转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 66 / 143 下载 TSV

上一页 66 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr06G001125 Chr06 NC_080392.1:11320235-11320246promoter 内 412-423 bp + 3578 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 11309276-11316657(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGGAGG
SmilChr07G002912 Chr07 NC_080393.1:29516819-29516830promoter 内 117-128 bp - 3873 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 29520703-29522625(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTAGA
SmilChr02G001254 Chr02 NC_080388.1:23026700-23026711promoter 内 88-99 bp + 3902 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 23030613-23031678(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTCGA
SmilChr08G001656 Chr08 NC_080394.1:13765774-13765785promoter 内 3975-3986 bp - 15 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 13765800-13766404(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCGC
SmilChr05G002102 Chr05 NC_080391.1:22024304-22024315promoter 内 3939-3950 bp + 51 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 22024366-22029143(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTCTA
SmilChr06G000933 Chr06 NC_080392.1:8859453-8859464promoter 内 3909-3920 bp + 81 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 8855261-8859372(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCGG
SmilChr02G005253 Chr02 NC_080388.1:73657488-73657499promoter 内 3871-3882 bp + 119 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 73657618-73658492(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGACAGCTCAA
SmilChr02G004083 Chr02 NC_080388.1:63103353-63103364promoter 内 3828-3839 bp - 162 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 63102560-63103191(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTTACAGCTGAT
SmilChr02G002375 Chr02 NC_080388.1:41636614-41636625promoter 内 3733-3744 bp + 257 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 41636284-41636357(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTAAA
SmilChr04G003314 Chr04 NC_080390.1:49878847-49878858promoter 内 3637-3648 bp - 353 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 49879211-49885029(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CATAGCTGTCGT
SmilChr07G000862 Chr07 NC_080393.1:6141886-6141897promoter 内 3519-3530 bp - 471 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 6142368-6143992(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTAAA
SmilChr01G003137 Chr01 NC_080387.1:50161875-50161886promoter 内 3459-3470 bp - 531 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 50162417-50164538(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTAAA
SmilChr05G001187 Chr05 NC_080391.1:9964003-9964014promoter 内 3315-3326 bp + 675 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 9964689-9965042(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTCTA
SmilChr01G001826 Chr01 NC_080387.1:33221565-33221576promoter 内 2992-3003 bp - 998 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 33201879-33220567(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACTACAGCTGTG
SmilChr01G002694 Chr01 NC_080387.1:45195348-45195359promoter 内 2892-2903 bp + 1098 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 45196457-45199085(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGACAGCTCAA
SmilChr01G005630 Chr01 NC_080387.1:72751482-72751493promoter 内 2679-2690 bp + 1311 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 72746687-72750171(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTAGT
SmilChr04G001095 Chr04 NC_080390.1:15670976-15670987promoter 内 2674-2685 bp - 1316 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 15672303-15672911(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGAGCTGTCTA
SmilChr06G000509 Chr06 NC_080392.1:4226634-4226645promoter 内 2656-2667 bp + 1334 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 4227979-4233157(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTCGA
SmilChr03G004423 Chr03 NC_080389.1:62397981-62397992promoter 内 2617-2628 bp + 1373 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 62394783-62396608(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTAAA
SmilChr08G003079 Chr08 NC_080394.1:30989952-30989963promoter 内 2615-2626 bp + 1375 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 30991338-30999256(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTAAG
SmilChr04G003400 Chr04 NC_080390.1:50552073-50552084promoter 内 2532-2543 bp - 1458 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 50549416-50550615(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTAAT
SmilChr01G005927 Chr01 NC_080387.1:75071435-75071446promoter 内 2511-2522 bp - 1479 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 75064532-75069956(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTCGG
SmilChr03G000319 Chr03 NC_080389.1:3645954-3645965promoter 内 2503-2514 bp - 1487 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 3647452-3647530(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCGC
SmilChr02G001842 Chr02 NC_080388.1:33620385-33620396promoter 内 2315-2326 bp + 1675 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 33615806-33618710(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GACAACTGTCAA
SmilChr01G005775 Chr01 NC_080387.1:73840283-73840294promoter 内 2202-2213 bp - 1788 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 73830187-73838495(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTCTA
SmilChr02G005252 Chr02 NC_080388.1:73657488-73657499promoter 内 2095-2106 bp + 1895 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 73654315-73655593(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCGC
SmilChr03G000320 Chr03 NC_080389.1:3645954-3645965promoter 内 2077-2088 bp - 1913 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 3647878-3649690(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCGC
SmilChr03G000518 Chr03 NC_080389.1:5573637-5573648promoter 内 2053-2064 bp - 1937 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 5575585-5578173(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GACAACTGTCAA
SmilChr08G001889 Chr08 NC_080394.1:16393314-16393325promoter 内 1748-1759 bp - 2242 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 16395567-16396396(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GACAACTGTCAA
SmilChr05G001264 Chr05 NC_080391.1:10772099-10772110promoter 内 1694-1705 bp - 2296 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 10774406-10778654(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTAAA
SmilChr04G002398 Chr04 NC_080390.1:38525583-38525594promoter 内 1675-1686 bp + 2315 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 38527909-38529959(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTAAT
SmilChr07G003319 Chr07 NC_080393.1:35453569-35453580promoter 内 1613-1624 bp + 2377 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 35455957-35457659(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTATT
SmilChr01G003316 Chr01 NC_080387.1:51887003-51887014promoter 内 1542-1553 bp - 2448 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 51880672-51884555(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGTC
SmilChr07G001295 Chr07 NC_080393.1:9945615-9945626promoter 内 1540-1551 bp - 2450 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 9941828-9943165(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTAAG
SmilChr05G000084 Chr05 NC_080391.1:465622-465633promoter 内 1532-1543 bp - 2458 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 461963-463164(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGTC
SmilChr05G000702 Chr05 NC_080391.1:5287087-5287098promoter 内 1492-1503 bp + 2498 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 5289596-5291558(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTCGA
SmilChr03G003793 Chr03 NC_080389.1:57027450-57027461promoter 内 1371-1382 bp - 2619 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 57030080-57031847(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGAGCTGTCTA
SmilChr08G003422 Chr08 NC_080394.1:36429421-36429432promoter 内 1371-1382 bp - 2619 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 36423826-36426802(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTCTG
SmilChr01G003585 Chr01 NC_080387.1:54420418-54420429promoter 内 1368-1379 bp + 2622 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 54423051-54425934(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTACAGCTGAG
SmilChr03G001263 Chr03 NC_080389.1:14603774-14603785promoter 内 1323-1334 bp + 2667 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 14598107-14601107(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATAGCTGTCGA
SmilChr04G001968 Chr04 NC_080390.1:31892820-31892831promoter 内 1098-1109 bp - 2892 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 31895723-31900457(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTAAC
SmilChr03G003792 Chr03 NC_080389.1:57027450-57027461promoter 内 1074-1085 bp - 2916 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 57011179-57024534(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTCTA
SmilChr02G002901 Chr02 NC_080388.1:49302644-49302655promoter 内 1050-1061 bp - 2940 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 49292824-49299704(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTCGA
SmilChr03G002981 Chr03 NC_080389.1:46629505-46629516promoter 内 990-1001 bp + 3000 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 46632516-46636803(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTAAG
SmilChr02G002097 Chr02 NC_080388.1:37657320-37657331promoter 内 778-789 bp - 3212 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 37652262-37654108(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTCGA
SmilChr02G005250 Chr02 NC_080388.1:73643471-73643482promoter 内 778-789 bp + 3212 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 73646694-73649996(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTAAT
SmilChr02G004722 Chr02 NC_080388.1:69470772-69470783promoter 内 735-746 bp - 3255 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 69460615-69467517(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTCTA
SmilChr05G000079 Chr05 NC_080391.1:408366-408377promoter 内 626-637 bp - 3364 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 403881-405002(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGTC
SmilChr07G001830 Chr07 NC_080393.1:15780923-15780934promoter 内 626-637 bp - 3364 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 15784298-15792016(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTAAC
SmilChr07G001416 Chr07 NC_080393.1:11016380-11016391promoter 内 625-636 bp - 3365 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 11019756-11020617(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGAGCTGTCTC