr02 NC_080388.1:5314736-5314748promoter 内 1970-1982 bp + 2019 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 2 5304107-5312717(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGTGTTAGGTAAA
SmilChr01G001011 Chr01 NC_080387.1:21233950-21233962promoter 内 1155-1167 bp + 2834 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 2 21236796-21236868(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCCACCTACCTTG
SmilChr04G002440 Chr04 NC_080390.1:39079013-39079025promoter 内 310-322 bp - 3679 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 2 39082704-39084685(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCCGGTAGGTGAG
SmilChr03G003300 Chr03 NC_080389.1:51097604-51097616promoter 内 281-293 bp + 3708 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 2 51101324-51104625(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACTACC
SmilChr01G004915 Chr01 NC_080387.1:67180077-67180089promoter 内 3967-3979 bp + 22 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 67180111-67184533(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACCCGC
SmilChr04G002482 Chr04 NC_080390.1:39662712-39662724promoter 内 3829-3841 bp - 160 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 39660962-39662552(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTCACCTACCGGC
SmilChr04G002508 Chr04 NC_080390.1:40070544-40070556promoter 内 3755-3767 bp - 234 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 40069828-40070310(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTCACCTACCGGC
SmilChr03G000044 Chr03 NC_080389.1:491826-491838promoter 内 3743-3755 bp - 246 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 487964-491580(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTCACCTACCAGT
SmilChr01G002847 Chr01 NC_080387.1:47039029-47039041promoter 内 3422-3434 bp - 567 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 47035908-47038462(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACTATC
SmilChr01G001615 Chr01 NC_080387.1:30275380-30275392promoter 内 3271-3283 bp + 718 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 30276110-30278142(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTCACCTACCGGC
SmilChr01G005645 Chr01 NC_080387.1:72859808-72859820promoter 内 3267-3279 bp + 722 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 72860542-72865349(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAACATC
SmilChr02G000767 Chr02 NC_080388.1:12595842-12595854promoter 内 2899-2911 bp + 1090 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 12589035-12594752(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACAGGTAGGTAAG
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SmilChr01G003358 Chr01 NC_080387.1:52319270-52319282promoter 内 2616-2628 bp - 1373 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 52320655-52323658(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGTGTTAGGTAAA