转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G004136; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00000866-RA_Salv SmilChr04G004136 MYB XP_057806072.1 MP00627 TTACCTACCG

可能结合的靶基因

9835 个结合位点 8075 个候选靶基因 第 66 / 162 下载 TSV

上一页 66 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G002608 Chr02 NC_080388.1:45242073-45242082promoter 内 1720-1729 bp - 2272 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 45237515-45239801(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 TTACCTACTG
SmilChr07G001470 Chr07 NC_080393.1:11547258-11547267promoter 内 1705-1714 bp - 2287 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 11542292-11544971(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 TTACCTACTG
SmilChr03G003385 Chr03 NC_080389.1:52217358-52217367promoter 内 1687-1696 bp - 2305 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 52205301-52215053(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ACACCTACCT
SmilChr06G002082 Chr06 NC_080392.1:27461353-27461362promoter 内 1685-1694 bp - 2307 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 27458234-27459046(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ACACCTACCT
SmilChr05G001969 Chr05 NC_080391.1:20327399-20327408promoter 内 1677-1686 bp + 2315 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 20322994-20325084(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTGT
SmilChr05G002535 Chr05 NC_080391.1:28306906-28306915promoter 内 1674-1683 bp - 2318 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 28281760-28304588(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 TAACCTACCC
SmilChr03G000843 Chr03 NC_080389.1:9623113-9623122promoter 内 1667-1676 bp - 2325 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 9617494-9620788(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 TAACCTACCC
SmilChr07G001471 Chr07 NC_080393.1:11547258-11547267promoter 内 1633-1642 bp - 2359 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 11549626-11558672(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 CAGTAGGTAA
SmilChr01G005455 Chr01 NC_080387.1:71592114-71592123promoter 内 1599-1608 bp + 2393 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 71588161-71589721(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 CAGTAGGTAA
SmilChr05G003333 Chr05 NC_080391.1:43717550-43717559promoter 内 1597-1606 bp + 2395 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 43719954-43725061(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ACACCTACCT
SmilChr02G004114 Chr02 NC_080388.1:63437937-63437946promoter 内 1593-1602 bp + 2399 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 63440345-63441890(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ACACCTACCT
SmilChr04G002987 Chr04 NC_080390.1:46294922-46294931promoter 内 1573-1582 bp - 2419 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 46286743-46292503(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ACACCTACCT
SmilChr03G002548 Chr03 NC_080389.1:40658428-40658437promoter 内 1572-1581 bp + 2420 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 40648123-40656008(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTGT
SmilChr02G001196 Chr02 NC_080388.1:22004591-22004600promoter 内 1568-1577 bp - 2424 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 22007024-22012627(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTGT
SmilChr02G004858 Chr02 NC_080388.1:70722997-70723006promoter 内 1550-1559 bp + 2442 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 70719282-70720555(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTGT
SmilChr01G001257 Chr01 NC_080387.1:25235943-25235952promoter 内 1543-1552 bp - 2449 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 25230481-25233494(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ACACCTACCT
SmilChr03G002076 Chr03 NC_080389.1:31748708-31748717promoter 内 1542-1551 bp + 2450 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 31733993-31746258(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTGT
SmilChr02G004860 Chr02 NC_080388.1:70722997-70723006promoter 内 1527-1536 bp + 2465 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 70725471-70736174(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ACACCTACCT
SmilChr04G001918 Chr04 NC_080390.1:31285843-31285852promoter 内 1520-1529 bp + 2472 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 31275684-31283371(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTGT
SmilChr06G002273 Chr06 NC_080392.1:32604617-32604626promoter 内 1512-1521 bp - 2480 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 32607106-32608957(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTGT
SmilChr02G002772 Chr02 NC_080388.1:47792297-47792306promoter 内 1506-1515 bp - 2486 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 47788873-47789811(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 TAACCTACCC
SmilChr06G000016 Chr06 NC_080392.1:248907-248916promoter 内 1505-1514 bp + 2487 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 242648-246420(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 CAGTAGGTAA
SmilChr04G000473 Chr04 NC_080390.1:5046845-5046854promoter 内 1487-1496 bp - 2505 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 5042737-5044340(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ACACCTACCT
SmilChr03G004032 Chr03 NC_080389.1:59327773-59327782promoter 内 1463-1472 bp + 2529 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 59323750-59325244(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTGT
SmilChr01G001217 Chr01 NC_080387.1:24454553-24454562promoter 内 1448-1457 bp + 2544 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 24450229-24452009(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 GGGTAGGTTA
SmilChr03G003404 Chr03 NC_080389.1:52403608-52403617promoter 内 1395-1404 bp + 2597 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 52406214-52406799(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ACACCTACCT
SmilChr06G002530 Chr06 NC_080392.1:36308036-36308045promoter 内 1382-1391 bp + 2610 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 36302354-36305426(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 CAGTAGGTAA
SmilChr01G000525 Chr01 NC_080387.1:10706653-10706662promoter 内 1381-1390 bp - 2611 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 10702889-10704042(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 TTACCTACTG
SmilChr03G000675 Chr03 NC_080389.1:7551402-7551411promoter 内 1374-1383 bp + 2618 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 7546223-7548784(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 CAGTAGGTAA
SmilChr07G000961 Chr07 NC_080393.1:6929878-6929887promoter 内 1340-1349 bp + 2652 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 6932539-6935238(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ACACCTACCT
SmilChr07G000037 Chr07 NC_080393.1:168305-168314promoter 内 1260-1269 bp + 2732 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 162832-165573(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 GGGTAGGTTA
SmilChr05G000479 Chr05 NC_080391.1:3715250-3715259promoter 内 1254-1263 bp - 2738 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 3706381-3712512(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 TAACCTACCC
SmilChr05G000344 Chr05 NC_080391.1:2559991-2560000promoter 内 1228-1237 bp + 2764 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 2554007-2557227(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTGT
SmilChr01G000348 Chr01 NC_080387.1:7155336-7155345promoter 内 1225-1234 bp - 2767 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 7151706-7152569(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ACACCTACCT
SmilChr01G004042 Chr01 NC_080387.1:58834506-58834515promoter 内 1221-1230 bp - 2771 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 58828095-58831735(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ACACCTACCT
SmilChr02G003103 Chr02 NC_080388.1:51951604-51951613promoter 内 1215-1224 bp + 2777 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 51954390-51963076(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 TTACCTACTG
SmilChr05G002426 Chr05 NC_080391.1:26743806-26743815promoter 内 1155-1164 bp + 2837 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 26739748-26740969(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 CAGTAGGTAA
SmilChr01G006109 Chr01 NC_080387.1:76633204-76633213promoter 内 1153-1162 bp - 2839 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 76636052-76638251(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 GGGTAGGTTA
SmilChr06G000486 Chr06 NC_080392.1:3986502-3986511promoter 内 1151-1160 bp + 2841 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 3989352-3992943(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ACACCTACCT
SmilChr02G000371 Chr02 NC_080388.1:4713424-4713433promoter 内 1148-1157 bp - 2844 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 4707394-4710580(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ACACCTACCT
SmilChr05G000339 Chr05 NC_080391.1:2535216-2535225promoter 内 1132-1141 bp + 2860 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 2531032-2532356(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTGT
SmilChr01G000010 Chr01 NC_080387.1:228276-228285promoter 内 1130-1139 bp - 2862 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 221140-225414(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ACACCTACCT
SmilChr07G004468 Chr07 NC_080393.1:57252396-57252405promoter 内 1113-1122 bp + 2879 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 57255284-57259036(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ACACCTACCT
SmilChr01G000063 Chr01 NC_080387.1:1054583-1054592promoter 内 1112-1121 bp + 2880 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 1048335-1051703(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 CAGTAGGTAA
SmilChr07G002077 Chr07 NC_080393.1:18884172-18884181promoter 内 1109-1118 bp - 2883 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 18887064-18887669(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTGT
SmilChr03G004135 Chr03 NC_080389.1:60194860-60194869promoter 内 1105-1114 bp + 2887 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 60188638-60191973(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 CAGTAGGTAA
SmilChr06G000829 Chr06 NC_080392.1:7787655-7787664promoter 内 1062-1071 bp - 2930 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 7790594-7792647(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTGT
SmilChr02G005461 Chr02 NC_080388.1:74914607-74914616promoter 内 1022-1031 bp - 2970 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 74917586-74920857(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 GGGTAGGTTA
SmilChr01G003100 Chr01 NC_080387.1:49812271-49812280promoter 内 1002-1011 bp + 2990 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 49805545-49809281(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTGT
SmilChr05G000076 Chr05 NC_080391.1:390259-390268promoter 内 980-989 bp - 3012 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 384786-387247(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 TAACCTACCC