转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004199; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00010571-RA_Salv SmilChr01G004199 bHLH XP_057782208.1 MP00074 AGAAGGTCACGTGG

可能结合的靶基因

9969 个结合位点 7396 个候选靶基因 第 43 / 148 下载 TSV

上一页 43 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G000185 Chr02 NC_080388.1:2338964-2338977promoter 内 2982-2995 bp - 1006 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 2336804-2337958(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGAGCAGCACGTGG
SmilChr01G003604 Chr01 NC_080387.1:54584845-54584858promoter 内 2675-2688 bp + 1313 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 54580869-54583532(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTTCCACC
SmilChr02G003001 Chr02 NC_080388.1:50677539-50677552promoter 内 2554-2567 bp - 1434 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 50678986-50681683(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTTCCACC
SmilChr04G004164 Chr04 NC_080390.1:56307079-56307092promoter 内 2056-2069 bp + 1932 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 56304289-56305147(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGACTCTCG
SmilChr01G002886 Chr01 NC_080387.1:47477559-47477572promoter 内 1847-1860 bp - 2141 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 47479713-47482005(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGACACTAC
SmilChr05G003853 Chr05 NC_080391.1:52053285-52053298promoter 内 299-312 bp + 3689 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 52046866-52049596(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCGCCAAC
SmilChr07G002046 Chr07 NC_080393.1:18579890-18579903promoter 内 163-176 bp - 3825 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 18573459-18576065(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CGCAAGTCACGTGA
SmilChr06G001501 Chr06 NC_080392.1:16083506-16083519promoter 内 135-148 bp - 3853 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 16066318-16079653(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAAGTGCCACGTGG
SmilChr08G000908 Chr08 NC_080394.1:6714126-6714139promoter 内 3984-3997 bp + 4 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 6714143-6715141(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCATGTCACGTGT
SmilChr05G001054 Chr05 NC_080391.1:8735770-8735783promoter 内 3910-3923 bp - 78 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 8735861-8739073(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGACATACA
SmilChr06G002167 Chr06 NC_080392.1:29819320-29819333promoter 内 3881-3894 bp + 107 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 29819440-29822903(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTCTAGACACGTGG
SmilChr01G005683 Chr01 NC_080387.1:73097282-73097295promoter 内 3699-3712 bp - 289 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 73096556-73096993(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGCCTGTCACGTGA
SmilChr05G000279 Chr05 NC_080391.1:2172431-2172444promoter 内 3553-3566 bp + 435 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 2169076-2171996(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGACGTATA
SmilChr01G001615 Chr01 NC_080387.1:30275660-30275673promoter 内 3551-3564 bp + 437 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 30276110-30278142(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGTAAGTCACGTGT
SmilChr06G001237 Chr06 NC_080392.1:12773297-12773310promoter 内 3512-3525 bp - 476 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 12750540-12772821(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TAAGAGACACGTGG
SmilChr07G001842 Chr07 NC_080393.1:15880119-15880132promoter 内 3383-3396 bp - 605 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 15880737-15880808(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTTCCACC
SmilChr02G004301 Chr02 NC_080388.1:65382080-65382093promoter 内 3332-3345 bp - 656 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 65382749-65386575(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGACGTATA
SmilChr07G000126 Chr07 NC_080393.1:743782-743795promoter 内 3316-3329 bp + 672 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 737305-743110(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTGTTGCA
SmilChr01G003560 Chr01 NC_080387.1:54207715-54207728promoter 内 3160-3173 bp - 828 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 54203024-54206887(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCATGTCACGTGT
SmilChr03G000483 Chr03 NC_080389.1:5139600-5139613promoter 内 3085-3098 bp + 903 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 5133232-5138697(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGACCACAG
SmilChr05G002132 Chr05 NC_080391.1:22414710-22414723promoter 内 3073-3086 bp + 915 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 22415638-22421688(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGGCGCTCACGTGG
SmilChr02G004342 Chr02 NC_080388.1:65673927-65673940promoter 内 3047-3060 bp - 941 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 65674881-65678148(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGACGATCC
SmilChr07G003615 Chr07 NC_080393.1:42526071-42526084promoter 内 2986-2999 bp + 1002 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 42527086-42528188(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GACCCGTCACGTGC
SmilChr01G004013 Chr01 NC_080387.1:58545853-58545866promoter 内 2981-2994 bp + 1007 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 58544466-58544846(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCTCTTA
SmilChr01G003156 Chr01 NC_080387.1:50362843-50362856promoter 内 2790-2803 bp - 1198 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 50364054-50367034(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGACATCCA
SmilChr04G003965 Chr04 NC_080390.1:55141761-55141774promoter 内 2594-2607 bp - 1394 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 55138128-55140367(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGATGCACACGTGG
SmilChr06G000120 Chr06 NC_080392.1:847632-847645promoter 内 2563-2576 bp - 1425 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 849070-852407(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTGGCCAG
SmilChr02G004341 Chr02 NC_080388.1:65673927-65673940promoter 内 2461-2474 bp - 1527 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 65669848-65672400(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGATCGTCACGTGA
SmilChr07G000556 Chr07 NC_080393.1:3839932-3839945promoter 内 2288-2301 bp + 1700 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 3836456-3838232(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTGTTGCA
SmilChr05G000280 Chr05 NC_080391.1:2172431-2172444promoter 内 2119-2132 bp + 1869 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 2174313-2180007(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TATACGTCACGTGG
SmilChr02G002608 Chr02 NC_080388.1:45241714-45241727promoter 内 2075-2088 bp - 1913 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 45237515-45239801(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGGAGATCACGTGC
SmilChr04G003964 Chr04 NC_080390.1:55141761-55141774promoter 内 2072-2085 bp - 1916 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 55131980-55139845(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGATGCACACGTGG
SmilChr01G001313 Chr01 NC_080387.1:26111727-26111740promoter 内 1857-1870 bp - 2131 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 26102816-26109596(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTAGCTTCACGTGG
SmilChr01G003285 Chr01 NC_080387.1:51540579-51540592promoter 内 1806-1819 bp + 2182 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 51535512-51538397(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCTTGTT
SmilChr06G001790 Chr06 NC_080392.1:20946645-20946658promoter 内 1202-1215 bp - 2786 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 20949444-20951427(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGACATACA
SmilChr08G000522 Chr08 NC_080394.1:3810949-3810962promoter 内 1189-1202 bp + 2799 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 3798702-3808150(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAGCCTAA
SmilChr06G003120 Chr06 NC_080392.1:44028819-44028832promoter 内 1035-1048 bp + 2953 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 44019043-44025866(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAGCCTAA
SmilChr05G000626 Chr05 NC_080391.1:4733163-4733176promoter 内 883-896 bp + 3105 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 4728857-4730058(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTGGCGTT
SmilChr04G003997 Chr04 NC_080390.1:55339734-55339747promoter 内 866-879 bp + 3122 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 55342869-55345759(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CTGCGGACACGTGG
SmilChr08G000909 Chr08 NC_080394.1:6714126-6714139promoter 内 724-737 bp + 3264 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 6717403-6721064(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCATGTCACGTGT
SmilChr07G000651 Chr07 NC_080393.1:4384841-4384854promoter 内 576-589 bp - 3412 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 4388266-4390307(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGACATACA
SmilChr07G002717 Chr07 NC_080393.1:26635460-26635473promoter 内 559-572 bp + 3429 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 26628752-26632031(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCACCTCT
SmilChr01G004012 Chr01 NC_080387.1:58545853-58545866promoter 内 276-289 bp + 3712 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 58537138-58542141(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCTCTTA
SmilChr01G005513 Chr01 NC_080387.1:71961443-71961456promoter 内 251-264 bp - 3737 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 71965193-71969166(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCTGCTCC
SmilChr07G001840 Chr07 NC_080393.1:15880119-15880132promoter 内 22-35 bp - 3966 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 15872909-15876153(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGTGGAACACGTGG
SmilChr07G001390 Chr07 NC_080393.1:10780311-10780324promoter 内 3268-3281 bp + 720 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 4 10781044-10781781(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGGTGCTCACGTGC
SmilChr07G001391 Chr07 NC_080393.1:10780311-10780324promoter 内 2004-2017 bp + 1984 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 4 10782308-10786261(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGGTGCTCACGTGC
SmilChr07G001389 Chr07 NC_080393.1:10780311-10780324promoter 内 1832-1845 bp + 2156 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 4 10776046-10778155(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGAGCACCC
SmilChr04G002972 Chr04 NC_080390.1:46086018-46086031promoter 内 3340-3353 bp - 648 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 3 46086679-46089185(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGACATCAC
SmilChr04G003954 Chr04 NC_080390.1:55088384-55088397promoter 内 3050-3063 bp - 938 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 3 55084871-55087446(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCGGTTCACGTGC