转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 128 / 143 下载 TSV

上一页 128 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G005374 Chr01 NC_080387.1:70967626-70967637promoter 内 3599-3610 bp - 391 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 70968028-70970769(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTAGCTGTCTG
SmilChr07G001761 Chr07 NC_080393.1:14912257-14912268promoter 内 3595-3606 bp - 395 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 14910093-14911862(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTGCC
SmilChr02G002146 Chr02 NC_080388.1:38605640-38605651promoter 内 3591-3602 bp + 399 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 38595015-38605241(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAACTGTCAA
SmilChr01G001839 Chr01 NC_080387.1:33323059-33323070promoter 内 3588-3599 bp - 402 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 33323472-33324897(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGAGCTGTCAA
SmilChr03G002392 Chr03 NC_080389.1:37868530-37868541promoter 内 3543-3554 bp + 447 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 37867241-37868083(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGAGCTGTCAA
SmilChr07G004225 Chr07 NC_080393.1:54488126-54488137promoter 内 3540-3551 bp - 450 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 54488587-54489278(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTATG
SmilChr04G001325 Chr04 NC_080390.1:21336977-21336988promoter 内 3423-3434 bp + 567 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 21337555-21343464(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATAACAGCTGAT
SmilChr03G001887 Chr03 NC_080389.1:26316046-26316057promoter 内 3200-3211 bp - 790 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 26316847-26319373(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGTGG
SmilChr01G005770 Chr01 NC_080387.1:73773899-73773910promoter 内 3028-3039 bp - 962 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 73774872-73777998(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTGCTC
SmilChr02G001240 Chr02 NC_080388.1:22787824-22787835promoter 内 2991-3002 bp - 999 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 22785038-22786825(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTCTT
SmilChr05G003071 Chr05 NC_080391.1:38642136-38642147promoter 内 2941-2952 bp - 1049 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 38643196-38646042(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAACTGTCAA
SmilChr03G000179 Chr03 NC_080389.1:1922371-1922382promoter 内 2932-2943 bp - 1058 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 1923440-2552598(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAGCTGTTAG
SmilChr05G001702 Chr05 NC_080391.1:16223481-16223492promoter 内 2609-2620 bp + 1381 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 16219132-16222100(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAACTGTCAA
SmilChr06G001162 Chr06 NC_080392.1:11810521-11810532promoter 内 2572-2583 bp - 1418 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 11811950-11813174(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGAGCTGTCAA
SmilChr01G004378 Chr01 NC_080387.1:61981577-61981588promoter 内 2552-2563 bp + 1438 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 61977416-61980139(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGAGCTGTCAA
SmilChr04G003174 Chr04 NC_080390.1:48424443-48424454promoter 内 2504-2515 bp - 1486 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 48417993-48422957(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTATC
SmilChr04G002359 Chr04 NC_080390.1:38084118-38084129promoter 内 2477-2488 bp + 1513 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 38085642-38088567(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCACCAGCTGTG
SmilChr05G001838 Chr05 NC_080391.1:18410257-18410268promoter 内 2353-2364 bp - 1637 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 18403456-18408620(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTCTT
SmilChr07G000750 Chr07 NC_080393.1:5285717-5285728promoter 内 2275-2286 bp - 1715 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 5280137-5284002(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CATACAGCTGAA
SmilChr04G003268 Chr04 NC_080390.1:49390555-49390566promoter 内 2173-2184 bp - 1817 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 49385416-49388738(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTCTT
SmilChr08G000210 Chr08 NC_080394.1:1439491-1439502promoter 内 2144-2155 bp + 1846 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 1434927-1437645(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAGCTGTTAG
SmilChr01G000612 Chr01 NC_080387.1:13517875-13517886promoter 内 2004-2015 bp - 1986 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 13514420-13515889(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCACCAGCTGTG
SmilChr08G003545 Chr08 NC_080394.1:38084681-38084692promoter 内 1974-1985 bp - 2016 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 38086708-38088663(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGAGCTGTCAA
SmilChr02G000023 Chr02 NC_080388.1:244290-244301promoter 内 1941-1952 bp + 2049 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 196026-242241(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGAGCTGTCAA
SmilChr01G001838 Chr01 NC_080387.1:33323059-33323070promoter 内 1912-1923 bp - 2078 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 33316125-33320981(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCCC
SmilChr08G001859 Chr08 NC_080394.1:15967480-15967491promoter 内 1898-1909 bp - 2092 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 15969583-15971355(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAACTGTCAA
SmilChr03G004128 Chr03 NC_080389.1:60104359-60104370promoter 内 1783-1794 bp - 2207 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 60106577-60115463(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTGCGG
SmilChr01G003799 Chr01 NC_080387.1:56375533-56375544promoter 内 1719-1730 bp + 2271 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 56370038-56373262(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAACTGTCAA
SmilChr02G003261 Chr02 NC_080388.1:53898397-53898408promoter 内 1664-1675 bp - 2326 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 53900734-53908580(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTAGCTGTCTG
SmilChr07G002267 Chr07 NC_080393.1:20879495-20879506promoter 内 1641-1652 bp + 2349 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 20881855-20885018(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTATC
SmilChr06G000571 Chr06 NC_080392.1:4882918-4882929promoter 内 1578-1589 bp + 2412 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 4876436-4880506(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGCAGCTGTCCC
SmilChr06G001232 Chr06 NC_080392.1:12719777-12719788promoter 内 1571-1582 bp + 2419 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 12712686-12717358(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTTAT
SmilChr01G002282 Chr01 NC_080387.1:39611305-39611316promoter 内 1504-1515 bp + 2486 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 39607158-39608819(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAACTGTCAA
SmilChr07G001480 Chr07 NC_080393.1:11646644-11646655promoter 内 1503-1514 bp + 2487 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 11649142-11650744(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CATACAGCTGAA
SmilChr03G004679 Chr03 NC_080389.1:64221698-64221709promoter 内 1415-1426 bp + 2575 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 64224284-64225913(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CATACAGCTGAA
SmilChr07G003306 Chr07 NC_080393.1:35054904-35054915promoter 内 1393-1404 bp - 2597 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 35057512-35059042(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAACTGTCAA
SmilChr01G001604 Chr01 NC_080387.1:30207550-30207561promoter 内 1361-1372 bp - 2629 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 30200381-30204921(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCCC
SmilChr02G004422 Chr02 NC_080388.1:66549050-66549061promoter 内 1333-1344 bp + 2657 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 66551718-66553390(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTATC
SmilChr05G000320 Chr05 NC_080391.1:2405007-2405018promoter 内 1129-1140 bp + 2861 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 2398726-2402146(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGTGG
SmilChr04G000168 Chr04 NC_080390.1:1500305-1500316promoter 内 992-1003 bp + 2998 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 1503314-1505191(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTCTT
SmilChr01G005420 Chr01 NC_080387.1:71405154-71405165promoter 内 963-974 bp + 3027 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 71399457-71402127(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGTGG
SmilChr07G000254 Chr07 NC_080393.1:1627450-1627461promoter 内 956-967 bp + 3034 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 1622984-1624416(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAACTGTCAA
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SmilChr04G000440 Chr04 NC_080390.1:4672841-4672852promoter 内 832-843 bp - 3158 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 4667808-4669683(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTCTT
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SmilChr04G003932 Chr04 NC_080390.1:54968942-54968953promoter 内 632-643 bp + 3358 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 54962216-54965584(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTATG
SmilChr03G004677 Chr03 NC_080389.1:64221698-64221709promoter 内 590-601 bp + 3400 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 64214903-64218298(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTATG
SmilChr05G000204 Chr05 NC_080391.1:1626084-1626095promoter 内 532-543 bp + 3458 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 1615800-1622626(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGAGCTGTCAA