转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G000162; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00008183-RA_Salv SmilChr04G000162 MYB XP_057807467.1 MP00134 TCCACCTACCACCAC

可能结合的靶基因

8676 个结合位点 7078 个候选靶基因 第 9 / 142 下载 TSV

上一页 9 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G004739 Chr01 NC_080387.1:65581271-65581285promoter 内 1748-1762 bp + 2239 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 65583524-65588628(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CCTACCTACCCCACC
SmilChr01G004338 Chr01 NC_080387.1:61511659-61511673promoter 内 1724-1738 bp - 2263 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 61504998-61509396(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GCCACCTACCGCAGC
SmilChr03G001287 Chr03 NC_080389.1:15072146-15072160promoter 内 1722-1736 bp + 2265 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 15065646-15069881(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GGTGGGGTAGGTAGG
SmilChr05G004061 Chr05 NC_080391.1:54564154-54564168promoter 内 1409-1423 bp - 2578 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 54558446-54561576(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GCCACCTACCGCAGC
SmilChr03G003886 Chr03 NC_080389.1:57938395-57938409promoter 内 1186-1200 bp - 2801 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 57928068-57935594(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GCCACCTACCGCAGC
SmilChr06G002963 Chr06 NC_080392.1:42411655-42411669promoter 内 1124-1138 bp - 2863 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 42405206-42408792(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GCCACCTACCGCAGC
SmilChr06G000674 Chr06 NC_080392.1:5971996-5972010promoter 内 842-856 bp + 3145 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 5967178-5968851(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GCTGCGGTAGGTGGC
SmilChr02G001667 Chr02 NC_080388.1:30941704-30941718promoter 内 757-771 bp + 3230 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 30944948-30946979(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GCCACCTACCGCAGC
SmilChr06G002964 Chr06 NC_080392.1:42417156-42417170promoter 内 742-756 bp - 3245 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 42420415-42426465(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GCTGCGGTAGGTGGC
SmilChr02G004952 Chr02 NC_080388.1:71479851-71479865promoter 内 609-623 bp + 3378 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 71483243-71487460(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GCCACCTACCGCAGC
SmilChr04G003247 Chr04 NC_080390.1:49241141-49241155promoter 内 412-426 bp + 3575 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 49237493-49237566(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GCTGCGGTAGGTGGC
SmilChr05G002721 Chr05 NC_080391.1:31307793-31307807promoter 内 255-269 bp + 3732 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 31311539-31316331(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GCCACCTACCGCAGC
SmilChr03G001928 Chr03 NC_080389.1:27064338-27064352promoter 内 3872-3886 bp - 115 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 27064467-27066676(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AAGTTGGTAGGTGGG
SmilChr04G003443 Chr04 NC_080390.1:50947137-50947151promoter 内 3767-3781 bp + 220 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 50945181-50946917(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GCTGCGGTAGGTGGC
SmilChr03G002158 Chr03 NC_080389.1:33605706-33605720promoter 内 3635-3649 bp + 352 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 33606072-33607171(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CACACCTACCGACCC
SmilChr03G002973 Chr03 NC_080389.1:46526842-46526856promoter 内 3522-3536 bp - 465 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 46524990-46526377(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GCCACCTACCGCAGC
SmilChr05G003363 Chr05 NC_080391.1:44439789-44439803promoter 内 3449-3463 bp + 538 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 44433085-44439251(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GGTGGGGTAGGTAGG
SmilChr03G001223 Chr03 NC_080389.1:14097173-14097187promoter 内 3295-3309 bp - 692 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 14097879-14100533(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GGTGGGGTAGGTAGG
SmilChr08G004379 Chr08 NC_080394.1:53545368-53545382promoter 内 3262-3276 bp - 725 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 53539622-53544643(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GCCACCTACCGCAGC
SmilChr08G000394 Chr08 NC_080394.1:2766635-2766649promoter 内 3182-3196 bp - 805 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 2767454-2768307(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GATGAGGTAGGTGGA
SmilChr07G002170 Chr07 NC_080393.1:19874702-19874716promoter 内 3064-3078 bp - 923 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 19870751-19873779(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GCCACCTACCGCAAC
SmilChr06G001543 Chr06 NC_080392.1:16706429-16706443promoter 内 2744-2758 bp - 1243 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 16703286-16705186(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CCTACCTACCCCACC
SmilChr01G005740 Chr01 NC_080387.1:73519860-73519874promoter 内 2669-2683 bp + 1318 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 73517748-73518542(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATGGTGGTGGGTGGC
SmilChr07G004735 Chr07 NC_080393.1:60224589-60224603promoter 内 2213-2227 bp + 1774 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 60209536-60222815(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GCTGCGGTAGGTGGC
