转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G002885; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00022980-RA_Salv SmilChr01G002885 ERF XP_057767601.1 MP00151 ATGGACGGTGGAGG

可能结合的靶基因

9976 个结合位点 6907 个候选靶基因 第 24 / 139 下载 TSV

上一页 24 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G003957 Chr01 NC_080387.1:57949523-57949536promoter 内 1126-1139 bp - 2862 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 57945095-57946661(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ACGGACGGTGGCAG
SmilChr03G004720 Chr03 NC_080389.1:64429627-64429640promoter 内 1094-1107 bp + 2894 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 64420713-64426733(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TCTCCACCGCCCTC
SmilChr02G002558 Chr02 NC_080388.1:44515739-44515752promoter 内 811-824 bp - 3177 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 44518929-44522175(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CTGCCACCGTCCGT
SmilChr07G000692 Chr07 NC_080393.1:4753551-4753564promoter 内 567-580 bp - 3421 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 4729254-4750130(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TTGGACGGTGCAGA
SmilChr01G003393 Chr01 NC_080387.1:52664028-52664041promoter 内 511-524 bp + 3477 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 52657385-52660551(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CCACCTCCGTCCAA
SmilChr04G004103 Chr04 NC_080390.1:56003400-56003413promoter 内 239-252 bp - 3749 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 55993535-55999651(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GAGGGCGGTGGAGA
SmilChr02G005365 Chr02 NC_080388.1:74347198-74347211promoter 内 230-243 bp + 3758 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 74350969-74352510(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ATTGACGGTGGAGA
SmilChr06G002880 Chr06 NC_080392.1:41611363-41611376promoter 内 132-145 bp - 3856 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 41615232-41620507(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TCTCCACCGCCCTC
SmilChr06G000215 Chr06 NC_080392.1:1447281-1447294promoter 内 38-51 bp - 3950 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 1435126-1443331(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TTGGACGGTGAGGA
SmilChr01G005435 Chr01 NC_080387.1:71488242-71488255promoter 内 2335-2348 bp + 1653 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 5 71489908-71490550(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ACGGACGGTGGCTG
SmilChr01G005434 Chr01 NC_080387.1:71488138-71488151promoter 内 1878-1891 bp + 2110 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 5 71484781-71486028(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CAGCCACCGTCCGT
SmilChr05G001503 Chr05 NC_080391.1:13784389-13784402promoter 内 2784-2797 bp + 1204 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 4 13785606-13786548(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ACGGACGGTGGCTG
SmilChr07G001265 Chr07 NC_080393.1:9718404-9718417promoter 内 2133-2146 bp + 1855 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 4 9712119-9716549(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CAGCCACCGTCCGT
SmilChr02G002077 Chr02 NC_080388.1:37356931-37356944promoter 内 3492-3505 bp + 496 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 3 37352739-37356435(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CCACCACCGTCCGG
SmilChr02G005420 Chr02 NC_080388.1:74650240-74650253promoter 内 2079-2092 bp + 1909 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 3 74652162-74654206(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CCGGACGGTGGTGG
SmilChr05G001116 Chr05 NC_080391.1:9316315-9316328promoter 内 1862-1875 bp + 2126 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 3 9312383-9314189(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CAGCCACCGTCCGT
SmilChr02G005419 Chr02 NC_080388.1:74650240-74650253promoter 内 689-702 bp + 3299 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 3 74643948-74646941(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CCACCACCGTCCGG
SmilChr05G000742 Chr05 NC_080391.1:5687732-5687745promoter 内 3688-3701 bp + 300 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 5688045-5688782(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GTGGTCGGTGGACC
SmilChr01G006173 Chr01 NC_080387.1:77246754-77246767promoter 内 2501-2514 bp + 1487 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 77248254-77258433(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GGTGACGGTGGTGG
SmilChr01G002577 Chr01 NC_080387.1:43918622-43918635promoter 内 2466-2479 bp - 1522 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 43920157-43922480(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CCACCACCGTCCGG
SmilChr05G000915 Chr05 NC_080391.1:7258520-7258533promoter 内 2351-2364 bp - 1637 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 7256398-7256883(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CCGGACGGTGGTGG
SmilChr04G002075 Chr04 NC_080390.1:33496852-33496865promoter 内 1419-1432 bp - 2569 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 33487235-33494283(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TTGGACGGCGCAGC
SmilChr03G001750 Chr03 NC_080389.1:23742111-23742124promoter 内 1383-1396 bp + 2605 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 23736896-23739506(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CCACCACCGTCCGG
SmilChr05G003487 Chr05 NC_080391.1:46371636-46371649promoter 内 1160-1173 bp - 2828 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 46374477-46375199(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CCACCACCGTCCGG
SmilChr06G002098 Chr06 NC_080392.1:27931537-27931550promoter 内 999-1012 bp + 2989 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 27927304-27928548(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CCTCAGCCGTCCAC
SmilChr05G001536 Chr05 NC_080391.1:14046411-14046424promoter 内 756-769 bp - 3232 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 14039608-14043179(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GGTGACGGTGGTGG
SmilChr02G003074 Chr02 NC_080388.1:51639769-51639782promoter 内 630-643 bp + 3358 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 51643140-51644435(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GTGGACGGCGTCAG
SmilChr05G003644 Chr05 NC_080391.1:48870110-48870123promoter 内 504-517 bp + 3484 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 48864636-48866626(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ACTCCACCGCCCAT
SmilChr01G002837 Chr01 NC_080387.1:46963755-46963768promoter 内 460-473 bp - 3528 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 46958115-46960227(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CCGGACGGTGGTGG
SmilChr02G002075 Chr02 NC_080388.1:37329780-37329793promoter 内 404-417 bp + 3584 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 37333377-37345311(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GGTGACGGTGGTGG
SmilChr05G003488 Chr05 NC_080391.1:46371636-46371649promoter 内 375-388 bp - 3613 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 46375262-46376816(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CCACCACCGTCCGG
SmilChr05G001620 Chr05 NC_080391.1:14973713-14973726promoter 内 336-349 bp + 3652 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 14977378-14978901(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 AGGGCCGGTGGAGA
SmilChr06G002110 Chr06 NC_080392.1:28191631-28191644promoter 内 3-16 bp + 3985 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 28187172-28187646(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CAGCCACCGTCCGT
SmilChr03G003356 Chr03 NC_080389.1:51886262-51886275promoter 内 3891-3904 bp + 97 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 51886372-51889616(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GTGGACGGTGTAGC
SmilChr01G006100 Chr01 NC_080387.1:76485577-76485590promoter 内 3533-3546 bp + 455 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 76486045-76487897(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 AGGGCCGGTGGAGA
SmilChr07G001244 Chr07 NC_080393.1:9521696-9521709promoter 内 3180-3193 bp - 808 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 9522517-9523282(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CCACCACCGTCCGG
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SmilChr03G002192 Chr03 NC_080389.1:34436045-34436058promoter 内 2426-2439 bp + 1562 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 34433795-34434483(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TCTCCACCGGCCCT
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SmilChr04G001083 Chr04 NC_080390.1:15539098-15539111promoter 内 1657-1670 bp + 2331 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 15541442-15544605(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CCGGACGGTGGTGG