转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 59 / 143 下载 TSV

上一页 59 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr07G001280 Chr07 NC_080393.1:9841647-9841658promoter 内 717-728 bp - 3273 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 9844931-9847315(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTAAC
SmilChr03G000925 Chr03 NC_080389.1:10588887-10588898promoter 内 611-622 bp - 3379 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 10592277-10598534(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTAAC
SmilChr02G005586 Chr02 NC_080388.1:75670895-75670906promoter 内 576-587 bp + 3414 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 75664446-75667481(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTAAC
SmilChr07G000944 Chr07 NC_080393.1:6727931-6727942promoter 内 525-536 bp - 3465 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 6731407-6733814(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTCCT
SmilChr04G000280 Chr04 NC_080390.1:2580320-2580331promoter 内 519-530 bp - 3471 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 2583802-2584549(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTAGCTGTCGA
SmilChr08G003543 Chr08 NC_080394.1:38076103-38076114promoter 内 89-100 bp - 3901 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 38068454-38072202(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CGGACAGCTGAC
SmilChr07G000353 Chr07 NC_080393.1:2423083-2423094promoter 内 58-69 bp + 3932 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 2418256-2419151(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGAGCTGTCTA
SmilChr07G000882 Chr07 NC_080393.1:6298040-6298051promoter 内 25-36 bp + 3965 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 6302016-6302086(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTTACAGCTGAA
SmilChr08G000852 Chr08 NC_080394.1:6310317-6310328promoter 内 1840-1851 bp - 2150 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 4 6312478-6315050(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTAAG
SmilChr02G005541 Chr02 NC_080388.1:75420720-75420731promoter 内 795-806 bp - 3195 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 4 75423926-75428294(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTAGA
SmilChr07G004647 Chr07 NC_080393.1:59313214-59313225promoter 内 1207-1218 bp - 2783 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 3 59304323-59310431(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTTACAGCTGTG
SmilChr04G003016 Chr04 NC_080390.1:46557730-46557741promoter 内 1125-1136 bp - 2865 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 3 46553509-46554865(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTTACAGCTGGT
SmilChr01G002257 Chr01 NC_080387.1:39333905-39333916promoter 内 1017-1028 bp + 2973 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 3 39327723-39330932(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAGCTGTAGT
SmilChr03G001754 Chr03 NC_080389.1:23818796-23818807promoter 内 943-954 bp - 3047 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 3 23821854-23824307(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGAGCTGTCTT
SmilChr05G002980 Chr05 NC_080391.1:36334894-36334905promoter 内 3861-3872 bp - 129 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 36333557-36334765(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTATA
SmilChr03G001613 Chr03 NC_080389.1:20524804-20524815promoter 内 3788-3799 bp + 202 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 20525017-20526193(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTACAGCTGTA
SmilChr02G004376 Chr02 NC_080388.1:66120028-66120039promoter 内 3777-3788 bp + 213 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 66117266-66119815(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTAAG
SmilChr03G001612 Chr03 NC_080389.1:20524804-20524815promoter 内 3724-3735 bp + 266 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 20523231-20524538(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTAGA
SmilChr05G003042 Chr05 NC_080391.1:38205628-38205639promoter 内 3444-3455 bp + 546 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 38202802-38205082(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTAGA
SmilChr05G003138 Chr05 NC_080391.1:40001810-40001821promoter 内 3444-3455 bp - 546 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 40002367-40005519(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTAGA
SmilChr05G000340 Chr05 NC_080391.1:2538879-2538890promoter 内 3328-3339 bp - 662 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 2539552-2543983(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGAGCTGTCGG
SmilChr01G000007 Chr01 NC_080387.1:165779-165790promoter 内 2599-2610 bp + 1391 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 161384-164388(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTAGA
SmilChr07G004140 Chr07 NC_080393.1:53176643-53176654promoter 内 2500-2511 bp + 1490 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 53178144-53180277(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTATG
SmilChr02G000020 Chr02 NC_080388.1:163926-163937promoter 内 2441-2452 bp + 1549 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 161505-162377(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CATAGCTGTCAG
SmilChr06G002277 Chr06 NC_080392.1:32665040-32665051promoter 内 1948-1959 bp - 2042 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 32660867-32662998(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGACAGCTAGA
SmilChr04G000557 Chr04 NC_080390.1:6230883-6230894promoter 内 1617-1628 bp - 2373 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 6225676-6228510(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTACAGCTGTA
SmilChr07G000179 Chr07 NC_080393.1:1128025-1128036promoter 内 1577-1588 bp - 2413 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 1130449-1134543(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTAGA
SmilChr08G000812 Chr08 NC_080394.1:5986943-5986954promoter 内 1118-1129 bp - 2872 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 5982172-5984071(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTACAGCTGTA
SmilChr02G003799 Chr02 NC_080388.1:59624483-59624494promoter 内 258-269 bp + 3732 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 59619165-59620751(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTAAG
SmilChr02G005539 Chr02 NC_080388.1:75420720-75420731promoter 内 117-128 bp - 3873 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 75413636-75416847(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTACAGCTGTA
SmilChr03G002581 Chr03 NC_080389.1:41078512-41078523promoter 内 33-44 bp - 3957 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 41073099-41074555(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTCGA
SmilChr07G003693 Chr07 NC_080393.1:44463914-44463925promoter 内 3733-3744 bp - 257 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 44464182-44465979(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGAGCTGTCCA
SmilChr02G001888 Chr02 NC_080388.1:34183550-34183561promoter 内 3569-3580 bp + 421 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 34181746-34183129(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATAGCTGTCGA
SmilChr04G000035 Chr04 NC_080390.1:335559-335570promoter 内 3403-3414 bp + 587 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 332948-334972(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGAGCTGTCTT
SmilChr08G002448 Chr08 NC_080394.1:23295547-23295558promoter 内 3360-3371 bp - 630 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 23287348-23294917(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCTACAGCTGTG
SmilChr04G000868 Chr04 NC_080390.1:10947062-10947073promoter 内 3256-3267 bp - 734 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 10947807-10957469(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTAAG
SmilChr02G003670 Chr02 NC_080388.1:58094936-58094947promoter 内 3101-3112 bp - 889 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 58092009-58094047(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTATG
SmilChr02G003669 Chr02 NC_080388.1:58084504-58084515promoter 内 3099-3110 bp - 891 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 58081509-58083613(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTATG
SmilChr07G004648 Chr07 NC_080393.1:59313214-59313225promoter 内 3095-3106 bp - 895 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 59311036-59312319(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTTACAGCTGTG
SmilChr05G002981 Chr05 NC_080391.1:36334894-36334905promoter 内 3037-3048 bp - 953 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 36335858-36343342(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATAGCTGTCGA
SmilChr01G006066 Chr01 NC_080387.1:76070466-76070477promoter 内 2931-2942 bp + 1059 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 76071536-76075726(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTCGA
SmilChr07G000216 Chr07 NC_080393.1:1389161-1389172promoter 内 2916-2927 bp + 1074 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 1390246-1394670(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTAGT
SmilChr03G001891 Chr03 NC_080389.1:26420376-26420387promoter 内 2792-2803 bp + 1198 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 26421585-26424779(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCTACAGCTGGG
SmilChr01G005622 Chr01 NC_080387.1:72713481-72713492promoter 内 2739-2750 bp - 1251 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 72708889-72712230(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTCTC
SmilChr07G001669 Chr07 NC_080393.1:14164106-14164117promoter 内 2712-2723 bp - 1278 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 14156576-14162828(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTTACAGCTGTG
SmilChr06G001885 Chr06 NC_080392.1:22512197-22512208promoter 内 2691-2702 bp + 1299 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 22513507-22515887(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTCTC
SmilChr05G003210 Chr05 NC_080391.1:41152863-41152874promoter 内 2581-2592 bp - 1409 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 41154283-41155149(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGAGCTGTCTT
SmilChr02G000108 Chr02 NC_080388.1:1381970-1381981promoter 内 2325-2336 bp + 1665 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 1377569-1380305(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTAAG
SmilChr02G001014 Chr02 NC_080388.1:17884934-17884945promoter 内 1942-1953 bp - 2048 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 17886993-17888133(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGAGCTGTCCA
SmilChr05G000306 Chr05 NC_080391.1:2325552-2325563promoter 内 1913-1924 bp - 2077 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 2317421-2323475(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCTACAGCTGGG