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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004199; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00010571-RA_Salv SmilChr01G004199 bHLH XP_057782208.1 MP00074 AGAAGGTCACGTGG

可能结合的靶基因

9969 个结合位点 7396 个候选靶基因 第 50 / 148 下载 TSV

上一页 50 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G003973 Chr05 NC_080391.1:53532883-53532896promoter 内 3618-3631 bp - 370 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 53530986-53532513(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATCGTCACACGTGG
SmilChr03G002287 Chr03 NC_080389.1:36070547-36070560promoter 内 3389-3402 bp - 599 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 36067534-36069948(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCGGACCACGTGG
SmilChr05G002043 Chr05 NC_080391.1:21268502-21268515promoter 内 3260-3273 bp - 728 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 21269243-21274259(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCCAACA
SmilChr03G002288 Chr03 NC_080389.1:36070547-36070560promoter 内 3175-3188 bp - 813 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 36071373-36071968(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGTCCGCA
SmilChr03G002787 Chr03 NC_080389.1:44379600-44379613promoter 内 2491-2504 bp + 1497 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 44374577-44378103(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCCAACA
SmilChr02G002353 Chr02 NC_080388.1:41319510-41319523promoter 内 1438-1451 bp - 2550 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 41314921-41316960(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGTTGGCCACGTGG
SmilChr07G004165 Chr07 NC_080393.1:53540426-53540439promoter 内 1133-1146 bp - 2855 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 53534916-53537571(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTGAGTCCACGTGG
SmilChr04G002320 Chr04 NC_080390.1:37496386-37496399promoter 内 797-810 bp + 3191 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 37490730-37493195(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCCAACA
SmilChr08G000881 Chr08 NC_080394.1:6520095-6520108promoter 内 527-540 bp - 3461 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 6515571-6516634(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGATGCCCACGTGG
SmilChr03G003438 Chr03 NC_080389.1:52731186-52731199promoter 内 396-409 bp - 3592 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 52734791-52736443(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTGCTGTT
SmilChr04G001957 Chr04 NC_080390.1:31764054-31764067promoter 内 170-183 bp + 3818 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 31767885-31769396(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCGGACCACGTGG
SmilChr07G003333 Chr07 NC_080393.1:35674568-35674581promoter 内 78-91 bp + 3910 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 35668856-35670658(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGACCAGCT
SmilChr02G002106 Chr02 NC_080388.1:37756052-37756065promoter 内 70-83 bp + 3918 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 37759983-37770656(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGTTGGCCACGTGG
SmilChr04G000426 Chr04 NC_080390.1:4521414-4521427promoter 内 3922-3935 bp - 66 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 4521493-4527189(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGATCCGCT
SmilChr04G002343 Chr04 NC_080390.1:37791081-37791094promoter 内 3850-3863 bp - 138 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 37791232-37795242(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGAGGCACC
SmilChr06G000476 Chr06 NC_080392.1:3878256-3878269promoter 内 3828-3841 bp + 160 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 3876372-3878096(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGAAATCCC
SmilChr02G000134 Chr02 NC_080388.1:1843472-1843485promoter 内 3792-3805 bp - 196 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 1840720-1843276(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TTTATGTCACGTGG
SmilChr02G000275 Chr02 NC_080388.1:3524442-3524455promoter 内 3452-3465 bp - 536 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 3519795-3523906(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CGAAGCTCACGTGC
SmilChr04G000486 Chr04 NC_080390.1:5235019-5235032promoter 内 3210-3223 bp - 778 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 5235810-5236573(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCCGGAG
SmilChr05G003578 Chr05 NC_080391.1:47778289-47778302promoter 内 2664-2677 bp - 1324 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 47779626-47781895(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGACATTCA
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SmilChr01G005062 Chr01 NC_080387.1:68527513-68527526promoter 内 2594-2607 bp - 1394 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 68528920-68531209(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTACACCC
SmilChr02G003760 Chr02 NC_080388.1:59291559-59291572promoter 内 2418-2431 bp + 1570 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 59263956-59289989(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGAGATGCC
SmilChr02G003082 Chr02 NC_080388.1:51743808-51743821promoter 内 2225-2238 bp + 1763 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 51741973-51742045(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTACACCC
SmilChr01G004661 Chr01 NC_080387.1:64717131-64717144promoter 内 2191-2204 bp - 1797 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 64718941-64721423(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCCAACA
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SmilChr05G003658 Chr05 NC_080391.1:49285159-49285172promoter 内 1846-1859 bp + 2142 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 49267757-49283017(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCCAACA
SmilChr05G003666 Chr05 NC_080391.1:49570248-49570261promoter 内 1818-1831 bp - 2170 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 49572431-49592701(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCCAACA
SmilChr06G002772 Chr06 NC_080392.1:40321408-40321421promoter 内 1740-1753 bp - 2248 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 40307238-40319160(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGTTGGCCACGTGG
SmilChr04G000138 Chr04 NC_080390.1:1187978-1187991promoter 内 1728-1741 bp - 2260 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 1179164-1185718(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGTTGGGCACGTGG
SmilChr03G004249 Chr03 NC_080389.1:60969209-60969222promoter 内 1693-1706 bp + 2295 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 60971517-60975668(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGTAGCTCACGTGC
SmilChr04G003568 Chr04 NC_080390.1:52053313-52053326promoter 内 1599-1612 bp - 2389 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 52055715-52056212(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGACTTTCA
SmilChr03G003308 Chr03 NC_080389.1:51299226-51299239promoter 内 1404-1417 bp - 2584 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 51301823-51305094(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCCCTATA
SmilChr02G000135 Chr02 NC_080388.1:1843472-1843485promoter 内 1401-1414 bp - 2587 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 1846072-1849597(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGACATAAA
SmilChr06G002901 Chr06 NC_080392.1:41828280-41828293promoter 内 1295-1308 bp + 2693 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 41823419-41825587(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAATCGCG
SmilChr03G003031 Chr03 NC_080389.1:47231742-47231755promoter 内 1158-1171 bp + 2830 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 47225785-47228912(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTAGCTCG
SmilChr02G000079 Chr02 NC_080388.1:1039094-1039107promoter 内 988-1001 bp + 3000 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 1032482-1036094(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGACATAAA
SmilChr07G002385 Chr07 NC_080393.1:22265755-22265768promoter 内 688-701 bp + 3300 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 22261161-22262455(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTAGCTCG
SmilChr03G001941 Chr03 NC_080389.1:27633741-27633754promoter 内 503-516 bp - 3485 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 27621750-27630256(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGTTGGTCACGTGC
SmilChr08G001433 Chr08 NC_080394.1:11471339-11471352promoter 内 431-444 bp + 3557 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 11474909-11476572(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CGAAGCTCACGTGC
SmilChr07G002446 Chr07 NC_080393.1:22962089-22962102promoter 内 379-392 bp + 3609 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 22955372-22958480(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTGACGAT
SmilChr02G000582 Chr02 NC_080388.1:8378798-8378811promoter 内 98-111 bp - 3890 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 8382701-8383882(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCGTCGTC
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SmilChr02G000581 Chr02 NC_080388.1:8378798-8378811promoter 内 13-26 bp - 3975 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 8373689-8374823(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GACGACGCACGTGG
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SmilChr04G002426 Chr04 NC_080390.1:38903602-38903615promoter 内 3888-3901 bp - 100 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 38899046-38903502(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TTGTGGGCACGTGG