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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G000949; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003681-RA_Salv SmilChr02G000949 bZIP XP_057795176.1 MP00318 TGCCACGTCAGCATT

可能结合的靶基因

9413 个结合位点 6849 个候选靶基因 第 114 / 137 下载 TSV

上一页 114 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G003069 Chr01 NC_080387.1:49535571-49535585promoter 内 829-843 bp - 3158 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 49531191-49532413(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTGTCGCCC
SmilChr06G000662 Chr06 NC_080392.1:5819308-5819322promoter 内 828-842 bp + 3159 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 5815402-5816149(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 ATTCTCCACGTGGCA
SmilChr04G001167 Chr04 NC_080390.1:17394103-17394117promoter 内 711-725 bp - 3276 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 17383563-17390827(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTGGAGAAT
SmilChr02G002016 Chr02 NC_080388.1:36317829-36317843promoter 内 698-712 bp + 3289 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 36313282-36314540(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 ATTCTCCACGTGGCA
SmilChr04G001075 Chr04 NC_080390.1:15431285-15431299promoter 内 673-687 bp + 3314 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 15426527-15427971(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TCATGACACGTGGCC
SmilChr05G001925 Chr05 NC_080391.1:19528338-19528352promoter 内 626-640 bp + 3361 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 19521808-19524977(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGTCAACACGTGGCA
SmilChr05G000455 Chr05 NC_080391.1:3449945-3449959promoter 内 599-613 bp - 3388 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 3445812-3446557(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CTCCACGTCACTTTC
SmilChr01G002878 Chr01 NC_080387.1:47377620-47377634promoter 内 515-529 bp + 3472 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 47381106-47389482(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTAGTAGTA
SmilChr07G001715 Chr07 NC_080393.1:14567771-14567785promoter 内 490-504 bp + 3497 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 14571282-14573545(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGCCACGTGTCATGA
SmilChr01G000458 Chr01 NC_080387.1:9353407-9353421promoter 内 479-493 bp + 3508 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 9347293-9349899(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 ATTCTCCACGTGGCA
SmilChr02G004629 Chr02 NC_080388.1:68768175-68768189promoter 内 433-447 bp - 3554 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 68771743-68772625(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TCACCTTACGTGGCA
SmilChr03G001440 Chr03 NC_080389.1:17113530-17113544promoter 内 428-442 bp + 3559 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 17117103-17118739(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTGGAGAAT
SmilChr03G000777 Chr03 NC_080389.1:8860862-8860876promoter 内 408-422 bp - 3579 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 8856531-8857283(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGCCACGTAGGATCG
SmilChr03G000682 Chr03 NC_080389.1:7630357-7630371promoter 内 371-385 bp + 3616 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 7625512-7626741(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTTAGACACGTGGCG
SmilChr01G000553 Chr01 NC_080387.1:11513339-11513353promoter 内 322-336 bp + 3665 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 11505769-11509674(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGAATTCACGTGGCA
SmilChr03G002759 Chr03 NC_080389.1:43878709-43878723promoter 内 321-335 bp - 3666 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 43872477-43875043(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTGGTGTAT
SmilChr07G002672 Chr07 NC_080393.1:26011116-26011130promoter 内 275-289 bp - 3712 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 26003144-26007404(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CTCCACGTCACTTCC
SmilChr06G001024 Chr06 NC_080392.1:10148292-10148306promoter 内 269-283 bp + 3718 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 10139991-10144574(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 ATTCTCCACGTGGCA
SmilChr06G001331 Chr06 NC_080392.1:13819481-13819495promoter 内 262-276 bp - 3725 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 13809811-13815756(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTCCACGTCGAATTC
SmilChr03G002747 Chr03 NC_080389.1:43667237-43667251promoter 内 260-274 bp - 3727 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 43660956-43663510(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTGGTGTAT
SmilChr04G001372 Chr04 NC_080390.1:22312275-22312289promoter 内 257-271 bp - 3730 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 22316019-22316921(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GAGCGACACGTGGCG
SmilChr05G001929 Chr05 NC_080391.1:19625019-19625033promoter 内 248-262 bp + 3739 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 19616563-19621280(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 ATTCTCCACGTGGCA
SmilChr06G000713 Chr06 NC_080392.1:6462322-6462336promoter 内 147-161 bp + 3840 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 6446400-6458482(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AATTGAGACGTGGAG
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SmilChr03G002307 Chr03 NC_080389.1:36319497-36319511promoter 内 111-125 bp - 3876 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 36323387-36324470(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 ATTCTCCACGTGGCA
SmilChr05G000709 Chr05 NC_080391.1:5353722-5353736promoter 内 51-65 bp + 3936 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 5348171-5349786(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 ACACGACACGTGGCA
SmilChr04G001758 Chr04 NC_080390.1:28902467-28902481promoter 内 29-43 bp + 3958 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 28895038-28898509(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GATTTTGACGTGGAG
SmilChr05G003038 Chr05 NC_080391.1:38129481-38129495promoter 内 3436-3450 bp + 551 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 2 38130046-38135401(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGACACGTCAAAACT
SmilChr08G001413 Chr08 NC_080394.1:11319751-11319765promoter 内 3218-3232 bp + 769 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 2 11317648-11318982(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 ATTAATTACGTGGCA
SmilChr06G001690 Chr06 NC_080392.1:19260254-19260268promoter 内 2964-2978 bp - 1023 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 2 19261291-19278693(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 ATTAATTACGTGGCA
SmilChr04G003100 Chr04 NC_080390.1:47598390-47598404promoter 内 2272-2286 bp - 1715 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 2 47590595-47596675(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGGCTAAT
SmilChr08G004284 Chr08 NC_080394.1:52488614-52488628promoter 内 1330-1344 bp - 2657 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 2 52482008-52485957(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGACACGTCAGACTA
SmilChr03G000853 Chr03 NC_080389.1:9763200-9763214promoter 内 910-924 bp - 3077 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 2 9757011-9760123(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTCCACGTCTCATAA
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SmilChr07G001110 Chr07 NC_080393.1:8189792-8189806promoter 内 144-158 bp - 3843 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 2 8193649-8196702(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CAAACCTACGTGGCA
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SmilChr03G004674 Chr03 NC_080389.1:64176825-64176839promoter 内 3932-3946 bp + 55 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 64176894-64183309(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTCCACGTCTGACCG
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SmilChr01G005539 Chr01 NC_080387.1:72225886-72225900promoter 内 3743-3757 bp + 244 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 72226144-72227093(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TCCCACGTCAGCGGC
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SmilChr03G000171 Chr03 NC_080389.1:1880748-1880762promoter 内 3651-3665 bp + 336 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 1876652-1880412(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AAAGGCGACGTGGGA
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SmilChr01G001581 Chr01 NC_080387.1:29824717-29824731promoter 内 3287-3301 bp - 700 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 29825431-29831603(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CTAAGTGACGTGGCT
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SmilChr08G000358 Chr08 NC_080394.1:2463354-2463368promoter 内 3214-3228 bp - 773 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 2457131-2462581(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGACACGTCAGACAT