转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G003267; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00018221-RA_Salv SmilChr08G003267 MYB XP_057779249.1 MP00406 AAAAAATTAGGTAAA

可能结合的靶基因

9917 个结合位点 7839 个候选靶基因 第 24 / 157 下载 TSV

上一页 24 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G004344 Chr03 NC_080389.1:61726911-61726925promoter 内 2923-2937 bp - 1064 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 61727989-61734910(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TGCACCTAATTTTTA
SmilChr01G002392 Chr01 NC_080387.1:41200634-41200648promoter 内 2911-2925 bp - 1076 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 41201724-41202541(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TGTACCTAATTAATG
SmilChr01G002542 Chr01 NC_080387.1:43471429-43471443promoter 内 2856-2870 bp + 1131 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 43472574-43473839(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 AGGAAATTAGGTACT
SmilChr03G000008 Chr03 NC_080389.1:93729-93743promoter 内 2846-2860 bp + 1141 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 94884-97333(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TAGAAGTTAGGTATT
SmilChr01G005498 Chr01 NC_080387.1:71878357-71878371promoter 内 2837-2851 bp - 1150 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 71879521-71881653(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 CTCACCTAATTATTT
SmilChr03G001958 Chr03 NC_080389.1:27994423-27994437promoter 内 2798-2812 bp - 1189 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 27992014-27993234(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TCATAGTTAGGTAGG
SmilChr02G004408 Chr02 NC_080388.1:66405758-66405772promoter 内 1387-1401 bp - 2600 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 66401834-66403158(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 AAATAATTAGGTGAG
SmilChr02G002538 Chr02 NC_080388.1:44157194-44157208promoter 内 1288-1302 bp + 2699 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 44159907-44165662(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 GAGAAATTAGGTGGA
SmilChr04G004128 Chr04 NC_080390.1:56106681-56106695promoter 内 929-943 bp + 3058 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 56109753-56112876(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 GGTTAATTAGGTAGA
SmilChr02G003357 Chr02 NC_080388.1:54728208-54728222promoter 内 521-535 bp + 3466 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 54731688-54733486(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 AATTAATTAGGTAGC
SmilChr05G003812 Chr05 NC_080391.1:51403202-51403216promoter 内 447-461 bp + 3540 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 51406756-51414878(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 GAGAAATTAGGTGGA
SmilChr04G001114 Chr04 NC_080390.1:15983405-15983419promoter 内 166-180 bp + 3821 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 15978672-15979584(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TATACCTAACTTGTA
SmilChr01G004745 Chr01 NC_080387.1:65631796-65631810promoter 内 31-45 bp + 3956 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 65626950-65627840(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 GATACCTAATATTTG
SmilChr03G003936 Chr03 NC_080389.1:58423714-58423728promoter 内 3899-3913 bp - 88 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 58422533-58423626(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TGATAGTTAGGTACA
SmilChr03G004256 Chr03 NC_080389.1:61045124-61045138promoter 内 3771-3785 bp + 216 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 61045354-61047256(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 AAAAAATTAGGTTAA
SmilChr01G001935 Chr01 NC_080387.1:34547919-34547933promoter 内 3699-3713 bp - 288 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 34548221-34549926(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 ATTACCTAATTAATT
SmilChr03G000007 Chr03 NC_080389.1:93729-93743promoter 内 3637-3651 bp + 350 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 90718-93379(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 AATACCTAACTTCTA
SmilChr01G002234 Chr01 NC_080387.1:38849672-38849686promoter 内 3562-3576 bp + 425 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 38845130-38849247(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 CCCACCTAATTTATT
SmilChr01G006149 Chr01 NC_080387.1:76959197-76959211promoter 内 3285-3299 bp + 702 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 76959913-76962545(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 AATTAATTAGGTAAT
SmilChr01G002716 Chr01 NC_080387.1:45430414-45430428promoter 内 3184-3198 bp - 803 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 45428824-45429611(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 AGGAAATTAGGTACT
SmilChr01G001273 Chr01 NC_080387.1:25425603-25425617promoter 内 3163-3177 bp - 824 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 25418890-25424779(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 GTAAAATTAGGTGAG
SmilChr02G004236 Chr02 NC_080388.1:64544224-64544238promoter 内 3144-3158 bp + 843 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 64545081-64552300(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 GGGAAATTAGGTCAG
SmilChr03G004464 Chr03 NC_080389.1:62735219-62735233promoter 内 2935-2949 bp + 1052 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 62714551-62734167(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 ATTACCTAATTAATT
SmilChr01G003867 Chr01 NC_080387.1:56917849-56917863promoter 内 2828-2842 bp + 1159 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 56913994-56916690(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 CTCACCTAATTTTGC
SmilChr04G001396 Chr04 NC_080390.1:22748420-22748434promoter 内 2598-2612 bp - 1389 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 22749823-22755087(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 AGTACCTAATTTCCT
SmilChr03G003947 Chr03 NC_080389.1:58520434-58520448promoter 内 2552-2566 bp + 1435 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 58521883-58526951(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 GGGATGTTAGGTAAA
SmilChr03G002838 Chr03 NC_080389.1:44919771-44919785promoter 内 2497-2511 bp - 1490 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 44921275-44922526(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 ATTACCTAATTTGTC
SmilChr01G004154 Chr01 NC_080387.1:60057951-60057965promoter 内 2467-2481 bp + 1520 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 60059485-60062271(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 CTAAAGTTAGGTATT
SmilChr01G003807 Chr01 NC_080387.1:56448030-56448044promoter 内 2098-2112 bp - 1889 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 56449933-56452544(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 CTCACCTAATTTTGC
SmilChr05G002055 Chr05 NC_080391.1:21410451-21410465promoter 内 1944-1958 bp + 2043 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 21407872-21408408(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TTTACCTAACTCTTT
SmilChr05G004106 Chr05 NC_080391.1:54918695-54918709promoter 内 1750-1764 bp - 2237 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 54920946-54924877(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 ATTACCTAACATTTA
SmilChr02G003965 Chr02 NC_080388.1:61799505-61799519promoter 内 1699-1713 bp - 2288 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 61796813-61797217(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 ACGAAATTAGGTCAA
SmilChr01G005482 Chr01 NC_080387.1:71785357-71785371promoter 内 1596-1610 bp + 2391 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 71787762-71790309(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 ATTTAGTTAGGTAAA
SmilChr02G000504 Chr02 NC_080388.1:6949266-6949280promoter 内 1567-1581 bp - 2420 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 6951700-6952732(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TTAACCTAATTTTTT
SmilChr05G002742 Chr05 NC_080391.1:31596046-31596060promoter 内 1470-1484 bp + 2517 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 31589091-31593529(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TTGACCTAATTATCT
SmilChr04G001598 Chr04 NC_080390.1:26634809-26634823promoter 内 1422-1436 bp + 2565 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 26637388-26639694(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TCAATATTAGGTAGA
SmilChr03G001578 Chr03 NC_080389.1:19944497-19944511promoter 内 1406-1420 bp - 2581 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 19947092-19951504(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TTGACCTAATTATCT
SmilChr05G002054 Chr05 NC_080391.1:21410451-21410465promoter 内 1189-1203 bp + 2798 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 21405442-21407653(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TTTACCTAACTCTTT
SmilChr05G003758 Chr05 NC_080391.1:50785826-50785840promoter 内 956-970 bp + 3031 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 50788871-50789814(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 AGAAAATTAGGTGCA
SmilChr02G005479 Chr02 NC_080388.1:75004057-75004071promoter 内 837-851 bp - 3150 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 75007221-75009530(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 CCCACCTAATTTATT
SmilChr05G002461 Chr05 NC_080391.1:27136015-27136029promoter 内 646-660 bp + 3341 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 27128200-27132674(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 AATACCTAATTTTGA
SmilChr01G001805 Chr01 NC_080387.1:32973387-32973401promoter 内 333-347 bp + 3654 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 32977055-32979274(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 CATTAATTAGGTACA
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SmilChr02G000756 Chr02 NC_080388.1:12341426-12341440promoter 内 108-122 bp + 3879 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 12333233-12337547(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 GATACCTAATTATCT
SmilChr03G004467 Chr03 NC_080389.1:62735219-62735233promoter 内 42-56 bp + 3945 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 62726166-62731274(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 ATTACCTAATTAATT
SmilChr01G001274 Chr01 NC_080387.1:25425603-25425617promoter 内 29-43 bp - 3958 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 25429575-25430228(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 CTCACCTAATTTTAC
SmilChr02G001743 Chr02 NC_080388.1:32022464-32022478promoter 内 3964-3978 bp + 23 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 3 32018425-32022441(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 ATTACCTAACTAATT