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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G000943; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00008897-RA_Salv SmilChr01G000943 MIKC_MADS XP_057790035.1 MP00508 CTTTCCTTTTTTGGAAAGT

可能结合的靶基因

7481 个结合位点 5979 个候选靶基因 第 70 / 120 下载 TSV

上一页 70 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G004746 Chr01 NC_080387.1:65633870-65633888promoter 内 3560-3578 bp + 423 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 65631238-65633447(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 CATTTCCAAATAAGGTAAT
SmilChr02G004753 Chr02 NC_080388.1:69726984-69727002promoter 内 3547-3565 bp - 436 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 69727438-69727509(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 CATTTCCAAATAAGGTAAT
SmilChr01G001980 Chr01 NC_080387.1:35199410-35199428promoter 内 3472-3490 bp - 511 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 35197190-35198899(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 ATTTCCTTATATGGTAAAA
SmilChr07G001462 Chr07 NC_080393.1:11456256-11456274promoter 内 3391-3409 bp - 592 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 11456866-11460124(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 ATTGTCCAAAAATAGAAAG
SmilChr01G000463 Chr01 NC_080387.1:9478667-9478685promoter 内 3359-3377 bp - 624 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 9475636-9478043(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 ATTACCTTATTTGGAAATG
SmilChr02G004754 Chr02 NC_080388.1:69726984-69727002promoter 内 3357-3375 bp - 626 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 69727628-69728425(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 CATTTCCAAATAAGGTAAT
SmilChr07G001993 Chr07 NC_080393.1:17566486-17566504promoter 内 3357-3375 bp - 626 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 17567130-17569894(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 CATTTCCAAATAAGGTAAT
SmilChr05G000384 Chr05 NC_080391.1:2898799-2898817promoter 内 3349-3367 bp + 634 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 2891822-2898165(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 CATTTCCAAATAAGGTAAT
SmilChr03G003418 Chr03 NC_080389.1:52526618-52526636promoter 内 3337-3355 bp + 646 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 52527282-52529094(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 ATTACCTTATTTGGAAATG
SmilChr01G000204 Chr01 NC_080387.1:3518496-3518514promoter 内 3328-3346 bp - 655 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 3514613-3517841(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 TTTTCCTTATTTAGAAATA
SmilChr01G004295 Chr01 NC_080387.1:61147313-61147331promoter 内 3259-3277 bp - 724 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 61142915-61146589(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 ATTACCTTATTTGGAAATG
SmilChr08G004223 Chr08 NC_080394.1:51643522-51643540promoter 内 3250-3268 bp - 733 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 51644273-51645622(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 CATTTCCAAATAAGGTAAT
SmilChr02G000665 Chr02 NC_080388.1:10210898-10210916promoter 内 3234-3252 bp - 749 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 10208037-10210149(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 ATTACCTTATTTGGAAATG
SmilChr03G004615 Chr03 NC_080389.1:63859854-63859872promoter 内 3198-3216 bp - 785 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 63860657-63864305(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 CATTTCCAAATAAGGTAAT
SmilChr05G000385 Chr05 NC_080391.1:2898799-2898817promoter 内 3186-3204 bp + 797 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 2899614-2900631(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 ATTACCTTATTTGGAAATG
SmilChr07G000808 Chr07 NC_080393.1:5695419-5695437promoter 内 3150-3168 bp - 833 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 5692776-5694586(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 ATTACCTTATTTGGAAATG
SmilChr05G001066 Chr05 NC_080391.1:8806613-8806631promoter 内 3098-3116 bp + 885 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 8803609-8805728(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 CATTTCCAAATAAGGTAAT
SmilChr07G003900 Chr07 NC_080393.1:49055555-49055573promoter 内 3060-3078 bp + 923 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 49048153-49054632(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 TTTTACCATATAAGGAAAT
SmilChr01G002229 Chr01 NC_080387.1:38757210-38757228promoter 内 3050-3068 bp - 933 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 38751506-38756277(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 ATTACCTTATTTGGAAATG
SmilChr05G002838 Chr05 NC_080391.1:33714830-33714848promoter 内 3005-3023 bp + 978 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 33715826-33719008(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 ATTACCTTATTTGGAAATG
