转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G004607; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00002089-RA_Salv SmilChr02G004607 C2H2 XP_057791470.1 MP00608 AAAAACAGAGCA

可能结合的靶基因

9817 个结合位点 6398 个候选靶基因 第 29 / 128 下载 TSV

上一页 29 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G001196 Chr01 NC_080387.1:24113050-24113061promoter 内 433-444 bp - 3557 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 24116618-24118251(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GACTCTGTTTCC
SmilChr02G002277 Chr02 NC_080388.1:40261996-40262007promoter 内 417-428 bp + 3573 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 40253801-40258423(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AACTCTGTTTTT
SmilChr02G005597 Chr02 NC_080388.1:75702866-75702877promoter 内 378-389 bp - 3612 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 75706489-75708908(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AACTCTGTTTCT
SmilChr01G001793 Chr01 NC_080387.1:32785155-32785166promoter 内 367-378 bp + 3623 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 32788789-32792051(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GGAAACAGAGTC
SmilChr01G003625 Chr01 NC_080387.1:54809071-54809082promoter 内 275-286 bp + 3715 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 54802917-54805356(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GTCTCTGTTTTT
SmilChr02G000767 Chr02 NC_080388.1:12598490-12598501promoter 内 252-263 bp - 3738 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 12589035-12594752(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TAAAACAGAGTA
SmilChr02G001701 Chr02 NC_080388.1:31328540-31328551promoter 内 154-165 bp + 3836 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 31322873-31324704(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AACTCTGTTTCT
SmilChr01G001331 Chr01 NC_080387.1:26498063-26498074promoter 内 125-136 bp + 3865 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 26501939-26502886(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GGAAACAGAGTC
SmilChr02G003878 Chr02 NC_080388.1:60839172-60839183promoter 内 113-124 bp + 3877 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 60843060-60846333(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAGTT
SmilChr02G005604 Chr02 NC_080388.1:75751515-75751526promoter 内 110-121 bp - 3880 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 75739543-75747635(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TAAAACAGAGTA
SmilChr03G000259 Chr03 NC_080389.1:3033958-3033969promoter 内 103-114 bp - 3887 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 3027048-3030071(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAGAC
SmilChr01G004126 Chr01 NC_080387.1:59752773-59752784promoter 内 99-110 bp + 3891 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 59756675-59758001(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAGAC
SmilChr02G000027 Chr02 NC_080388.1:286326-286337promoter 内 82-93 bp - 3908 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 290245-293695(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TACTCTGTTTCA
SmilChr01G004458 Chr01 NC_080387.1:62693166-62693177promoter 内 78-89 bp - 3912 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 62697089-62699251(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GTCTCTGTTTCT
SmilChr03G001088 Chr03 NC_080389.1:12577116-12577127promoter 内 36-47 bp + 3954 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 12581081-12582292(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAAAACAGAGTC
SmilChr03G000776 Chr03 NC_080389.1:8847217-8847228promoter 内 17-28 bp - 3973 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 8840478-8843244(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAGAC
SmilChr01G001047 Chr01 NC_080387.1:21755742-21755753promoter 内 2054-2065 bp + 1936 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 12 21757689-21759255(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGAGACAGAGCA
SmilChr01G001108 Chr01 NC_080387.1:22708382-22708393promoter 内 805-816 bp - 3185 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 7 22699351-22705197(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAGAGCAGAGCA
SmilChr02G002011 Chr02 NC_080388.1:36248193-36248204promoter 内 346-357 bp + 3644 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 7 36237640-36244549(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCTCTT
SmilChr03G000263 Chr03 NC_080389.1:3059430-3059441promoter 内 518-529 bp - 3472 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 6 3052567-3055958(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAGAGCAGAGCA
SmilChr02G000294 Chr02 NC_080388.1:3720007-3720018promoter 内 3192-3203 bp - 798 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 5 3720816-3723614(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TCCTCTGTTCTC
SmilChr01G000764 Chr01 NC_080387.1:16764997-16765008promoter 内 2185-2196 bp + 1805 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 5 16766813-16767244(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGAGACAGAGCA
SmilChr02G004623 Chr02 NC_080388.1:68740097-68740108promoter 内 3469-3480 bp - 521 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 3 68739106-68739576(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGGAGCAGAGCA
SmilChr01G003556 Chr01 NC_080387.1:54188999-54189010promoter 内 3106-3117 bp + 884 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 3 54185514-54188115(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCTCCT
SmilChr01G004606 Chr01 NC_080387.1:64034510-64034521promoter 内 2343-2354 bp + 1647 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 3 64036168-64040572(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GAAAACAGAGTC
SmilChr01G004989 Chr01 NC_080387.1:67925597-67925608promoter 内 1878-1889 bp - 2112 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 3 67920755-67923485(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGGAGCAGAGCA
SmilChr01G003710 Chr01 NC_080387.1:55452761-55452772promoter 内 1685-1696 bp - 2305 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 3 55455077-55458590(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTCTTT
SmilChr02G001377 Chr02 NC_080388.1:26052342-26052353promoter 内 1631-1642 bp - 2359 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 3 26054712-26057441(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTCTCT
SmilChr03G000099 Chr03 NC_080389.1:1104076-1104087promoter 内 1524-1535 bp - 2466 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 3 1100440-1101610(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAGAGCAGAGCA
SmilChr02G000656 Chr02 NC_080388.1:9971929-9971940promoter 内 1362-1373 bp + 2628 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 3 9968660-9969301(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCTCCT
SmilChr02G000552 Chr02 NC_080388.1:7745311-7745322promoter 内 1006-1017 bp - 2984 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 3 7741022-7742327(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGAGACAGAGCA
SmilChr01G001844 Chr01 NC_080387.1:33402326-33402337promoter 内 942-953 bp - 3048 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 3 33396188-33399278(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAGACAGAGCA
SmilChr03G001893 Chr03 NC_080389.1:26432004-26432015promoter 内 3667-3678 bp + 323 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 26432338-26433530(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GAGAACAGAGGA
SmilChr03G000365 Chr03 NC_080389.1:4085805-4085816promoter 内 2971-2982 bp - 1019 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 4083602-4084786(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GAGAACAGAGGA
SmilChr01G000279 Chr01 NC_080387.1:5490112-5490123promoter 内 2370-2381 bp + 1620 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 5491743-5492959(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGAGACAGAGCA
SmilChr02G004624 Chr02 NC_080388.1:68740097-68740108promoter 内 2211-2222 bp - 1779 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 68741887-68742788(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCTCCT
SmilChr02G001815 Chr02 NC_080388.1:33003354-33003365promoter 内 2137-2148 bp + 1853 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 33005218-33010452(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAGACAGAGCA
SmilChr02G004580 Chr02 NC_080388.1:68299142-68299153promoter 内 2136-2147 bp - 1854 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 68296764-68297288(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAGACAGAGCA
SmilChr02G005244 Chr02 NC_080388.1:73607538-73607549promoter 内 1390-1401 bp + 2600 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 73603363-73604938(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCTCTT
SmilChr01G004348 Chr01 NC_080387.1:61641408-61641419promoter 内 1107-1118 bp - 2883 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 61644302-61653705(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCTCTT
SmilChr03G001007 Chr03 NC_080389.1:11394368-11394379promoter 内 948-959 bp - 3042 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 11397421-11398340(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GACTCTGTTTTC
SmilChr01G001686 Chr01 NC_080387.1:31092976-31092987promoter 内 583-594 bp + 3407 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 31086192-31089569(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GCCTCTGTTCCT
SmilChr02G003706 Chr02 NC_080388.1:58601020-58601031promoter 内 265-276 bp - 3725 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 58596819-58597295(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAGAGCAGAGCA
SmilChr01G000676 Chr01 NC_080387.1:14957085-14957096promoter 内 233-244 bp + 3757 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 14952555-14953328(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTCTCT
SmilChr03G001771 Chr03 NC_080389.1:24175066-24175077promoter 内 3979-3990 bp - 11 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 24175088-24176313(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCTCTT
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SmilChr01G002321 Chr01 NC_080387.1:40283409-40283420promoter 内 3347-3358 bp + 643 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 40281402-40282766(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TCCTCTGTTCTC
SmilChr01G004007 Chr01 NC_080387.1:58449444-58449455promoter 内 3027-3038 bp + 963 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 58450418-58450613(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAGACAGAGCA
SmilChr01G002975 Chr01 NC_080387.1:48688490-48688501promoter 内 3005-3016 bp + 985 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 48689486-48691261(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAGACAGAGCA
SmilChr01G003725 Chr01 NC_080387.1:55566146-55566157promoter 内 2927-2938 bp - 1063 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 55567220-55572343(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTCTCT