转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003688; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003637-RA_Salv SmilChr02G003688 MYB XP_057794248.1 MP00028 GGCTCAGCGCG

可能结合的靶基因

9024 个结合位点 6764 个候选靶基因 第 66 / 136 下载 TSV

上一页 66 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G001400 Chr02 NC_080388.1:26577977-26577987promoter 内 2726-2736 bp + 1265 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 26579252-26582728(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGGTCAGCGCA
SmilChr07G000841 Chr07 NC_080393.1:5984019-5984029promoter 内 2351-2361 bp - 1640 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 5985669-5987754(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGGGCTGAGCG
SmilChr08G003278 Chr08 NC_080394.1:33882816-33882826promoter 内 1583-1593 bp - 2408 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 33885234-33890341(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGACCC
SmilChr02G004981 Chr02 NC_080388.1:71693069-71693079promoter 内 1422-1432 bp - 2569 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 71695648-71700824(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGACCC
SmilChr02G003790 Chr02 NC_080388.1:59555119-59555129promoter 内 1362-1372 bp + 2629 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 59550439-59552490(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGACCC
SmilChr07G001948 Chr07 NC_080393.1:16887374-16887384promoter 内 1021-1031 bp - 2970 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 16890354-16890983(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGGGCTGAGCC
SmilChr07G004269 Chr07 NC_080393.1:55113327-55113337promoter 内 613-623 bp - 3378 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 55108488-55109949(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACCCAGCGCG
SmilChr02G001484 Chr02 NC_080388.1:27827422-27827432promoter 内 393-403 bp + 3598 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 27822752-27823824(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGGGCTGAGCG
SmilChr03G002676 Chr03 NC_080389.1:42473848-42473858promoter 内 64-74 bp + 3927 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 42477785-42481904(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGGTCAGCGCT
SmilChr08G003715 Chr08 NC_080394.1:41755466-41755476promoter 内 3976-3986 bp + 15 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 41753896-41755451(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGACTC
SmilChr02G001671 Chr02 NC_080388.1:30980769-30980779promoter 内 3933-3943 bp - 58 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 30980837-30982737(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGGGCTGAGCC
SmilChr04G000022 Chr04 NC_080390.1:255580-255590promoter 内 3930-3940 bp - 61 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 255651-258098(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGGGCTGAGCC
SmilChr03G002436 Chr03 NC_080389.1:38686015-38686025promoter 内 3871-3881 bp + 120 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 38684669-38685895(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCGCTGAGAG
SmilChr08G003801 Chr08 NC_080394.1:43932176-43932186promoter 内 3856-3866 bp - 135 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 43932321-43933179(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCGCTGAGAG
SmilChr05G001549 Chr05 NC_080391.1:14218129-14218139promoter 内 3745-3755 bp + 246 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 14218385-14220254(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCTCAGCGGG
SmilChr01G003060 Chr01 NC_080387.1:49489046-49489056promoter 内 3699-3709 bp - 292 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 49489348-49493065(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGACCC
SmilChr07G002137 Chr07 NC_080393.1:19516442-19516452promoter 内 3648-3658 bp + 343 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 19516795-19517657(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCGTA
SmilChr08G001690 Chr08 NC_080394.1:14112963-14112973promoter 内 3550-3560 bp - 441 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 14113414-14116855(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGGGCTGAGCC
SmilChr01G001252 Chr01 NC_080387.1:25163932-25163942promoter 内 3545-3555 bp - 446 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 25164388-25164972(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGGGTC
SmilChr05G002157 Chr05 NC_080391.1:22785511-22785521promoter 内 3545-3555 bp - 446 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 22785967-22790118(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGGGTC
SmilChr08G001757 Chr08 NC_080394.1:14770026-14770036promoter 内 3541-3551 bp + 450 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 14770486-14772419(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCTCAGCGGG
SmilChr03G001726 Chr03 NC_080389.1:23198588-23198598promoter 内 3535-3545 bp - 456 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 23199054-23200241(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGACTC
SmilChr08G001191 Chr08 NC_080394.1:9561173-9561183promoter 内 3508-3518 bp + 483 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 9561666-9566749(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCCCA
SmilChr04G000749 Chr04 NC_080390.1:9179639-9179649promoter 内 3505-3515 bp - 486 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 9180135-9181345(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGACTC
SmilChr03G000447 Chr03 NC_080389.1:4794235-4794245promoter 内 3500-3510 bp - 491 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 4792703-4793744(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCCCT
SmilChr03G002622 Chr03 NC_080389.1:41608811-41608821promoter 内 3486-3496 bp - 505 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 41609326-41610194(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGACCC
SmilChr06G001306 Chr06 NC_080392.1:13571835-13571845promoter 内 3397-3407 bp - 594 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 13572439-13573585(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGGGCTGAGCC
SmilChr07G001940 Chr07 NC_080393.1:16807104-16807114promoter 内 3341-3351 bp + 650 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 16807764-16810142(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGGTCAGCGCT
SmilChr06G000844 Chr06 NC_080392.1:7975815-7975825promoter 内 3331-3341 bp + 660 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 7976485-7978117(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGGTCAGCGCT
SmilChr01G003879 Chr01 NC_080387.1:57118158-57118168promoter 内 3323-3333 bp + 668 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 57111588-57117490(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGACCC
SmilChr06G003299 Chr06 NC_080392.1:45526365-45526375promoter 内 3283-3293 bp + 708 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 45519483-45525657(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGGGCTGAGCG
SmilChr05G003123 Chr05 NC_080391.1:39881274-39881284promoter 内 3252-3262 bp + 739 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 39882023-39883008(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCCCT
SmilChr03G002621 Chr03 NC_080389.1:41608811-41608821promoter 内 3241-3251 bp - 750 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 41602122-41608061(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGGTCAGCGCT
SmilChr04G001061 Chr04 NC_080390.1:15183111-15183121promoter 内 3221-3231 bp - 770 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 15183891-15184523(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCGCTGAGAG
SmilChr03G001690 Chr03 NC_080389.1:22416506-22416516promoter 内 3180-3190 bp - 811 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 22415028-22415695(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCCCT
SmilChr03G002725 Chr03 NC_080389.1:43267032-43267042promoter 内 3105-3115 bp + 886 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 43267928-43268418(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCCCA
SmilChr04G000852 Chr04 NC_080390.1:10771533-10771543promoter 内 2945-2955 bp - 1046 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 10772589-10778509(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TACGCTGAGCA
SmilChr01G000537 Chr01 NC_080387.1:11058325-11058335promoter 内 2931-2941 bp - 1060 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 11056474-11057265(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCCCT
SmilChr07G003166 Chr07 NC_080393.1:33681859-33681869promoter 内 2886-2896 bp - 1105 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 33679665-33680754(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCGTA
SmilChr01G001760 Chr01 NC_080387.1:32310142-32310152promoter 内 2880-2890 bp + 1111 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 32311263-32317860(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCCCA
SmilChr01G003095 Chr01 NC_080387.1:49779401-49779411promoter 内 2786-2796 bp - 1205 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 49776377-49778196(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCCCA
SmilChr02G001785 Chr02 NC_080388.1:32627705-32627715promoter 内 2783-2793 bp + 1208 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 32628923-32634187(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGGTCAGCGCT
SmilChr08G002399 Chr08 NC_080394.1:22774216-22774226promoter 内 2760-2770 bp - 1231 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 22770141-22772985(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCCCT
SmilChr07G002000 Chr07 NC_080393.1:17713387-17713397promoter 内 2573-2583 bp + 1418 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 17703999-17711969(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGGGTC
SmilChr05G000075 Chr05 NC_080391.1:382458-382468promoter 内 2524-2534 bp - 1467 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 378227-380991(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCCCT
SmilChr03G003947 Chr03 NC_080389.1:58520400-58520410promoter 内 2518-2528 bp - 1473 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 58521883-58526951(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGACTC
SmilChr08G003514 Chr08 NC_080394.1:37731758-37731768promoter 内 2497-2507 bp + 1494 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 37729560-37730264(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGGGCTGAGCC
SmilChr07G000729 Chr07 NC_080393.1:5075958-5075968promoter 内 2480-2490 bp - 1511 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 5077479-5079510(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGGGCTGAGCC
SmilChr07G003678 Chr07 NC_080393.1:44241881-44241891promoter 内 2453-2463 bp + 1538 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 44236411-44240343(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCGCTGAGAG
SmilChr04G000021 Chr04 NC_080390.1:255580-255590promoter 内 2443-2453 bp - 1548 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 253223-254032(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCCCT