转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 34 / 143 下载 TSV

上一页 34 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr07G002902 Chr07 NC_080393.1:29418792-29418803promoter 内 2157-2168 bp - 1833 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 29416888-29416959(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTCTT
SmilChr01G005868 Chr01 NC_080387.1:74622839-74622850promoter 内 2093-2104 bp - 1897 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 74618551-74620942(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTCTT
SmilChr02G003552 Chr02 NC_080388.1:56701399-56701410promoter 内 2054-2065 bp - 1936 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 56694510-56699463(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTCTC
SmilChr07G000222 Chr07 NC_080393.1:1424909-1424920promoter 内 1994-2005 bp - 1996 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 1421907-1422913(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTCTT
SmilChr07G004678 Chr07 NC_080393.1:59742838-59742849promoter 内 1903-1914 bp - 2087 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 59739853-59740751(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTCTT
SmilChr02G000628 Chr02 NC_080388.1:9453260-9453271promoter 内 1868-1879 bp - 2122 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 9455393-9456815(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGAGCTGTCGC
SmilChr01G002192 Chr01 NC_080387.1:38060433-38060444promoter 内 1729-1740 bp + 2261 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 38062705-38063397(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTCTT
SmilChr02G002246 Chr02 NC_080388.1:39893415-39893426promoter 内 1714-1725 bp - 2276 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 39895702-39906559(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTCGT
SmilChr08G000062 Chr08 NC_080394.1:365852-365863promoter 内 1673-1684 bp - 2317 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 360351-363535(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGACAGCTCTC
SmilChr02G003986 Chr02 NC_080388.1:62118730-62118741promoter 内 1650-1661 bp + 2340 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 62108959-62116390(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGAGCTGTCAG
SmilChr02G002903 Chr02 NC_080388.1:49344589-49344600promoter 内 1584-1595 bp + 2406 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 49347006-49348582(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTCTT
SmilChr08G001804 Chr08 NC_080394.1:15219538-15219549promoter 内 1536-1547 bp + 2454 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 15222003-15222726(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTCTC
SmilChr06G000715 Chr06 NC_080392.1:6512771-6512782promoter 内 1520-1531 bp - 2470 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 6506773-6510301(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTGAT
SmilChr02G003102 Chr02 NC_080388.1:51956370-51956381promoter 内 1513-1524 bp + 2477 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 51951341-51953893(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGAGCTGTCAG
SmilChr05G003106 Chr05 NC_080391.1:39514826-39514837promoter 内 1354-1365 bp + 2636 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 39517473-39519063(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTCCAGCTGTG
SmilChr04G002093 Chr04 NC_080390.1:33756333-33756344promoter 内 1348-1359 bp + 2642 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 33751699-33753691(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGAAA
SmilChr06G001486 Chr06 NC_080392.1:15825385-15825396promoter 内 1287-1298 bp - 2703 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 15828099-15837719(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAT
SmilChr04G000007 Chr04 NC_080390.1:109187-109198promoter 内 1190-1201 bp + 2800 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 111998-116009(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTCCAGCTGTG
SmilChr01G003088 Chr01 NC_080387.1:49701462-49701473promoter 内 1110-1121 bp + 2880 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 49704353-49705442(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTCTT
SmilChr03G003961 Chr03 NC_080389.1:58659065-58659076promoter 内 942-953 bp + 3048 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 58652800-58656017(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTCGA
SmilChr08G003390 Chr08 NC_080394.1:35639619-35639630promoter 内 880-891 bp + 3110 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 35633786-35636509(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCAT
SmilChr01G001036 Chr01 NC_080387.1:21548293-21548304promoter 内 879-890 bp - 3111 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 21551415-21557729(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGAGCTGTCAG
SmilChr07G003148 Chr07 NC_080393.1:33380582-33380593promoter 内 649-660 bp + 3341 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 33383934-33389391(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTGAT
SmilChr03G001588 Chr03 NC_080389.1:20160723-20160734promoter 内 614-625 bp - 3376 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 20155339-20157347(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGACAGCTCGC
SmilChr08G002348 Chr08 NC_080394.1:22183708-22183719promoter 内 579-590 bp + 3411 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 22187130-22188841(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTATC
SmilChr07G002581 Chr07 NC_080393.1:24695158-24695169promoter 内 513-524 bp + 3477 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 24698646-24700256(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTCCAGCTGTG
SmilChr08G002478 Chr08 NC_080394.1:23696520-23696531promoter 内 316-327 bp + 3674 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 23688814-23692846(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGAGCTGTCGC
SmilChr01G004953 Chr01 NC_080387.1:67602820-67602831promoter 内 265-276 bp - 3725 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 67606556-67615522(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGAAA
SmilChr02G005332 Chr02 NC_080388.1:74159340-74159351promoter 内 250-261 bp - 3740 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 74153415-74155600(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTATC
SmilChr01G004500 Chr01 NC_080387.1:63101906-63101917promoter 内 209-220 bp + 3781 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 63097059-63098125(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGAAA
SmilChr01G005387 Chr01 NC_080387.1:71161463-71161474promoter 内 187-198 bp - 3803 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 71165277-71171837(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTCGA
SmilChr03G001590 Chr03 NC_080389.1:20160723-20160734promoter 内 123-134 bp - 3867 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 20164601-20166011(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGAGCTGTCGC
SmilChr05G002712 Chr05 NC_080391.1:31240339-31240350promoter 内 62-73 bp + 3928 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 31235920-31236411(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTCCT
SmilChr01G003589 Chr01 NC_080387.1:54430383-54430394promoter 内 41-52 bp - 3949 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 54434343-54437470(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCAT
SmilChr07G003129 Chr07 NC_080393.1:33198656-33198667promoter 内 17-28 bp + 3973 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 33202640-33208096(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTGAT
SmilChr04G001213 Chr04 NC_080390.1:18884496-18884507promoter 内 2109-2120 bp + 1881 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 4 18879732-18882615(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAGCTGTAAC
SmilChr06G000245 Chr06 NC_080392.1:1634015-1634026promoter 内 972-983 bp + 3018 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 4 1637044-1638905(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGGACAGCTGTT
SmilChr02G000495 Chr02 NC_080388.1:6836776-6836787promoter 内 134-145 bp - 3856 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 4 6832840-6832920(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTGAC
SmilChr07G001596 Chr07 NC_080393.1:13264919-13264930promoter 内 3743-3754 bp + 247 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 3 13260964-13264672(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGAAA
SmilChr04G000965 Chr04 NC_080390.1:12893749-12893760promoter 内 1626-1637 bp - 2364 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 3 12890777-12891385(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTTACAGCTGGA
SmilChr01G004885 Chr01 NC_080387.1:66913060-66913071promoter 内 1229-1240 bp + 2761 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 3 66915832-66919325(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTCCAGCTGTT
SmilChr01G000622 Chr01 NC_080387.1:13929855-13929866promoter 内 955-966 bp - 3035 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 3 13932901-13935849(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGAAA
SmilChr04G000188 Chr04 NC_080390.1:1679725-1679736promoter 内 484-495 bp + 3506 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 3 1664960-1676219(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGAAA
SmilChr07G003449 Chr07 NC_080393.1:38385876-38385887promoter 内 297-308 bp - 3693 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 3 38389580-38392982(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGAAA
SmilChr04G004092 Chr04 NC_080390.1:55921240-55921251promoter 内 3709-3720 bp - 281 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 55917490-55920959(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTCGC
SmilChr04G002437 Chr04 NC_080390.1:39040643-39040654promoter 内 3495-3506 bp - 495 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 39035854-39040148(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGGACAGCTGGT
SmilChr02G003442 Chr02 NC_080388.1:55700251-55700262promoter 内 3332-3343 bp - 658 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 55696078-55699593(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTTACAGCTGGA
SmilChr05G000402 Chr05 NC_080391.1:3038705-3038716promoter 内 3187-3198 bp + 803 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 3034937-3037902(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGAAA
SmilChr05G002576 Chr05 NC_080391.1:28956094-28956105promoter 内 3066-3077 bp + 924 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 28957029-28957135(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTTACAGCTGGA
SmilChr05G000774 Chr05 NC_080391.1:6036599-6036610promoter 内 2955-2966 bp + 1035 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 6034367-6035564(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTCCT