转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004552; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00011094-RA_Salv SmilChr01G004552 bZIP XP_057786668.1 MP00409 AATGGACACGTGGCA

可能结合的靶基因

8429 个结合位点 6252 个候选靶基因 第 97 / 126 下载 TSV

上一页 97 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr06G000367 Chr06 NC_080392.1:2829130-2829144promoter 内 2618-2632 bp + 1369 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 2825192-2827761(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTATCGCGT
SmilChr01G000524 Chr01 NC_080387.1:10700188-10700202promoter 内 2610-2624 bp - 1377 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 10701579-10702581(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTCGATTCT
SmilChr01G003443 Chr01 NC_080387.1:52999485-52999499promoter 内 2456-2470 bp + 1531 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 53001030-53003259(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGTGTACACGTGGAA
SmilChr05G001010 Chr05 NC_080391.1:8290535-8290549promoter 内 2432-2446 bp + 1555 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 8292104-8293025(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GAAGGACACGTGGAT
SmilChr08G000779 Chr08 NC_080394.1:5733839-5733853promoter 内 2305-2319 bp - 1682 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 5735535-5742123(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TTCCACGTGGCTCCA
SmilChr07G003508 Chr07 NC_080393.1:39962988-39963002promoter 内 2302-2316 bp + 1685 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 39964687-39981366(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ACTTTACACGTGTCA
SmilChr03G000498 Chr03 NC_080389.1:5318551-5318565promoter 内 2202-2216 bp + 1785 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 5320350-5320955(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CTAGTCGACGTGGCC
SmilChr03G000792 Chr03 NC_080389.1:9011112-9011126promoter 内 2202-2216 bp - 1785 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 9008719-9009327(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CTAGTCGACGTGGCC
SmilChr01G002255 Chr01 NC_080387.1:39220596-39220610promoter 内 2194-2208 bp + 1793 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 39222403-39223861(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TTAAAACACGTGTCG
SmilChr02G005587 Chr02 NC_080388.1:75674200-75674214promoter 内 2169-2183 bp - 1818 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 75668157-75672382(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CACGACGACGTGGCT
SmilChr08G004755 Chr08 NC_080394.1:56907691-56907705promoter 内 2118-2132 bp + 1869 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 56909574-56911616(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGTGTACACGTGGAA
SmilChr04G000700 Chr04 NC_080390.1:8155728-8155742promoter 内 1953-1967 bp + 2034 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 8157776-8159224(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AAAACTGACGTGGCT
SmilChr05G000224 Chr05 NC_080391.1:1757250-1757264promoter 内 1878-1892 bp - 2109 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 1752819-1755141(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GAATAATACGTGGCA
SmilChr04G000450 Chr04 NC_080390.1:4773779-4773793promoter 内 1856-1870 bp - 2131 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 4769472-4771648(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ACTTTACACGTGTCA
SmilChr07G003350 Chr07 NC_080393.1:35969123-35969137promoter 内 1843-1857 bp - 2144 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 35971281-35987311(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTAGCATTT
SmilChr01G001833 Chr01 NC_080387.1:33285540-33285554promoter 内 1806-1820 bp - 2181 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 33278872-33283359(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GTGGAACACGTGGAG
SmilChr05G000119 Chr05 NC_080391.1:941689-941703promoter 内 1755-1769 bp + 2232 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 938321-939457(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTATTATTC
SmilChr01G002127 Chr01 NC_080387.1:37276939-37276953promoter 内 1649-1663 bp - 2338 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 37279291-37283213(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGACACGTGTTTTAA
SmilChr05G000120 Chr05 NC_080391.1:941689-941703promoter 内 1634-1648 bp + 2353 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 944056-944742(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GAATAATACGTGGCA
SmilChr04G001826 Chr04 NC_080390.1:29803175-29803189promoter 内 1593-1607 bp + 2394 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 29796969-29800781(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ATCCACGTGACCATT
SmilChr02G001229 Chr02 NC_080388.1:22591938-22591952promoter 内 1573-1587 bp - 2414 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 22584075-22589524(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TTAAAACACGTGTCG
SmilChr06G002531 Chr06 NC_080392.1:36321563-36321577promoter 内 1534-1548 bp + 2453 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 36316587-36319110(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGCCACGTCAACTTA
SmilChr05G002925 Chr05 NC_080391.1:35238503-35238517promoter 内 1314-1328 bp - 2673 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 35234714-35235830(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ATCCTCCACGTGGCA
SmilChr03G002314 Chr03 NC_080389.1:36416794-36416808promoter 内 1251-1265 bp - 2736 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 36410888-36414058(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TCAGCACACGTGGAA
SmilChr04G000115 Chr04 NC_080390.1:997598-997612promoter 内 1251-1265 bp + 2736 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 1000348-1003600(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GATGAACACGTGTAA
SmilChr05G002226 Chr05 NC_080391.1:23797483-23797497promoter 内 1134-1148 bp - 2853 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 23789694-23794630(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGGTAATACGTGGCA
SmilChr04G002087 Chr04 NC_080390.1:33646909-33646923promoter 内 1133-1147 bp - 2854 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 33643600-33644055(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TCAACAGACGTGGCC
SmilChr02G000442 Chr02 NC_080388.1:5751571-5751585promoter 内 1113-1127 bp + 2874 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 5754459-5756152(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGTGTACACGTGGAA
SmilChr04G001298 Chr04 NC_080390.1:20691728-20691742promoter 内 920-934 bp + 3067 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 20687488-20688661(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTATTACTC
SmilChr04G003742 Chr04 NC_080390.1:53725260-53725274promoter 内 745-759 bp - 3242 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 53719059-53722018(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TTAAAACACGTGTCG
SmilChr01G006164 Chr01 NC_080387.1:77070307-77070321promoter 内 733-747 bp - 3254 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 77064432-77067053(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GTAGCTCACGTGGAG
SmilChr01G004373 Chr01 NC_080387.1:61930547-61930561promoter 内 718-732 bp + 3269 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 61933830-61935588(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ACCTTAGACGTGGCA
SmilChr04G002088 Chr04 NC_080390.1:33646909-33646923promoter 内 675-689 bp - 3312 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 33650235-33654137(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGCCACGTCTGTTGA
SmilChr05G002385 Chr05 NC_080391.1:26306570-26306584promoter 内 656-670 bp + 3331 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 26299731-26303239(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTAGGATCC
SmilChr07G001893 Chr07 NC_080393.1:16350626-16350640promoter 内 614-628 bp - 3373 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 16346138-16347253(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGCGTTGACGTGGCT
SmilChr07G002293 Chr07 NC_080393.1:21203773-21203787promoter 内 481-495 bp - 3506 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 21207293-21210179(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TTCCACGTGATCTTG
SmilChr05G000285 Chr05 NC_080391.1:2208383-2208397promoter 内 458-472 bp + 3529 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 2202419-2204854(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTAGGATCC
SmilChr02G004452 Chr02 NC_080388.1:66885677-66885691promoter 内 437-451 bp - 3550 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 66877644-66882127(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GAATCTTACGTGGCA
SmilChr06G002769 Chr06 NC_080392.1:40287326-40287340promoter 内 163-177 bp + 3824 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 40281685-40283502(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTAGGACCC
SmilChr05G001009 Chr05 NC_080391.1:8290535-8290549promoter 内 85-99 bp + 3902 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 8283766-8286633(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ATCCACGTGTCCTTC
SmilChr07G000309 Chr07 NC_080393.1:2037412-2037426promoter 内 3326-3340 bp + 661 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 15 2030312-2036751(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TTACACGTGTCCTAG
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SmilChr05G003761 Chr05 NC_080391.1:50858481-50858495promoter 内 903-917 bp + 3084 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 50861579-50864291(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CCTCCTCACGTGGCC
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SmilChr03G003521 Chr03 NC_080389.1:53811161-53811175promoter 内 3952-3966 bp + 35 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 53811210-53814400(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGATCTCACGTGGAA
SmilChr01G004618 Chr01 NC_080387.1:64204578-64204592promoter 内 3886-3900 bp - 101 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 64202602-64204477(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CTCAGACACGTGGCT