SmilChr08G000267 Chr08 NC_080394.1:1825234-1825248promoter 内 2144-2158 bp + 1843 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 1827091-1831908(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CCTAACCACCACCAC
SmilChr01G005052 Chr01 NC_080387.1:68468022-68468036promoter 内 2088-2102 bp + 1899 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 68469935-68470707(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GCCACCTACCGCAGC
SmilChr02G003467 Chr02 NC_080388.1:55970725-55970739promoter 内 1932-1946 bp - 2055 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 55972794-55975525(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATGTCGGTAGGTGGG
SmilChr03G003500 Chr03 NC_080389.1:53615725-53615739promoter 内 1859-1873 bp + 2128 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 53617867-53619696(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GCCACCTACCGCAGC
SmilChr03G003989 Chr03 NC_080389.1:58919341-58919355promoter 内 1788-1802 bp - 2199 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 58911799-58917142(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TCCACCTACCTCTGC
SmilChr02G002369 Chr02 NC_080388.1:41474138-41474152promoter 内 1733-1747 bp + 2254 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 41471010-41471884(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GCTGCGGTAGGTGGC
SmilChr04G001918 Chr04 NC_080390.1:31285842-31285856promoter 内 1516-1530 bp + 2471 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 31275684-31283371(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GTGGAGGTAGGTGTG
SmilChr07G000061 Chr07 NC_080393.1:280829-280843promoter 内 1337-1351 bp - 2650 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 276027-278179(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GCCACCTACCGCAGC
SmilChr01G000775 Chr01 NC_080387.1:16875139-16875153promoter 内 1140-1154 bp + 2847 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 16869258-16872292(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GCTGCGGTAGGTGGC
SmilChr08G004170 Chr08 NC_080394.1:51018987-51019001promoter 内 1059-1073 bp + 2928 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 51006962-51016059(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATGGTGGTGGGTGGC
SmilChr04G003444 Chr04 NC_080390.1:50952558-50952572promoter 内 1001-1015 bp + 2986 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 50955558-50956148(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GCCACCTACCGCAGC
SmilChr05G004062 Chr05 NC_080391.1:54569590-54569604promoter 内 807-821 bp - 3180 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 54572784-54573864(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GCTGCGGTAGGTGGC
SmilChr02G001325 Chr02 NC_080388.1:24731294-24731308promoter 内 805-819 bp + 3182 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 24734490-24735470(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TCCACCTACCGACCT
SmilChr02G001778 Chr02 NC_080388.1:32557776-32557790promoter 内 767-781 bp - 3220 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 32561010-32566063(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AAGTTGGTAGGTGGG
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SmilChr06G002865 Chr06 NC_080392.1:41479374-41479388promoter 内 551-565 bp + 3436 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 41474897-41475938(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATGGTGGTGGGTGGC
SmilChr08G004380 Chr08 NC_080394.1:53550800-53550814promoter 内 509-523 bp - 3478 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 53554292-53555285(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GCTGCGGTAGGTGGC
SmilChr04G002276 Chr04 NC_080390.1:36978262-36978276promoter 内 501-515 bp - 3486 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 36973110-36974776(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CCTACCTACCCCACC
SmilChr04G003993 Chr04 NC_080390.1:55319052-55319066promoter 内 485-499 bp + 3502 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 55322568-55324194(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CTCACCTACCACGGC
SmilChr03G002825 Chr03 NC_080389.1:44735004-44735018promoter 内 340-354 bp + 3647 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 44738665-44743638(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CCTACCTACCCCACC
SmilChr06G001620 Chr06 NC_080392.1:18042263-18042277promoter 内 328-342 bp + 3659 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 18036985-18038604(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GGTGGGGTAGGTGCG
SmilChr06G002866 Chr06 NC_080392.1:41485745-41485759promoter 内 269-283 bp + 3718 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 41479639-41482027(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATGGTGGTGGGTGGC
SmilChr01G005742 Chr01 NC_080387.1:73519860-73519874promoter 内 180-194 bp + 3807 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 73523681-73524864(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GCCACCCACCACCAT
SmilChr01G005072 Chr01 NC_080387.1:68595961-68595975promoter 内 175-189 bp - 3812 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 68599787-68603091(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GTTGCGGTAGGTGGC
SmilChr05G000806 Chr05 NC_080391.1:6301649-6301663promoter 内 115-129 bp - 3872 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 6296794-6297777(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TCCACCTACCTCATC
SmilChr03G000975 Chr03 NC_080389.1:11043785-11043799promoter 内 76-90 bp + 3911 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 11037577-11039874(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATGGTGGTGGGTGGC