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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004552; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00011094-RA_Salv SmilChr01G004552 bZIP XP_057786668.1 MP00409 AATGGACACGTGGCA

可能结合的靶基因

8429 个结合位点 6252 个候选靶基因 第 70 / 126 下载 TSV

上一页 70 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr08G000083 Chr08 NC_080394.1:479012-479026promoter 内 3678-3692 bp - 309 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 479335-519461(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTCAATTTC
SmilChr08G000099 Chr08 NC_080394.1:616356-616370promoter 内 3678-3692 bp - 309 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 616679-620221(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTCAATTTC
SmilChr04G000720 Chr04 NC_080390.1:8443270-8443284promoter 内 3662-3676 bp + 325 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 8440758-8442945(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTCAAGATT
SmilChr04G002798 Chr04 NC_080390.1:43889205-43889219promoter 内 3635-3649 bp + 352 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 43886863-43888853(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGACACGTGTGGAAA
SmilChr07G001542 Chr07 NC_080393.1:12540698-12540712promoter 内 3498-3512 bp + 489 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 12533866-12540209(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TTCCACGTGGGCTCC
SmilChr07G001505 Chr07 NC_080393.1:12010922-12010936promoter 内 3456-3470 bp + 531 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 12004082-12010391(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TTCCACGTGGGCTCC
SmilChr04G003415 Chr04 NC_080390.1:50763241-50763255promoter 内 3451-3465 bp + 536 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 50763791-50764399(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGATGCTACGTGGCA
SmilChr08G000079 Chr08 NC_080394.1:461084-461098promoter 内 3436-3450 bp - 551 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 461649-462395(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTCAATTTC
SmilChr02G000504 Chr02 NC_080388.1:6951124-6951138promoter 内 3425-3439 bp + 562 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 6951700-6952732(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGTGCCCACGTGGAA
SmilChr02G005125 Chr02 NC_080388.1:72714296-72714310promoter 内 3418-3432 bp - 569 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 72714879-72730812(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TTCCACGTGGTCACT
SmilChr02G000129 Chr02 NC_080388.1:1753775-1753789promoter 内 3367-3381 bp + 620 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 1754409-1755279(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GTTTGACACGTGGAA
SmilChr04G002094 Chr04 NC_080390.1:33766463-33766477promoter 内 3239-3253 bp + 748 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 33767225-33771228(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TCGTGTCACGTGGCT
SmilChr01G003416 Chr01 NC_080387.1:52796898-52796912promoter 内 3214-3228 bp + 773 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 52797685-52800784(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TATGCTTACGTGGCA
SmilChr02G003902 Chr02 NC_080388.1:61110118-61110132promoter 内 3124-3138 bp - 863 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 61110995-61114315(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTCAATATT
SmilChr02G005392 Chr02 NC_080388.1:74536014-74536028promoter 内 3044-3058 bp - 943 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 74532819-74535071(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AATGATCACGTGGAA
SmilChr01G002867 Chr01 NC_080387.1:47281219-47281233promoter 内 3018-3032 bp + 969 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 47278591-47280250(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TTCCACGTGTCAATT
SmilChr08G003502 Chr08 NC_080394.1:37577496-37577510promoter 内 2982-2996 bp + 1005 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 37578515-37580132(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AATGATCACGTGGAA
SmilChr07G003183 Chr07 NC_080393.1:33906891-33906905promoter 内 2861-2875 bp + 1126 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 33903474-33905765(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TTCCACGTGTCAATT
SmilChr08G003095 Chr08 NC_080394.1:31143243-31143257promoter 内 2773-2787 bp - 1214 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 31136498-31142029(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AATTGACACGTGGAA
SmilChr04G004021 Chr04 NC_080390.1:55447267-55447281promoter 内 2713-2727 bp - 1274 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 55448555-55454161(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TTCCACGTGTTCATT
SmilChr08G003096 Chr08 NC_080394.1:31143243-31143257promoter 内 2608-2622 bp - 1379 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 31144636-31148411(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TTCCACGTGTCAATT
SmilChr06G001037 Chr06 NC_080392.1:10276282-10276296promoter 内 2442-2456 bp + 1545 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 10274665-10274737(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTGTAAATG
SmilChr04G003319 Chr04 NC_080390.1:49938276-49938290promoter 内 2421-2435 bp - 1566 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 49935395-49936710(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TCGTACCACGTGGCG
SmilChr07G003655 Chr07 NC_080393.1:43471732-43471746promoter 内 2346-2360 bp - 1641 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 43463595-43470091(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGTAGTTACGTGGCA
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SmilChr08G002822 Chr08 NC_080394.1:28062685-28062699promoter 内 2310-2324 bp - 1677 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 28064376-28065404(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTCAGAGAG
SmilChr08G002927 Chr08 NC_080394.1:29333921-29333935promoter 内 2200-2214 bp + 1787 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 29325803-29332134(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGACACGTGTTGACC
SmilChr01G004939 Chr01 NC_080387.1:67501695-67501709promoter 内 1960-1974 bp + 2027 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 67503736-67512271(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AATTGTCACGTGGAA
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SmilChr07G000166 Chr07 NC_080393.1:1004687-1004701promoter 内 1918-1932 bp - 2069 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 1006770-1011007(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGACACGTGTTCCCT
SmilChr02G003123 Chr02 NC_080388.1:52230346-52230360promoter 内 1895-1909 bp - 2092 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 52232452-52238966(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TTCCACGTGTCAATT
SmilChr01G003708 Chr01 NC_080387.1:55432292-55432306promoter 内 1885-1899 bp - 2102 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 55434408-55435001(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTCGATTCC
SmilChr06G001799 Chr06 NC_080392.1:21106707-21106721promoter 内 1841-1855 bp + 2146 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 21102185-21104561(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTGATGATG
SmilChr06G001002 Chr06 NC_080392.1:9913190-9913204promoter 内 1758-1772 bp + 2229 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 9915433-9917252(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CACTGTGACGTGGCC
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SmilChr02G005524 Chr02 NC_080388.1:75320775-75320789promoter 内 1645-1659 bp - 2342 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 75315098-75318433(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TATGCTTACGTGGCA
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SmilChr01G002327 Chr01 NC_080387.1:40417397-40417411promoter 内 1567-1581 bp - 2420 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 40413969-40414977(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGTGACCACGTGGAA
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SmilChr07G002162 Chr07 NC_080393.1:19777756-19777770promoter 内 1465-1479 bp - 2522 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 19772810-19775234(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CATTTACACGTGGCA
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SmilChr02G003460 Chr02 NC_080388.1:55894348-55894362promoter 内 1401-1415 bp + 2586 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 55896948-55897020(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGCGTCGACGTGGCG
SmilChr01G002205 Chr01 NC_080387.1:38371713-38371727promoter 内 1360-1374 bp - 2627 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 38374354-38376882(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGCCACGTCAACTCA
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SmilChr02G000779 Chr02 NC_080388.1:12768368-12768382promoter 内 895-909 bp - 3092 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 12764242-12765276(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGTCAACACGTGTCG
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SmilChr02G002665 Chr02 NC_080388.1:46144955-46144969promoter 内 493-507 bp - 3494 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 46148463-46150262(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTGAAAATG