转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr07G002147; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004577-RA_Salv SmilChr07G002147 MYB XP_057774045.1 MP00500 AATATGGATAAGG

可能结合的靶基因

9681 个结合位点 6697 个候选靶基因 第 4 / 134 下载 TSV

上一页 4 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G000116 Chr03 NC_080389.1:1281726-1281738promoter 内 3283-3295 bp - 706 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 1 1280394-1281020(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AATTTGGATAAGG
SmilChr01G001269 Chr01 NC_080387.1:25365012-25365024promoter 内 3266-3278 bp + 723 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 1 25365747-25366130(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATAGAGGATAAGG
SmilChr02G005569 Chr02 NC_080388.1:75590195-75590207promoter 内 3225-3237 bp + 764 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 1 75584703-75589431(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCACTTC
SmilChr03G001872 Chr03 NC_080389.1:25932991-25933003promoter 内 3186-3198 bp + 803 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 1 25933806-25940905(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AAAATGGATAAGG
SmilChr01G002814 Chr01 NC_080387.1:46695663-46695675promoter 内 3061-3073 bp - 928 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 1 46696603-46697667(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCAAATT
SmilChr01G005108 Chr01 NC_080387.1:68864364-68864376promoter 内 2823-2835 bp - 1166 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 1 68865542-68866791(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCAAATT
SmilChr03G002032 Chr03 NC_080389.1:30464490-30464502promoter 内 2757-2769 bp + 1232 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 1 30459959-30463258(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCACTTC
SmilChr01G006067 Chr01 NC_080387.1:76075779-76075791promoter 内 2426-2438 bp - 1563 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 1 76077354-76078168(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCACTTC
SmilChr03G000255 Chr03 NC_080389.1:3003091-3003103promoter 内 2379-2391 bp - 1610 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 1 2998412-3001481(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AATTTGGATAAGG
SmilChr03G000256 Chr03 NC_080389.1:3003091-3003103promoter 内 2098-2110 bp - 1891 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 1 3004994-3009642(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCAAATT
SmilChr03G000115 Chr03 NC_080389.1:1281726-1281738promoter 内 1509-1521 bp - 2480 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 1 1276406-1279246(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AATTTGGATAAGG
SmilChr03G001048 Chr03 NC_080389.1:12215889-12215901promoter 内 1447-1459 bp + 2542 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 1 12203344-12213347(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCAAATT
SmilChr03G000126 Chr03 NC_080389.1:1380466-1380478promoter 内 1381-1393 bp - 2608 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 1 1375998-1377858(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AAAATGGATAAGG
SmilChr01G005421 Chr01 NC_080387.1:71400530-71400542promoter 内 904-916 bp - 3085 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 1 71403627-71407525(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCACACA
SmilChr02G001580 Chr02 NC_080388.1:29523552-29523564promoter 内 737-749 bp + 3252 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 1 29518751-29520300(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCATTTT
SmilChr03G000195 Chr03 NC_080389.1:2181586-2181598promoter 内 3489-3501 bp + 500 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 3 2178065-2181086(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCTCATC
SmilChr01G004076 Chr01 NC_080387.1:59205397-59205409promoter 内 2919-2931 bp + 1070 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 3 59201299-59204327(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCTCATC
SmilChr02G004250 Chr02 NC_080388.1:64694036-64694048promoter 内 3836-3848 bp + 153 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 2 64694201-64695370(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CATATGGATAAGG
SmilChr02G004034 Chr02 NC_080388.1:62636167-62636179promoter 内 1006-1018 bp + 2983 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 2 62630314-62633184(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCGCTAC
SmilChr02G003682 Chr02 NC_080388.1:58188366-58188378promoter 内 460-472 bp - 3529 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 2 58180474-58184837(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GATGAGGATAAGA
SmilChr02G003373 Chr02 NC_080388.1:54866418-54866430promoter 内 386-398 bp - 3603 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 2 54870033-54880559(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCGCTAC
SmilChr01G000471 Chr01 NC_080387.1:9612415-9612427promoter 内 196-208 bp + 3793 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 2 9606995-9608622(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCTCATC
SmilChr01G000611 Chr01 NC_080387.1:13503157-13503169promoter 内 3368-3380 bp + 621 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 13499187-13502536(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCTCATC
SmilChr02G001986 Chr02 NC_080388.1:35819873-35819885promoter 内 2694-2706 bp + 1295 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 35818472-35818578(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCTCATC
SmilChr02G002104 Chr02 NC_080388.1:37723662-37723674promoter 内 2694-2706 bp - 1295 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 37724969-37727465(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCGCTAC
SmilChr03G001821 Chr03 NC_080389.1:24899184-24899196promoter 内 2567-2579 bp + 1422 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 24889803-24897762(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCGCTAC
SmilChr02G002359 Chr02 NC_080388.1:41373629-41373641promoter 内 2541-2553 bp - 1448 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 41375089-41377936(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCTTTAC
SmilChr03G001984 Chr03 NC_080389.1:28991458-28991470promoter 内 2326-2338 bp + 1663 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 28993133-28994051(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GATACGGATAAGG
SmilChr02G003258 Chr02 NC_080388.1:53882405-53882417promoter 内 2278-2290 bp - 1711 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 53884128-53887403(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCGCTAC
SmilChr02G001985 Chr02 NC_080388.1:35819873-35819885promoter 内 2204-2216 bp + 1785 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 35807037-35818088(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCTCATC
SmilChr02G000722 Chr02 NC_080388.1:11619796-11619808promoter 内 1574-1586 bp + 2415 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 11615294-11617381(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCGCTAC
SmilChr03G002241 Chr03 NC_080389.1:35330542-35330554promoter 内 1276-1288 bp - 2713 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 35333267-35335667(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCGCTAC
SmilChr02G005074 Chr02 NC_080388.1:72382096-72382108promoter 内 1253-1265 bp - 2736 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 72384844-72390199(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCACAAC
SmilChr01G000944 Chr01 NC_080387.1:19984760-19984772promoter 内 1188-1200 bp + 2801 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 19987573-20000390(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CTAGTGGATAAGG
SmilChr01G004339 Chr01 NC_080387.1:61566583-61566595promoter 内 766-778 bp - 3223 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 61558126-61563360(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GATGAGGATAAGA
SmilChr03G001629 Chr03 NC_080389.1:20988819-20988831promoter 内 558-570 bp - 3431 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 20992262-20994544(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCGCTAC
SmilChr03G002178 Chr03 NC_080389.1:33853722-33853734promoter 内 295-307 bp - 3694 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 33857428-33859654(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCGCTAC
SmilChr01G002053 Chr01 NC_080387.1:36321512-36321524promoter 内 288-300 bp - 3701 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 36325225-36326087(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCTCATC
SmilChr02G003506 Chr02 NC_080388.1:56247288-56247300promoter 内 2823-2835 bp + 1166 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 3 56244107-56246122(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCATTCC
SmilChr02G003558 Chr02 NC_080388.1:56750169-56750181promoter 内 2782-2794 bp + 1207 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 3 56746991-56748962(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCATTCC
SmilChr03G002166 Chr03 NC_080389.1:33703214-33703226promoter 内 2750-2762 bp - 1239 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 3 33695972-33701975(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CTTGAGGATAAGG
SmilChr01G002173 Chr01 NC_080387.1:37814883-37814895promoter 内 3685-3697 bp + 304 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 2 37813497-37814579(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCAAATA
SmilChr02G003267 Chr02 NC_080388.1:53936160-53936172promoter 内 3282-3294 bp - 707 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 2 53936879-53938637(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCAAATA
SmilChr02G000500 Chr02 NC_080388.1:6885012-6885024promoter 内 2677-2689 bp - 1312 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 2 6882747-6883700(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TTAGAGGATAAGG
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SmilChr01G005349 Chr01 NC_080387.1:70742108-70742120promoter 内 1760-1772 bp - 2229 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 2 70744349-70746037(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCATTCC
SmilChr03G001489 Chr03 NC_080389.1:17957440-17957452promoter 内 1647-1659 bp - 2342 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 2 17953517-17955098(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TTAGAGGATAAGG
SmilChr03G002350 Chr03 NC_080389.1:37130362-37130374promoter 内 1231-1243 bp - 2758 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 2 37133132-37137085(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCATTTA
SmilChr01G004230 Chr01 NC_080387.1:60688305-60688317promoter 内 584-596 bp - 3405 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 2 60683153-60684900(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TAAATGGATAAGG