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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 6 / 149 下载 TSV

上一页 6 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G002683 Chr01 NC_080387.1:45044879-45044889promoter 内 2296-2306 bp + 1695 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 1 45041871-45043184(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGTG
SmilChr05G001033 Chr05 NC_080391.1:8474541-8474551promoter 内 2143-2153 bp + 1848 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 1 8471070-8472693(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGTG
SmilChr01G001657 Chr01 NC_080387.1:30637564-30637574promoter 内 1731-1741 bp + 2260 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 1 30639834-30641550(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CACAGCTGTCA
SmilChr02G002493 Chr02 NC_080388.1:43373357-43373367promoter 内 1573-1583 bp - 2418 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 1 43367254-43370939(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CACAGCTGTCA
SmilChr05G001148 Chr05 NC_080391.1:9650383-9650393promoter 内 1481-1491 bp + 2510 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 1 9645751-9647873(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGTG
SmilChr03G000109 Chr03 NC_080389.1:1198842-1198852promoter 内 1201-1211 bp - 2790 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 1 1201642-1202819(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGTG
SmilChr02G003751 Chr02 NC_080388.1:59153462-59153472promoter 内 810-820 bp + 3181 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 1 59156653-59157317(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CACAGCTGTCA
SmilChr01G003721 Chr01 NC_080387.1:55531019-55531029promoter 内 774-784 bp + 3217 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 1 55534246-55537248(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CACAGCTGTCA
SmilChr04G001339 Chr04 NC_080390.1:21654776-21654786promoter 内 3387-3397 bp - 604 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 4 21655390-21657354(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGGC
SmilChr03G003564 Chr03 NC_080389.1:54292753-54292763promoter 内 239-249 bp + 3752 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 4 54284146-54289001(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGGC
SmilChr07G002705 Chr07 NC_080393.1:26415068-26415078promoter 内 2313-2323 bp + 1678 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 3 26416756-26418358(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGGCC
SmilChr01G005656 Chr01 NC_080387.1:72905906-72905916promoter 内 1442-1452 bp - 2549 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 2 72908465-72910533(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGGC
SmilChr01G005654 Chr01 NC_080387.1:72905906-72905916promoter 内 1297-1307 bp - 2694 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 2 72902302-72903212(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCCAGCTGTCG
SmilChr03G004722 Chr03 NC_080389.1:64436308-64436318promoter 内 1287-1297 bp - 2704 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 2 64430510-64433604(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCCAGCTGTCG
SmilChr03G001971 Chr03 NC_080389.1:28412171-28412181promoter 内 3304-3314 bp - 687 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 28412868-28414304(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGGC
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SmilChr03G004636 Chr03 NC_080389.1:63975256-63975266promoter 内 3207-3217 bp + 784 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 63976050-63982362(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCCAGCTGTCG
SmilChr03G004684 Chr03 NC_080389.1:64251651-64251661promoter 内 2703-2713 bp + 1288 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 64249254-64250363(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGGC
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SmilChr02G000215 Chr02 NC_080388.1:2820616-2820626promoter 内 2392-2402 bp + 1599 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 2817805-2819017(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGGC
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SmilChr07G003158 Chr07 NC_080393.1:33505693-33505703promoter 内 1723-1733 bp - 2268 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 33507971-33508462(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGCCAGCTGGG
SmilChr01G000546 Chr01 NC_080387.1:11274556-11274566promoter 内 1541-1551 bp + 2450 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 11270593-11272106(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGGC
SmilChr01G002535 Chr01 NC_080387.1:43371887-43371897promoter 内 1506-1516 bp - 2485 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 43374382-43379875(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGCCAGCTGGG
SmilChr03G004635 Chr03 NC_080389.1:63975256-63975266promoter 内 1483-1493 bp + 2508 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 63971211-63972748(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGGC
SmilChr03G003226 Chr03 NC_080389.1:49935271-49935281promoter 内 1137-1147 bp - 2854 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 49938135-49940369(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGGC
SmilChr01G002453 Chr01 NC_080387.1:42141985-42141995promoter 内 1075-1085 bp + 2916 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 42133849-42139069(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGGC
SmilChr01G000820 Chr01 NC_080387.1:17717973-17717983promoter 内 974-984 bp + 3017 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 17721000-17723631(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCCAGCTGTCG
SmilChr03G004685 Chr03 NC_080389.1:64251651-64251661promoter 内 599-609 bp + 3392 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 64255053-64258501(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCCAGCTGTCG
SmilChr01G000659 Chr01 NC_080387.1:14692891-14692901promoter 内 489-499 bp + 3502 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 14696403-14698547(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCCAGCTGTCG
SmilChr03G001972 Chr03 NC_080389.1:28412171-28412181promoter 内 217-227 bp - 3774 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 28415955-28416551(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGGC
SmilChr01G000821 Chr01 NC_080387.1:17717973-17717983promoter 内 8-18 bp + 3983 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 17721966-17722389(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCCAGCTGTCG
SmilChr02G000636 Chr02 NC_080388.1:9617097-9617107promoter 内 2060-2070 bp + 1931 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 4 9619038-9620598(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCGGCTGTCA
SmilChr07G002190 Chr07 NC_080393.1:20123015-20123025promoter 内 314-324 bp - 3677 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 4 20118416-20119338(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCGGCTGTCA
SmilChr03G002694 Chr03 NC_080389.1:42935151-42935161promoter 内 2294-2304 bp - 1697 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 3 42900243-42933454(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCGGCTGTCA
SmilChr05G002633 Chr05 NC_080391.1:29708910-29708920promoter 内 2293-2303 bp - 1698 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 3 29703863-29707212(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCGGCTGTCA
SmilChr05G001624 Chr05 NC_080391.1:15143014-15143024promoter 内 3470-3480 bp - 521 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 2 15143545-15143919(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCGGA
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SmilChr03G000201 Chr03 NC_080389.1:2280779-2280789promoter 内 2097-2107 bp + 1894 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 2 2282683-2287094(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCGGCTGTCA
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SmilChr03G001099 Chr03 NC_080389.1:12667854-12667864promoter 内 1619-1629 bp - 2372 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 2 12664727-12665482(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCGGCTGTCA
SmilChr04G000294 Chr04 NC_080390.1:2749683-2749693promoter 内 1282-1292 bp - 2709 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 2 2738606-2746974(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCGGCTGTCA
SmilChr04G000295 Chr04 NC_080390.1:2749683-2749693promoter 内 1064-1074 bp - 2927 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 2 2752620-2753694(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCGGA
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SmilChr05G001514 Chr05 NC_080391.1:13894081-13894091promoter 内 3652-3662 bp - 339 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 13889456-13893742(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCGGCTGTCA
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SmilChr02G000290 Chr02 NC_080388.1:3681167-3681177promoter 内 2861-2871 bp - 1130 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 3679397-3680037(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCGGCTGTCA
SmilChr03G001828 Chr03 NC_080389.1:25030537-25030547promoter 内 2844-2854 bp - 1147 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 25027158-25029390(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCGGCTGTCA