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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G003955; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00019539-RA_Salv SmilChr04G003955 ERF XP_057805828.1 MP00120 GATATTGTCGGTGGT

可能结合的靶基因

7514 个结合位点 6144 个候选靶基因 第 37 / 123 下载 TSV

上一页 37 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G005504 Chr01 NC_080387.1:71908004-71908018promoter 内 1076-1090 bp + 2911 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 71903118-71905093(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GCCACCGACGCGGAG
SmilChr05G001481 Chr05 NC_080391.1:13590675-13590689promoter 内 1043-1057 bp - 2944 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 13586828-13587731(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ATAATTGTCGGTGAC
SmilChr02G002873 Chr02 NC_080388.1:48975378-48975392promoter 内 959-973 bp + 3028 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 48969672-48972350(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 CCCACCGACAAGATG
SmilChr04G000461 Chr04 NC_080390.1:4917205-4917219promoter 内 904-918 bp + 3083 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 4906099-4914122(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACCACCGCCACCACA
SmilChr05G002889 Chr05 NC_080391.1:34663396-34663410promoter 内 829-843 bp + 3158 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 34666568-34666674(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TGGGTTGTCGGCGGC
SmilChr07G002262 Chr07 NC_080393.1:20822022-20822036promoter 内 807-821 bp - 3180 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 20816555-20818842(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GGTGGCGGCGGTGGT
SmilChr02G002092 Chr02 NC_080388.1:37554390-37554404promoter 内 742-756 bp - 3245 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 37557649-37560198(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACCACCGCCACATCG
SmilChr02G004221 Chr02 NC_080388.1:64421109-64421123promoter 内 729-743 bp + 3258 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 64424381-64430938(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 CGATGTGGCGGTGGT
SmilChr02G001804 Chr02 NC_080388.1:32895521-32895535promoter 内 674-688 bp + 3313 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 32888362-32892208(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACCACCGCCGCCTCC
SmilChr02G004642 Chr02 NC_080388.1:68880175-68880189promoter 内 625-639 bp - 3362 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 68869286-68876813(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 AAAAGTGTCGGTGAG
SmilChr02G005056 Chr02 NC_080388.1:72265461-72265475promoter 内 594-608 bp - 3393 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 72268868-72276167(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GGCACCGACAAAATT
SmilChr06G002869 Chr06 NC_080392.1:41532782-41532796promoter 内 524-538 bp + 3463 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 41528149-41529319(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACCACCGCCGCCTCC
SmilChr08G003077 Chr08 NC_080394.1:30983914-30983928promoter 内 377-391 bp + 3610 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 30975282-30980304(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GCCACCGACGGGGCT
SmilChr03G001377 Chr03 NC_080389.1:16298914-16298928promoter 内 336-350 bp - 3651 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 16302579-16304191(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TTCGCCGACAACGCC
SmilChr02G005326 Chr02 NC_080388.1:74124989-74125003promoter 内 297-311 bp + 3690 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 74118531-74121299(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACCACCGCCGCCACC
SmilChr01G002033 Chr01 NC_080387.1:35940239-35940253promoter 内 208-222 bp - 3779 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 35944032-35944170(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GCCGCCGACAACCCA
SmilChr07G001806 Chr07 NC_080393.1:15468007-15468021promoter 内 157-171 bp - 3830 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 15459430-15464177(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ATCTTTGTCGGTGCC
SmilChr03G001267 Chr03 NC_080389.1:14701221-14701235promoter 内 85-99 bp + 3902 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 14705137-14707418(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GGTGGCGGCGGTGGT
SmilChr01G005564 Chr01 NC_080387.1:72446061-72446075promoter 内 48-62 bp - 3939 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 72440327-72442122(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GGAGGCGGCGGTGGT
SmilChr08G002875 Chr08 NC_080394.1:28660551-28660565promoter 内 3158-3172 bp + 829 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 4 28661394-28663210(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GTTGTTGGCGGTGGT
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SmilChr01G003454 Chr01 NC_080387.1:53118146-53118160promoter 内 2791-2805 bp - 1196 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 3 53119356-53121561(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ATCACCGACAGACTC
SmilChr05G001016 Chr05 NC_080391.1:8322230-8322244promoter 内 1600-1614 bp - 2387 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 3 8316357-8319843(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GGCGGCGACGGTGGT
SmilChr05G002373 Chr05 NC_080391.1:26004688-26004702promoter 内 689-703 bp - 3298 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 3 26000980-26001390(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GGCGGCGACGGTGGT
SmilChr05G003397 Chr05 NC_080391.1:45024856-45024870promoter 内 256-270 bp + 3731 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 3 45017544-45021125(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACCACCGCCACCTCA
SmilChr07G001188 Chr07 NC_080393.1:9025659-9025673promoter 内 3888-3902 bp + 99 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 9025772-9027352(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 CACATCGTCGGTGGT
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SmilChr07G001612 Chr07 NC_080393.1:13527224-13527238promoter 内 3458-3472 bp - 529 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 13527767-13534259(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GTCACCGACGATTTC
SmilChr01G002104 Chr01 NC_080387.1:37073047-37073061promoter 内 3304-3318 bp - 683 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 37073744-37074483(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACCACCGTCGCCGCC
SmilChr02G002727 Chr02 NC_080388.1:47198958-47198972promoter 内 2793-2807 bp - 1194 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 47190273-47197764(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GTAGGCGTCGGTGAA
SmilChr01G003515 Chr01 NC_080387.1:53764887-53764901promoter 内 2786-2800 bp - 1201 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 53766102-53768332(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ATCACCGACAGACTC
SmilChr05G002831 Chr05 NC_080391.1:33615736-33615750promoter 内 2617-2631 bp + 1370 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 33617120-33622633(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 CGGGATGTCGGTGAC
SmilChr01G004697 Chr01 NC_080387.1:65073929-65073943promoter 内 2532-2546 bp + 1455 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 65070636-65072474(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GACACCGACAACTTC
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SmilChr05G003762 Chr05 NC_080391.1:50915466-50915480promoter 内 2475-2489 bp + 1512 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 50911236-50913954(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ATCACCGACAACTTG
SmilChr06G002858 Chr06 NC_080392.1:41368546-41368560promoter 内 2341-2355 bp + 1646 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 41370206-41373213(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 AAAGCTGTCGGTGCC
SmilChr03G003869 Chr03 NC_080389.1:57802302-57802316promoter 内 2301-2315 bp - 1686 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 57798026-57800616(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GGTTTCGTCGGTGCT
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SmilChr08G002283 Chr08 NC_080394.1:21243583-21243597promoter 内 1596-1610 bp + 2391 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 21240295-21241192(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TTCACCGACATCAAC
SmilChr07G001399 Chr07 NC_080393.1:10867186-10867200promoter 内 1583-1597 bp + 2404 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 10869604-10872537(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GGGGGAGTCGGTGGC
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SmilChr01G004492 Chr01 NC_080387.1:63053686-63053700promoter 内 3646-3660 bp - 341 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 63054041-63058804(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACCACCGCCAAAAGC
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