转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G000949; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003681-RA_Salv SmilChr02G000949 bZIP XP_057795176.1 MP00318 TGCCACGTCAGCATT

可能结合的靶基因

9413 个结合位点 6849 个候选靶基因 第 38 / 137 下载 TSV

上一页 38 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G005410 Chr02 NC_080388.1:74594987-74595001promoter 内 1064-1078 bp - 2923 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 74597924-74598825(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 ATTTATCACGTGGCG
SmilChr04G003067 Chr04 NC_080390.1:47207892-47207906promoter 内 1051-1065 bp - 2936 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 47210842-47212247(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTAGATGACGTGTCA
SmilChr04G003146 Chr04 NC_080390.1:48101906-48101920promoter 内 1046-1060 bp + 2941 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 48097696-48098965(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTAGATGACGTGTCA
SmilChr07G003626 Chr07 NC_080393.1:42776551-42776565promoter 内 940-954 bp - 3047 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 42779612-42780088(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AAATCTGACGTGTCA
SmilChr01G005481 Chr01 NC_080387.1:71789381-71789395promoter 内 765-779 bp - 3222 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 71780374-71786159(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGCCACGTGGTCTTT
SmilChr07G002254 Chr07 NC_080393.1:20718953-20718967promoter 内 759-773 bp + 3228 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 20714064-20715725(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGTTGACACGTGGCA
SmilChr01G004328 Chr01 NC_080387.1:61424348-61424362promoter 内 735-749 bp + 3252 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 61427614-61432136(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGACACGTCATCTAA
SmilChr05G002385 Chr05 NC_080391.1:26306570-26306584promoter 内 656-670 bp - 3331 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 26299731-26303239(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTAGGATCC
SmilChr08G003604 Chr08 NC_080394.1:39123134-39123148promoter 内 655-669 bp + 3332 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 39113326-39119802(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGTGCCGACGTGGAG
SmilChr08G000638 Chr08 NC_080394.1:4749460-4749474promoter 内 648-662 bp - 3339 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 4752813-4753571(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GTTGGTGACGTGGAC
SmilChr04G003746 Chr04 NC_080390.1:53748233-53748247promoter 内 621-635 bp - 3366 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 53751613-53755949(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AAAACTGACGTGGCG
SmilChr05G000285 Chr05 NC_080391.1:2208383-2208397promoter 内 458-472 bp - 3529 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 2202419-2204854(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTAGGATCC
SmilChr01G005483 Chr01 NC_080387.1:71789381-71789395promoter 内 429-443 bp - 3558 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 71792953-71796786(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AAAGACCACGTGGCC
SmilChr02G002079 Chr02 NC_080388.1:37377961-37377975promoter 内 344-358 bp + 3643 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 37372666-37374318(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GAAGAAGACGTGGCC
SmilChr01G005461 Chr01 NC_080387.1:71627157-71627171promoter 内 341-355 bp - 3646 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 71618637-71623511(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTCACAATA
SmilChr02G005411 Chr02 NC_080388.1:74594987-74595001promoter 内 223-237 bp - 3764 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 74598765-74599655(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 ATTTATCACGTGGCG
SmilChr06G000916 Chr06 NC_080392.1:8689873-8689887promoter 内 65-79 bp - 3922 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 8678388-8685951(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGACACGTCATCTAA
SmilChr04G003397 Chr04 NC_080390.1:50506217-50506231promoter 内 63-77 bp - 3924 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 50510155-50510932(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTAGATGACGTGTCA
SmilChr02G001611 Chr02 NC_080388.1:29976272-29976286promoter 内 14-28 bp - 3973 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 29980259-29983080(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTAGATGACGTGTCA
SmilChr06G000535 Chr06 NC_080392.1:4457391-4457405promoter 内 3832-3846 bp + 155 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 4 4453857-4457236(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AAGTGCCACGTGGCG
SmilChr03G003685 Chr03 NC_080389.1:55708928-55708942promoter 内 3050-3064 bp - 937 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 4 55707074-55707991(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTGTCACTC
SmilChr08G003507 Chr08 NC_080394.1:37644196-37644210promoter 内 3346-3360 bp - 641 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 3 37639022-37643555(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTGTCACTC
SmilChr07G003881 Chr07 NC_080393.1:48441947-48441961promoter 内 3309-3323 bp - 678 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 3 48440398-48441269(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTGTCCCGG
SmilChr05G001089 Chr05 NC_080391.1:9082331-9082345promoter 内 2646-2660 bp - 1341 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 3 9083686-9086490(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GTAAATGACGTGGCA
SmilChr03G001692 Chr03 NC_080389.1:22438272-22438286promoter 内 2488-2502 bp - 1499 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 3 22432963-22436773(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTAATCGCC
SmilChr06G001800 Chr06 NC_080392.1:21168822-21168836promoter 内 1012-1026 bp + 2975 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 3 21171811-21173884(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGGCCTCA
SmilChr08G002259 Chr08 NC_080394.1:20844639-20844653promoter 内 988-1002 bp + 2999 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 3 20847652-20856964(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTAGGCTGG
SmilChr08G003439 Chr08 NC_080394.1:36714708-36714722promoter 内 3943-3957 bp - 44 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 36714766-36717843(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GAGTGACACGTGGCA
SmilChr08G001058 Chr08 NC_080394.1:8138587-8138601promoter 内 3914-3928 bp + 73 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 8137623-8138514(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TAAAGCGACGTGGCA
SmilChr08G001022 Chr08 NC_080394.1:7756537-7756551promoter 内 3906-3920 bp + 81 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 7755571-7756456(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TAAAGCGACGTGGCA
SmilChr06G001007 Chr06 NC_080392.1:9967290-9967304promoter 内 3811-3825 bp - 176 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 9967480-9967972(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 ACAGCTGACGTGGAG
SmilChr08G002175 Chr08 NC_080394.1:19668329-19668343promoter 内 3678-3692 bp + 309 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 19668652-19675879(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGCCACGTCAGACGA
SmilChr01G000409 Chr01 NC_080387.1:8334811-8334825promoter 内 3589-3603 bp - 398 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 8335223-8340175(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CCGGCTGACGTGGAA
SmilChr04G002294 Chr04 NC_080390.1:37216686-37216700promoter 内 3393-3407 bp - 594 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 37215355-37216092(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTCATTAAT
SmilChr07G000977 Chr07 NC_080393.1:7114618-7114632promoter 内 3337-3351 bp + 650 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 7109618-7113968(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGCGCCTACGTGGCG
SmilChr07G000978 Chr07 NC_080393.1:7114618-7114632promoter 内 2702-2716 bp + 1285 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 7115917-7121423(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTAGGCGCC
SmilChr07G003882 Chr07 NC_080393.1:48464185-48464199promoter 内 2574-2588 bp - 1413 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 48461807-48462772(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTGTCCCGG
SmilChr06G000970 Chr06 NC_080392.1:9420292-9420306promoter 内 2220-2234 bp + 1767 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 9415331-9418525(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGGGGACACGTGGCC
SmilChr08G002506 Chr08 NC_080394.1:24118095-24118109promoter 内 2168-2182 bp - 1819 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 24114131-24116276(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTCTACCAC
SmilChr04G000044 Chr04 NC_080390.1:420258-420272promoter 内 2145-2159 bp - 1842 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 414793-418416(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTCATCGAC
SmilChr07G001745 Chr07 NC_080393.1:14801729-14801743promoter 内 1932-1946 bp - 2055 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 14803798-14809162(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 ATTAATGACGTGGCA
SmilChr02G002633 Chr02 NC_080388.1:45704666-45704680promoter 内 1623-1637 bp - 2364 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 45702231-45702302(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTAACAATT
SmilChr04G000046 Chr04 NC_080390.1:420258-420272promoter 内 1488-1502 bp - 2499 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 422771-424229(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GTCGATGACGTGGCT
SmilChr05G001202 Chr05 NC_080391.1:10100419-10100433promoter 内 1013-1027 bp + 2974 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 10095412-10097445(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TAAAGCGACGTGGCA
SmilChr04G002296 Chr04 NC_080390.1:37216686-37216700promoter 内 735-749 bp - 3252 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 37219952-37224381(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 ATTAATGACGTGGCA
SmilChr01G000408 Chr01 NC_080387.1:8334811-8334825promoter 内 494-508 bp - 3493 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 8329720-8331318(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTCCACGTCAGCCGG
SmilChr07G003842 Chr07 NC_080393.1:47621916-47621930promoter 内 37-51 bp + 3950 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 47617115-47617966(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 ATCGCCGACGTGGAA
SmilChr01G005291 Chr01 NC_080387.1:70227906-70227920promoter 内 26-40 bp + 3961 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 70231881-70234315(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGGGCCAA
SmilChr05G004382 Chr05 NC_080391.1:57311655-57311669promoter 内 3954-3968 bp + 33 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 57310871-57311622(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGGTGTGACGTGTCA
SmilChr01G005422 Chr01 NC_080387.1:71413951-71413965promoter 内 3836-3850 bp - 151 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 71407830-71413800(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTGGTATAT