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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G003955; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00019539-RA_Salv SmilChr04G003955 ERF XP_057805828.1 MP00120 GATATTGTCGGTGGT

可能结合的靶基因

7514 个结合位点 6144 个候选靶基因 第 80 / 123 下载 TSV

上一页 80 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G002711 Chr04 NC_080390.1:42714559-42714573promoter 内 331-345 bp + 3656 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 42718229-42718301(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GCATTCGTCGGTGTC
SmilChr03G003547 Chr03 NC_080389.1:54100338-54100352promoter 内 238-252 bp - 3749 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 54104101-54106399(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACCACCGCCATCAGT
SmilChr01G004497 Chr01 NC_080387.1:63080584-63080598promoter 内 178-192 bp + 3809 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 63075848-63076775(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TGCACCGACAGTCAG
SmilChr05G002024 Chr05 NC_080391.1:21003255-21003269promoter 内 69-83 bp - 3918 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 21007187-21010120(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GACGCCGACAACCCC
SmilChr01G003159 Chr01 NC_080387.1:50424621-50424635promoter 内 38-52 bp - 3949 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 50417757-50420672(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TCTCTTGTCGGTGCA
SmilChr01G001820 Chr01 NC_080387.1:33139985-33139999promoter 内 12-26 bp + 3975 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 33133079-33136010(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TTCACCGACTCCACC
SmilChr07G002011 Chr07 NC_080393.1:17935222-17935236promoter 内 11-25 bp + 3976 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 17939212-17940284(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GAAGGTGTCGGTCGA
SmilChr01G000025 Chr01 NC_080387.1:459785-459799promoter 内 2322-2336 bp + 1665 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 3 452475-458120(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ATCACCGACGGAACA
SmilChr01G003206 Chr01 NC_080387.1:50848329-50848343promoter 内 3148-3162 bp - 839 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 50815771-50847490(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 AATGATGGCGGTGGT
SmilChr04G000116 Chr04 NC_080390.1:1007056-1007070promoter 内 2879-2893 bp + 1108 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 1008178-1014169(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TGTTCCGTCGGTGAT
SmilChr07G003422 Chr07 NC_080393.1:37390134-37390148promoter 内 2608-2622 bp + 1379 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 37388165-37388755(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACCACCGCCACGAGA
SmilChr02G001066 Chr02 NC_080388.1:18990993-18991007promoter 内 2578-2592 bp + 1409 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 18988692-18989584(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACCACCGCCGAAAAC
SmilChr07G004185 Chr07 NC_080393.1:53836303-53836317promoter 内 2552-2566 bp + 1435 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 53837752-53841072(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TGTTCCGTCGGTGAT
SmilChr07G002328 Chr07 NC_080393.1:21593619-21593633promoter 内 2111-2125 bp + 1876 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 21595509-21596860(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TTCCTTGTCGGTGAG
SmilChr03G000380 Chr03 NC_080389.1:4253305-4253319promoter 内 1614-1628 bp + 2373 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 4255692-4259229(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TGATCCGTCGGTGAT
SmilChr04G001648 Chr04 NC_080390.1:27413365-27413379promoter 内 1480-1494 bp - 2507 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 27415886-27424500(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 AACACCGACAACATG
SmilChr07G002647 Chr07 NC_080393.1:25623562-25623576promoter 内 1449-1463 bp - 2538 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 25626114-25628114(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ATCACCGACGGAACA
SmilChr07G003678 Chr07 NC_080393.1:44243052-44243066promoter 内 1278-1292 bp + 2709 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 44236411-44240343(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACCACCGACTAAATC
SmilChr01G003276 Chr01 NC_080387.1:51469482-51469496promoter 内 1228-1242 bp - 2759 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 51463545-51466723(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TGTTCCGTCGGTGAT
SmilChr01G002492 Chr01 NC_080387.1:42660634-42660648promoter 内 1064-1078 bp + 2923 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 42663571-42665645(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TGATCCGTCGGTGAT
SmilChr02G002372 Chr02 NC_080388.1:41543086-41543100promoter 内 960-974 bp + 3027 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 41546127-41552236(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TGTTCCGTCGGTGAT
SmilChr05G001840 Chr05 NC_080391.1:18459011-18459025promoter 内 647-661 bp - 3340 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 18462365-18467725(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACCACCGTCGCGCCC
SmilChr08G003923 Chr08 NC_080394.1:46726825-46726839promoter 内 550-564 bp + 3437 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 46722821-46723388(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACCACCGCCAGAGAG
SmilChr08G003175 Chr08 NC_080394.1:32497124-32497138promoter 内 402-416 bp + 3585 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 32487196-32493539(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 CTCACCGACGACTTT
SmilChr03G002198 Chr03 NC_080389.1:34589085-34589099promoter 内 3971-3985 bp + 16 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 34588198-34589069(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACCACCGCCAAGCCT
SmilChr08G002539 Chr08 NC_080394.1:24669958-24669972promoter 内 3950-3964 bp + 37 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 24666571-24669921(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACCACCGACCCTCCT
SmilChr01G004077 Chr01 NC_080387.1:59204679-59204693promoter 内 3946-3960 bp - 41 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 59204734-59207177(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TTCACCGACGCACTT
SmilChr06G003198 Chr06 NC_080392.1:44849599-44849613promoter 内 3927-3941 bp + 60 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 44848626-44849539(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 CTCACCGACGACTTT
SmilChr02G004804 Chr02 NC_080388.1:70221384-70221398promoter 内 3698-3712 bp - 289 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 70217075-70221095(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 AAATGAGTCGGTGGC
SmilChr01G004795 Chr01 NC_080387.1:66181159-66181173promoter 内 3696-3710 bp + 291 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 66181464-66183723(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TGTCGTGTCGGTGTT
SmilChr07G002996 Chr07 NC_080393.1:30667741-30667755promoter 内 3666-3680 bp + 321 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 30665231-30667420(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ATCACCGACGGAACA
SmilChr01G004076 Chr01 NC_080387.1:59204679-59204693promoter 内 3635-3649 bp - 352 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 59201299-59204327(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 AAGTGCGTCGGTGAA
SmilChr03G004492 Chr03 NC_080389.1:63035191-63035205promoter 内 3618-3632 bp - 369 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 63034100-63034822(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TGTTCCGTCGGTGAT
SmilChr08G004407 Chr08 NC_080394.1:53755239-53755253promoter 内 3503-3517 bp + 484 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 53755737-53757647(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GAAGCCGGCGGTGGT
SmilChr08G003546 Chr08 NC_080394.1:38092071-38092085promoter 内 3475-3489 bp - 512 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 38088682-38091559(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GGGCGCGACGGTGGT
SmilChr01G006045 Chr01 NC_080387.1:75960017-75960031promoter 内 3404-3418 bp + 583 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 75960614-75962698(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TGTTCCGTCGGTGAT
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SmilChr05G001693 Chr05 NC_080391.1:16136126-16136140promoter 内 2831-2845 bp + 1156 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 16134022-16134970(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACCACCGTCGCGCCC
SmilChr04G001475 Chr04 NC_080390.1:24201239-24201253promoter 内 2752-2766 bp - 1235 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 24198554-24200004(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TGAATTGTCGGCGAT
SmilChr08G004753 Chr08 NC_080394.1:56880049-56880063promoter 内 2715-2729 bp - 1272 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 56881335-56882296(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACCACCGACCACCTC
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SmilChr05G004389 Chr05 NC_080391.1:57338010-57338024promoter 内 2686-2700 bp + 1301 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 57339325-57351606(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 CTGGTTGGCGGTGGT
SmilChr03G003301 Chr03 NC_080389.1:51118354-51118368promoter 内 2663-2677 bp - 1324 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 51119692-51122051(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ATCACCGACGGCGTG