SmilChr01G005835 Chr01 NC_080387.1:74366681-74366699promoter 内 2990-3008 bp - 993 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 74361036-74365688(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 ATTACCTTATTTGGAAATG
SmilChr05G003929 Chr05 NC_080391.1:53056463-53056481promoter 内 2979-2997 bp - 1004 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 53057485-53059626(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 TATTGCTAAAAAAGGAAAT
SmilChr07G002185 Chr07 NC_080393.1:20065998-20066016promoter 内 2962-2980 bp - 1021 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 20067037-20068824(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 TATGGCCCAAAAAGGAAAC
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SmilChr04G002162 Chr04 NC_080390.1:34860066-34860084promoter 内 2898-2916 bp + 1085 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 34858909-34858981(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 CATTTCCAAATAAGGTAAT
SmilChr07G001728 Chr07 NC_080393.1:14716000-14716018promoter 内 2894-2912 bp + 1089 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 14717107-14717705(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 ATTACCTTATTTGGAAATG
SmilChr06G002818 Chr06 NC_080392.1:40888649-40888667promoter 内 2887-2905 bp + 1096 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 40889763-40891162(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 ATTACCTTATTTGGAAATG
SmilChr08G004661 Chr08 NC_080394.1:56105427-56105445promoter 内 2810-2828 bp - 1173 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 56101579-56104254(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 ATTACCTTATTTGGAAATG
SmilChr02G005389 Chr02 NC_080388.1:74521858-74521876promoter 内 2808-2826 bp - 1175 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 74523051-74525524(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 ATTGTCCAAAAATAGAAAG
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SmilChr04G003979 Chr04 NC_080390.1:55241865-55241883promoter 内 2674-2692 bp - 1309 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 55243192-55244202(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 TATTACTTAAAAAGGAAAT
SmilChr02G000181 Chr02 NC_080388.1:2312445-2312463promoter 内 2536-2554 bp - 1447 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 2303750-2310998(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 GTTTCCTTTTTGGGCCATA
SmilChr02G004389 Chr02 NC_080388.1:66252854-66252872promoter 内 2517-2535 bp + 1466 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 66248834-66251388(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 TCATGCCCGAAAAGGAAAA
SmilChr06G002778 Chr06 NC_080392.1:40465136-40465154promoter 内 2502-2520 bp - 1481 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 40466635-40469559(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 GTTTACCAAAAAAAGAAGG
SmilChr07G000374 Chr07 NC_080393.1:2544147-2544165promoter 内 2405-2423 bp + 1578 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 2545743-2549009(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 ATTACCTTATTTGGAAATG
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SmilChr04G000675 Chr04 NC_080390.1:7706048-7706066promoter 内 2377-2395 bp + 1606 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 7707672-7708575(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 ATTACCTTATTTGGAAATG
SmilChr07G000373 Chr07 NC_080393.1:2544147-2544165promoter 内 2347-2365 bp + 1636 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 2535674-2542511(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 CATTTCCAAATAAGGTAAT
SmilChr01G001236 Chr01 NC_080387.1:24782058-24782076promoter 内 2329-2347 bp + 1654 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 24783730-24787436(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 CTTTCTATTTTTGGACAAT
SmilChr05G001559 Chr05 NC_080391.1:14297831-14297849promoter 内 2308-2326 bp - 1675 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 14288871-14296156(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 ATTACCTTATTTGGAAATG
SmilChr05G001337 Chr05 NC_080391.1:11771514-11771532promoter 内 2285-2303 bp + 1698 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 11773230-11788061(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 ATTACCTTATTTGGAAATG
SmilChr06G001776 Chr06 NC_080392.1:20792875-20792893promoter 内 2224-2242 bp - 1759 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 20788816-20791116(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 ATTACCTTATTTGGAAATG
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SmilChr08G000384 Chr08 NC_080394.1:2702156-2702174promoter 内 2175-2193 bp - 1808 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 2698612-2700348(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 ATTACCTTATTTGGAAATG
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SmilChr04G002444 Chr04 NC_080390.1:39154869-39154887promoter 内 2055-2073 bp - 1928 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 39156815-39157807(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 CATTTCCAAATAAGGTAAT