转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 69 / 143 下载 TSV

上一页 69 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr06G001175 Chr06 NC_080392.1:11958774-11958785promoter 内 2412-2423 bp + 1578 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 11955683-11957196(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCGG
SmilChr07G003031 Chr07 NC_080393.1:31352138-31352149promoter 内 2399-2410 bp + 1591 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 31353740-31354518(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTCTT
SmilChr03G003708 Chr03 NC_080389.1:56020065-56020076promoter 内 2349-2360 bp - 1641 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 56021717-56025599(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTAAA
SmilChr03G003980 Chr03 NC_080389.1:58820077-58820088promoter 内 2334-2345 bp - 1656 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 58815363-58818421(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTCTG
SmilChr02G004852 Chr02 NC_080388.1:70681388-70681399promoter 内 2316-2327 bp - 1674 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 70678035-70679714(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTCTT
SmilChr03G003536 Chr03 NC_080389.1:53962941-53962952promoter 内 2258-2269 bp + 1732 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 53964684-53974120(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTACAGCTGAG
SmilChr07G001246 Chr07 NC_080393.1:9548557-9548568promoter 内 2166-2177 bp + 1824 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 9550392-9551038(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTACAGCTGAG
SmilChr08G000052 Chr08 NC_080394.1:314201-314212promoter 内 2109-2120 bp - 1881 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 316093-319477(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGAGCTGTCTC
SmilChr01G001789 Chr01 NC_080387.1:32749966-32749977promoter 内 1982-1993 bp - 2008 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 32751985-32754320(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATAGCTGTCGT
SmilChr07G002568 Chr07 NC_080393.1:24515825-24515836promoter 内 1975-1986 bp + 2015 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 24513704-24513810(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGAGCTGTCAG
SmilChr04G000343 Chr04 NC_080390.1:3150180-3150191promoter 内 1965-1976 bp - 2025 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 3146931-3148155(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTCTT
SmilChr07G002087 Chr07 NC_080393.1:18985879-18985890promoter 内 1951-1962 bp - 2039 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 18978924-18983840(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTCTT
SmilChr08G001497 Chr08 NC_080394.1:12141592-12141603promoter 内 1945-1956 bp - 2045 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 12138432-12139547(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTCTG
SmilChr03G000785 Chr03 NC_080389.1:8947025-8947036promoter 内 1895-1906 bp - 2095 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 8941038-8944930(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTAGC
SmilChr02G001034 Chr02 NC_080388.1:18380417-18380428promoter 内 1894-1905 bp - 2096 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 18382524-18385099(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCTC
SmilChr07G003678 Chr07 NC_080393.1:44242472-44242483promoter 内 1861-1872 bp + 2129 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 44236411-44240343(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATAGCTGTCGT
SmilChr03G001821 Chr03 NC_080389.1:24899919-24899930promoter 内 1833-1844 bp - 2157 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 24889803-24897762(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTCTT
SmilChr06G002957 Chr06 NC_080392.1:42373961-42373972promoter 内 1788-1799 bp + 2202 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 42369939-42371759(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGAGCTGTCAG
SmilChr07G000301 Chr07 NC_080393.1:1983464-1983475promoter 内 1727-1738 bp + 2263 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 1979802-1981201(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTAGCTGTCAA
SmilChr01G001788 Chr01 NC_080387.1:32749966-32749977promoter 内 1703-1714 bp - 2287 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 32747541-32747679(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGACAGCTATT
SmilChr06G002353 Chr06 NC_080392.1:34228305-34228316promoter 内 1629-1640 bp + 2361 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 34230677-34230782(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTCTG
SmilChr05G002604 Chr05 NC_080391.1:29241527-29241538promoter 内 1567-1578 bp + 2423 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 29235764-29239104(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTAAA
SmilChr05G004168 Chr05 NC_080391.1:55592867-55592878promoter 内 1547-1558 bp + 2443 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 55587514-55590424(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTAAT
SmilChr05G000847 Chr05 NC_080391.1:6684230-6684241promoter 内 1521-1532 bp + 2469 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 6686710-6688112(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTCTT
SmilChr08G001914 Chr08 NC_080394.1:16660587-16660598promoter 内 1468-1479 bp - 2522 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 16655056-16658065(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGACAGCTATT
SmilChr05G001237 Chr05 NC_080391.1:10477352-10477363promoter 内 1461-1472 bp + 2529 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 10479892-10482261(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTCGA
SmilChr08G002476 Chr08 NC_080394.1:23680146-23680157promoter 内 1460-1471 bp - 2530 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 23682687-23686589(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCCG
SmilChr02G000841 Chr02 NC_080388.1:14256484-14256495promoter 内 1444-1455 bp + 2546 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 14259041-14261920(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTCTG
SmilChr03G002259 Chr03 NC_080389.1:35585066-35585077promoter 内 1420-1431 bp + 2570 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 35581768-35582496(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCTC
SmilChr02G002628 Chr02 NC_080388.1:45640643-45640654promoter 内 1366-1377 bp - 2624 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 45635359-45638019(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTACAGCTGAG
SmilChr06G002065 Chr06 NC_080392.1:27185261-27185272promoter 内 1362-1373 bp - 2628 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 27178638-27182633(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTCTT
SmilChr04G001540 Chr04 NC_080390.1:25372253-25372264promoter 内 1305-1316 bp - 2685 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 25364426-25369568(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTCTT
SmilChr01G004357 Chr01 NC_080387.1:61762475-61762486promoter 内 1222-1233 bp - 2768 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 61756501-61759707(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTCGA
SmilChr03G002185 Chr03 NC_080389.1:34075723-34075734promoter 内 1166-1177 bp + 2824 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 34078558-34080770(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTCAG
SmilChr08G002746 Chr08 NC_080394.1:27074203-27074214promoter 内 1152-1163 bp + 2838 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 27077052-27078122(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTCTT
SmilChr08G000489 Chr08 NC_080394.1:3531495-3531506promoter 内 1078-1089 bp + 2912 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 3526022-3528583(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGAGCTGTCCA
SmilChr02G001146 Chr02 NC_080388.1:20855060-20855071promoter 内 1036-1047 bp - 2954 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 20849516-20852106(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTCTG
SmilChr01G001200 Chr01 NC_080387.1:24172599-24172610promoter 内 995-1006 bp - 2995 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 24160292-24169604(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTAAG
SmilChr05G001335 Chr05 NC_080391.1:11737599-11737610promoter 内 973-984 bp + 3017 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 11740627-11743929(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTCTT
SmilChr06G001093 Chr06 NC_080392.1:10933673-10933684promoter 内 902-913 bp - 3088 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 10936772-10939171(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTAAT
SmilChr06G000984 Chr06 NC_080392.1:9633940-9633951promoter 内 839-850 bp + 3151 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 9637102-9639662(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTCTT
SmilChr01G003430 Chr01 NC_080387.1:52951004-52951015promoter 内 800-811 bp + 3190 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 52944400-52947814(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGAGCTGTCGG
SmilChr04G004134 Chr04 NC_080390.1:56157155-56157166promoter 内 773-784 bp + 3217 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 56152353-56153938(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGAGCTGTCTT
SmilChr01G004670 Chr01 NC_080387.1:64800320-64800331promoter 内 737-748 bp - 3253 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 64795713-64797067(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTAAG
SmilChr01G000785 Chr01 NC_080387.1:17063365-17063376promoter 内 736-747 bp - 3254 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 17066630-17072528(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCTAGCTGTCGG
SmilChr07G002815 Chr07 NC_080393.1:28175592-28175603promoter 内 725-736 bp + 3265 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 28178868-28181702(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTACAGCTGAT
SmilChr03G000703 Chr03 NC_080389.1:7849698-7849709promoter 内 676-687 bp + 3314 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 7841878-7846384(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTAAT
SmilChr02G001276 Chr02 NC_080388.1:23400561-23400572promoter 内 628-639 bp - 3362 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 23403934-23411765(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTAAA
SmilChr01G001509 Chr01 NC_080387.1:28922403-28922414promoter 内 621-632 bp + 3369 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 28925783-28929363(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTCTG
SmilChr02G002212 Chr02 NC_080388.1:39366884-39366895promoter 内 611-622 bp - 3379 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 39370274-39370975(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCGG