转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G004447; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027346-RA_Salv SmilChr02G004447 HD-ZIP XP_057797242.1 MP00200 AAAAGTAATGATTAC

可能结合的靶基因

9930 个结合位点 6661 个候选靶基因 第 11 / 134 下载 TSV

上一页 11 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G005296 Chr02 NC_080388.1:73930869-73930883promoter 内 3228-3242 bp + 759 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 73931642-73942575(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GACTATAATGATTAC
SmilChr01G001153 Chr01 NC_080387.1:23489879-23489893promoter 内 3104-3118 bp + 883 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 23483744-23488996(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTAATCATCATTTTT
SmilChr02G004820 Chr02 NC_080388.1:70316774-70316788promoter 内 2094-2108 bp - 1893 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 70318681-70323365(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CTAATCATTATATTC
SmilChr01G005366 Chr01 NC_080387.1:70880020-70880034promoter 内 1694-1708 bp - 2293 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 70882327-70885245(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GCAATCATTACAAAT
SmilChr02G003023 Chr02 NC_080388.1:50913020-50913034promoter 内 1358-1372 bp - 2629 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 50915663-50918547(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATCATCATTATGATC
SmilChr01G004228 Chr01 NC_080387.1:60660086-60660100promoter 内 1196-1210 bp - 2791 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 60662891-60664457(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTATAATT
SmilChr02G004818 Chr02 NC_080388.1:70316774-70316788promoter 内 915-929 bp - 3072 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 70312072-70313702(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GAATATAATGATTAG
SmilChr01G004227 Chr01 NC_080387.1:60649185-60649199promoter 内 368-382 bp - 3619 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 60643350-60645566(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AATTATAATGATTAT
SmilChr01G005365 Chr01 NC_080387.1:70880020-70880034promoter 内 263-277 bp - 3724 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 70873447-70876296(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATTTGTAATGATTGC
SmilChr01G002988 Chr01 NC_080387.1:48820394-48820408promoter 内 114-128 bp - 3873 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 48814174-48816521(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GATGCTAATGATGAT
SmilChr02G004643 Chr02 NC_080388.1:68871426-68871440promoter 内 3770-3784 bp - 217 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 3 68869654-68871209(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TAAGATAATGATGGC
SmilChr01G000112 Chr01 NC_080387.1:1907917-1907931promoter 内 2851-2865 bp - 1136 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 3 1909067-1909139(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATCATCATTATCCTT
SmilChr02G004991 Chr02 NC_080388.1:71768449-71768463promoter 内 2097-2111 bp + 1890 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 3 71770353-71772475(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GAATGTAATGATTGA
SmilChr02G003523 Chr02 NC_080388.1:56397906-56397920promoter 内 1211-1225 bp - 2776 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 3 56400696-56404506(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CTAATCATTACGTTA
SmilChr03G001564 Chr03 NC_080389.1:19757815-19757829promoter 内 3956-3970 bp + 31 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 19757860-19758912(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AATGATAATGATGAA
SmilChr01G000348 Chr01 NC_080387.1:7153185-7153199promoter 内 3371-3385 bp + 616 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 7151706-7152569(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTCATGATTACTTTG
SmilChr01G000633 Chr01 NC_080387.1:14217180-14217194promoter 内 3276-3290 bp - 711 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 14213891-14216469(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AATGATAATGATGAA
SmilChr01G006114 Chr01 NC_080387.1:76670373-76670387promoter 内 3204-3218 bp + 783 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 76671170-76671983(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ACAAGTAATGATGAT
SmilChr01G000011 Chr01 NC_080387.1:243663-243677promoter 内 2839-2853 bp + 1148 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 242443-242515(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATCATCATTATCCTT
SmilChr03G001385 Chr03 NC_080389.1:16371883-16371897promoter 内 2590-2604 bp + 1397 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 16373294-16374594(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GATGATAATGATTAA
SmilChr02G005068 Chr02 NC_080388.1:72346475-72346489promoter 内 2509-2523 bp - 1478 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 72342434-72344997(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTGAGTAATGATGAT
SmilChr01G004146 Chr01 NC_080387.1:59981660-59981674promoter 内 1780-1794 bp + 2207 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 59983881-59989552(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAGGGTAATGATTGT
SmilChr03G001386 Chr03 NC_080389.1:16371883-16371897promoter 内 992-1006 bp + 2995 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 16374892-16384279(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GATGATAATGATTAA
SmilChr01G001579 Chr01 NC_080387.1:29812946-29812960promoter 内 3391-3405 bp + 596 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 29813556-29813750(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GATGATAATGATTAA
SmilChr03G002318 Chr03 NC_080389.1:36536402-36536416promoter 内 3366-3380 bp + 621 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 36537037-36545350(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAAAATAATGATTAG
SmilChr01G000299 Chr01 NC_080387.1:5890775-5890789promoter 内 3290-3304 bp + 697 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 5891486-5897014(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GGAAATAATGATGAT
SmilChr02G003351 Chr02 NC_080388.1:54697623-54697637promoter 内 3236-3250 bp - 751 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 54692523-54696872(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TATCATAATGATTAC
SmilChr02G000652 Chr02 NC_080388.1:9869780-9869794promoter 内 3130-3144 bp + 857 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 9870651-9875685(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CAATGTGATGATTAC
SmilChr02G004157 Chr02 NC_080388.1:63893998-63894012promoter 内 3063-3077 bp + 924 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 63888779-63893074(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GCCATCATTATTTCC
SmilChr01G004946 Chr01 NC_080387.1:67560340-67560354promoter 内 2283-2297 bp + 1704 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 67555120-67558636(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATCATCATTAGTTTC
SmilChr02G002935 Chr02 NC_080388.1:49848012-49848026promoter 内 2262-2276 bp - 1725 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 49845838-49846287(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GCAAGTAATGATTAT
SmilChr03G000222 Chr03 NC_080389.1:2594132-2594146promoter 内 1299-1313 bp - 2688 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 2596834-2607793(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATTACACTT
SmilChr02G000526 Chr02 NC_080388.1:7241138-7241152promoter 内 3331-3345 bp + 656 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 4 7241808-7243071(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAATATGATGATTAC
SmilChr01G001584 Chr01 NC_080387.1:29863735-29863749promoter 内 3205-3219 bp + 782 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 3 29864531-29866855(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AGTGATAATGATGAT
SmilChr03G000358 Chr03 NC_080389.1:4020981-4020995promoter 内 2452-2466 bp - 1535 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 3 4018307-4019446(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TGATGTAATGATTAT
SmilChr01G001414 Chr01 NC_080387.1:27732287-27732301promoter 内 2301-2315 bp + 1686 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 3 27727711-27730601(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATTGCATTT
SmilChr01G002746 Chr01 NC_080387.1:45769632-45769646promoter 内 3878-3892 bp - 109 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 45769755-45771498(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTCATCATTAGATCT
SmilChr03G002505 Chr03 NC_080389.1:39903037-39903051promoter 内 3610-3624 bp + 377 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 39900186-39902660(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATTGCATTT
SmilChr03G002394 Chr03 NC_080389.1:37895667-37895681promoter 内 3068-3082 bp + 919 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 37891304-37894748(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTCATCATTACGTTA
SmilChr02G004638 Chr02 NC_080388.1:68829209-68829223promoter 内 2114-2128 bp - 1873 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 68831096-68836022(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATTACAATA
SmilChr02G003413 Chr02 NC_080388.1:55306864-55306878promoter 内 2030-2044 bp - 1957 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 55292135-55304907(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AATAGCAATGATTAA
SmilChr03G001600 Chr03 NC_080389.1:20336831-20336845promoter 内 1937-1951 bp + 2050 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 20332193-20334781(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CTAATCATTACTAAT
SmilChr01G000529 Chr01 NC_080387.1:10835144-10835158promoter 内 1929-1943 bp - 2058 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 10832980-10833086(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AATTATAATGATGAG
SmilChr02G000051 Chr02 NC_080388.1:691146-691160promoter 内 1775-1789 bp - 2212 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 693372-694268(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTCATCATTATTTTT
SmilChr01G004639 Chr01 NC_080387.1:64429394-64429408promoter 内 1117-1131 bp - 2870 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 64425773-64426524(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAAAATAATGATGAA
SmilChr01G002641 Chr01 NC_080387.1:44688310-44688324promoter 内 1010-1024 bp + 2977 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 44691301-44691387(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ACATGTAATGATGAT
SmilChr01G001178 Chr01 NC_080387.1:23832869-23832883promoter 内 632-646 bp + 3355 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 23827198-23829514(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTACATCA
SmilChr01G001186 Chr01 NC_080387.1:23988898-23988912promoter 内 405-419 bp - 3582 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 23982661-23985316(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GGAGATAATGATGAG
SmilChr01G001220 Chr01 NC_080387.1:24473896-24473910promoter 内 238-252 bp + 3749 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 24477659-24478409(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GCCAGTAATGATGAC
SmilChr03G002254 Chr03 NC_080389.1:35466649-35466663promoter 内 199-213 bp - 3788 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 35470451-35472772(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TCAATCATTACTTTT